MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	CTGTTT	2	12	679	690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020287	CTTGGT	2	12	2059	2070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020287	TTTCAA	2	12	5474	5485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451816683
4	NC_020287	AGAATT	2	12	8812	8823	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451816685
5	NC_020287	ATTCTG	2	12	11906	11917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451816686
6	NC_020287	CATATT	2	12	13786	13797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451816688
7	NC_020287	GGAAAT	2	12	14302	14313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816689
8	NC_020287	CTATTA	2	12	21759	21770	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451816696
9	NC_020287	GTCATT	2	12	24715	24726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451816699
10	NC_020287	CTGTCC	2	12	25470	25481	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	451816700
11	NC_020287	GACAAC	2	12	30905	30916	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	451816708
12	NC_020287	GGAATT	2	12	31360	31371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816708
13	NC_020287	CGAATA	2	12	33989	34000	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451816710
14	NC_020287	CACAGA	2	12	38305	38316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	451816718
15	NC_020287	GCGAGG	2	12	39854	39865	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	451816720
16	NC_020287	TAGGGA	2	12	40130	40141	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020287	AGCATT	2	12	40167	40178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020287	TGGCAG	2	12	40730	40741	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451816721
19	NC_020287	AAGGTC	2	12	43499	43510	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816726
20	NC_020287	TGACTA	2	12	45806	45817	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816728
21	NC_020287	CAAGAG	2	12	46961	46972	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	451816730
22	NC_020287	CCATTA	2	12	54302	54313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816735
23	NC_020287	TAATAC	2	12	55445	55456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451816736
24	NC_020287	AATTTA	2	12	55717	55728	50 %	50 %	0 %	0 %	451816736
25	NC_020287	AAGGCT	2	12	56564	56575	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816737
26	NC_020287	ATTTTT	2	12	57205	57216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451816737
27	NC_020287	CCTTTA	2	12	57491	57502	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	451816737
28	NC_020287	ATGGTT	2	12	58475	58486	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451816737
29	NC_020287	GTTAGC	2	12	58527	58538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451816738
30	NC_020287	TTAATG	2	12	64165	64176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451816744
31	NC_020287	TCCCTA	2	12	73036	73047	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451816751
32	NC_020287	CCCGTT	2	12	75333	75344	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	451816753
33	NC_020287	CCATCC	2	12	83566	83577	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	451816761
34	NC_020287	GTCTAA	2	12	87178	87189	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816764
35	NC_020287	AGGCAT	2	12	95136	95147	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816771
36	NC_020287	TGACCC	2	12	95858	95869	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451816771
37	NC_020287	GAAAAT	2	12	98498	98509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.