MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG_M

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020288	TTCC	2	8	630	637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020288	GCCT	2	8	1843	1850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020288	TTGG	2	8	2728	2735	0 %	50 %	50 %	0 %	451816491
4	NC_020288	CTGC	2	8	3129	3136	0 %	25 %	25 %	50 %	451816492
5	NC_020288	TTGC	2	8	4885	4892	0 %	50 %	25 %	25 %	451816496
6	NC_020288	ATTG	2	8	5514	5521	25 %	50 %	25 %	0 %	451816496
7	NC_020288	TTCC	2	8	5933	5940	0 %	50 %	0 %	50 %	451816496
8	NC_020288	AGTC	2	8	7662	7669	25 %	25 %	25 %	25 %	451816499
9	NC_020288	CTAA	2	8	8736	8743	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020288	CCCT	2	8	9088	9095	0 %	25 %	0 %	75 %	451816501
11	NC_020288	TCGT	2	8	9574	9581	0 %	50 %	25 %	25 %	451816502
12	NC_020288	TATT	2	8	9676	9683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020288	GAAG	2	8	9760	9767	50 %	0 %	50 %	0 %	451816503
14	NC_020288	ACTT	2	8	9982	9989	25 %	50 %	0 %	25 %	451816504
15	NC_020288	TGTT	2	8	10868	10875	0 %	75 %	25 %	0 %	451816505
16	NC_020288	GAAG	2	8	11090	11097	50 %	0 %	50 %	0 %	451816506
17	NC_020288	GACA	2	8	11223	11230	50 %	0 %	25 %	25 %	451816506
18	NC_020288	CCAT	2	8	11814	11821	25 %	25 %	0 %	50 %	451816506
19	NC_020288	ACAG	2	8	12163	12170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020288	GGAA	2	8	12281	12288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020288	AAAG	2	8	12688	12695	75 %	0 %	25 %	0 %	451816507
22	NC_020288	AGGT	2	8	13796	13803	25 %	25 %	50 %	0 %	451816508
23	NC_020288	TGGT	2	8	14103	14110	0 %	50 %	50 %	0 %	451816508
24	NC_020288	TAGC	2	8	14161	14168	25 %	25 %	25 %	25 %	451816508
25	NC_020288	AACC	2	8	14255	14262	50 %	0 %	0 %	50 %	451816508
26	NC_020288	TTCT	2	8	14398	14405	0 %	75 %	0 %	25 %	451816508
27	NC_020288	TGAG	2	8	15240	15247	25 %	25 %	50 %	0 %	451816508
28	NC_020288	CCTC	2	8	15401	15408	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_020288	ACAA	2	8	15529	15536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020288	TAAG	2	8	15680	15687	50 %	25 %	25 %	0 %	451816509
31	NC_020288	TCTT	2	8	15888	15895	0 %	75 %	0 %	25 %	451816509
32	NC_020288	GTTG	2	8	17719	17726	0 %	50 %	50 %	0 %	451816510
33	NC_020288	CTAG	2	8	19304	19311	25 %	25 %	25 %	25 %	451816511
34	NC_020288	AAGC	2	8	19942	19949	50 %	0 %	25 %	25 %	451816513
35	NC_020288	GCTG	2	8	20405	20412	0 %	25 %	50 %	25 %	451816513
36	NC_020288	GGTT	2	8	20817	20824	0 %	50 %	50 %	0 %	451816513
37	NC_020288	CCAA	2	8	22007	22014	50 %	0 %	0 %	50 %	451816515
38	NC_020288	CAGC	2	8	22293	22300	25 %	0 %	25 %	50 %	451816515
39	NC_020288	TAGT	2	8	22353	22360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020288	CTAA	2	8	22442	22449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020288	GTTG	2	8	22748	22755	0 %	50 %	50 %	0 %	451816516
42	NC_020288	GTTG	2	8	22820	22827	0 %	50 %	50 %	0 %	451816516
43	NC_020288	CATT	2	8	22900	22907	25 %	50 %	0 %	25 %	451816516
44	NC_020288	ACCC	2	8	23106	23113	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_020288	GGAA	2	8	23481	23488	50 %	0 %	50 %	0 %	451816517
46	NC_020288	GTAA	2	8	23643	23650	50 %	25 %	25 %	0 %	451816517
47	NC_020288	AAGC	2	8	23700	23707	50 %	0 %	25 %	25 %	451816517
48	NC_020288	TGAC	2	8	23859	23866	25 %	25 %	25 %	25 %	451816517
49	NC_020288	CTTA	2	8	24119	24126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020288	ATGG	2	8	24661	24668	25 %	25 %	50 %	0 %	451816519
51	NC_020288	GGAT	2	8	25311	25318	25 %	25 %	50 %	0 %	451816520
52	NC_020288	AATA	2	8	26083	26090	75 %	25 %	0 %	0 %	451816520
53	NC_020288	TTTA	2	8	26304	26311	25 %	75 %	0 %	0 %	451816520
54	NC_020288	CGAT	2	8	26799	26806	25 %	25 %	25 %	25 %	451816520
55	NC_020288	TTGG	2	8	26822	26829	0 %	50 %	50 %	0 %	451816520
56	NC_020288	CGAT	2	8	26897	26904	25 %	25 %	25 %	25 %	451816520
57	NC_020288	TCAG	2	8	27113	27120	25 %	25 %	25 %	25 %	451816520
58	NC_020288	GCAT	2	8	28916	28923	25 %	25 %	25 %	25 %	451816523
59	NC_020288	CCTA	2	8	32000	32007	25 %	25 %	0 %	50 %	451816527
60	NC_020288	TAAT	2	8	32021	32028	50 %	50 %	0 %	0 %	451816527
61	NC_020288	ACGG	2	8	33062	33069	25 %	0 %	50 %	25 %	451816528
62	NC_020288	GATC	2	8	33387	33394	25 %	25 %	25 %	25 %	451816528
63	NC_020288	ATTT	2	8	33809	33816	25 %	75 %	0 %	0 %	451816528
64	NC_020288	CTGG	2	8	33930	33937	0 %	25 %	50 %	25 %	451816528
65	NC_020288	GGTA	2	8	34341	34348	25 %	25 %	50 %	0 %	451816528
66	NC_020288	CTGG	2	8	35166	35173	0 %	25 %	50 %	25 %	451816528
67	NC_020288	ACCA	2	8	35285	35292	50 %	0 %	0 %	50 %	451816528
68	NC_020288	GAAT	2	8	36272	36279	50 %	25 %	25 %	0 %	451816528
69	NC_020288	AATT	2	8	37015	37022	50 %	50 %	0 %	0 %	451816529
70	NC_020288	CTAC	2	8	37089	37096	25 %	25 %	0 %	50 %	451816529
71	NC_020288	GATA	2	8	37709	37716	50 %	25 %	25 %	0 %	451816530
72	NC_020288	TGAT	2	8	38176	38183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020288	ATTT	2	8	38309	38316	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020288	ACAG	2	8	38369	38376	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020288	CAAG	2	8	38381	38388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020288	GAGG	2	8	38790	38797	25 %	0 %	75 %	0 %	451816532
77	NC_020288	TTTC	2	8	39091	39098	0 %	75 %	0 %	25 %	451816533
78	NC_020288	GACA	2	8	39727	39734	50 %	0 %	25 %	25 %	451816534
79	NC_020288	GAAA	2	8	41373	41380	75 %	0 %	25 %	0 %	451816535
80	NC_020288	CCCT	2	8	41673	41680	0 %	25 %	0 %	75 %	451816536
81	NC_020288	AAAC	2	8	41948	41955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020288	CTAT	2	8	42261	42268	25 %	50 %	0 %	25 %	451816538
83	NC_020288	AGGC	2	8	42339	42346	25 %	0 %	50 %	25 %	451816538
84	NC_020288	CAAG	2	8	42735	42742	50 %	0 %	25 %	25 %	451816538
85	NC_020288	GGTC	2	8	44079	44086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.