MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG_M

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020288	ACT	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020288	CGA	2	6	78	83	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020288	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020288	CCA	2	6	188	193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_020288	CCA	2	6	231	236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020288	TCT	2	6	246	251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020288	TGG	2	6	266	271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020288	GCG	2	6	283	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020288	TCC	2	6	329	334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_020288	CCT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_020288	TCT	2	6	593	598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020288	AGG	2	6	621	626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020288	GGC	2	6	652	657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020288	CCT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020288	GTG	2	6	767	772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020288	ATG	2	6	773	778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020288	GAT	2	6	913	918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020288	TGA	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020288	CAC	2	6	1069	1074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020288	CTT	2	6	1111	1116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020288	TCC	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020288	CTT	2	6	1197	1202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020288	GGA	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020288	CGT	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020288	TTG	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020288	TGA	2	6	1479	1484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020288	TGT	2	6	1554	1559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020288	CCT	2	6	2972	2977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_020288	TCC	2	6	6610	6615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_020288	CTT	2	6	6627	6632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020288	TTC	2	6	8339	8344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020288	GGC	2	6	8404	8409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020288	CGC	2	6	8425	8430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_020288	TGC	2	6	8651	8656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020288	GTT	2	6	8749	8754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020288	ACA	2	6	9631	9636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020288	CAA	2	6	9695	9700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020288	CAT	2	6	10380	10385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020288	GAA	2	6	11911	11916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020288	TTC	2	6	11954	11959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020288	TCA	2	6	11990	11995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020288	AGA	2	6	12026	12031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020288	CTA	2	6	12066	12071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020288	TTC	2	6	12124	12129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020288	TCT	2	6	12194	12199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020288	TCA	2	6	12251	12256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020288	AGC	2	6	12308	12313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020288	CAA	2	6	12320	12325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020288	ACT	2	6	12380	12385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020288	GAA	2	6	12448	12453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020288	CAA	2	6	12556	12561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020288	ACA	2	6	12607	12612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020288	AAG	2	6	13163	13168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020288	AGA	2	6	13220	13225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020288	ACG	3	9	13240	13248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020288	AGA	2	6	13457	13462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020288	GAA	2	6	13636	13641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020288	GGT	2	6	13668	13673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020288	AAG	2	6	15321	15326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020288	AGG	2	6	17345	17350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020288	AAC	2	6	17380	17385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020288	GTT	2	6	19716	19721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020288	GGC	2	6	19767	19772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020288	TTC	2	6	19788	19793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020288	TGG	2	6	19827	19832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020288	CTG	2	6	21285	21290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020288	AGG	2	6	21584	21589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020288	CTT	2	6	21775	21780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020288	TCA	2	6	22332	22337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020288	TTG	2	6	22420	22425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020288	CGC	2	6	23065	23070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_020288	GCA	2	6	23094	23099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020288	CCA	2	6	23124	23129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_020288	GTC	2	6	23172	23177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020288	GCA	2	6	24286	24291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020288	CTT	2	6	25000	25005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020288	TGA	2	6	28476	28481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020288	AAT	2	6	32638	32643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020288	GTA	2	6	32686	32691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020288	CTC	2	6	36504	36509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020288	AAT	2	6	36510	36515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020288	ACA	2	6	36581	36586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020288	GGT	2	6	36630	36635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020288	TGT	2	6	36740	36745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020288	ACT	2	6	36844	36849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020288	AGC	2	6	37159	37164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020288	AAT	2	6	37194	37199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020288	GAA	2	6	37217	37222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020288	CTA	2	6	37226	37231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020288	TCA	2	6	37235	37240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020288	CCG	2	6	37288	37293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_020288	GCA	2	6	38072	38077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020288	AAG	2	6	38089	38094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020288	GTA	2	6	38150	38155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020288	ACT	2	6	41923	41928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020288	TGA	2	6	41939	41944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020288	CTG	2	6	42915	42920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020288	CAT	2	6	42956	42961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020288	TAC	2	6	43031	43036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020288	TCG	2	6	43135	43140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020288	AAT	2	6	43227	43232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020288	AAC	2	6	43379	43384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020288	CAA	2	6	43399	43404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020288	ATC	2	6	43409	43414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020288	GCA	2	6	43427	43432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020288	GTT	2	6	43462	43467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020288	CCG	2	6	43494	43499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_020288	CGA	2	6	43532	43537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020288	TGA	2	6	43590	43595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020288	CGG	2	6	43641	43646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020288	CTT	2	6	43764	43769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020288	GGC	2	6	43936	43941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020288	TGG	2	6	44036	44041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020288	TTG	2	6	44072	44077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020288	CGA	2	6	44301	44306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.