MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	AAAAT	2	10	2145	2154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020287	TTTGC	2	10	5262	5271	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020287	TTTAG	2	10	17621	17630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020287	ATTAG	2	10	17839	17848	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020287	CAAGC	2	10	23254	23263	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_020287	CAAGC	2	10	23284	23293	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_020287	TTTGT	2	10	23896	23905	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020287	CTGCA	2	10	27483	27492	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020287	ACAAT	2	10	29200	29209	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020287	CCCAG	2	10	37216	37225	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_020287	CCTGC	2	10	37233	37242	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_020287	CTCTG	2	10	40151	40160	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020287	TCTCT	2	10	42023	42032	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_020287	TGAGT	2	10	67459	67468	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020287	GGATC	2	10	68132	68141	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020287	ACTCT	2	10	88159	88168	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_020287	ATTAA	2	10	88596	88605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020287	GTCTC	2	10	88923	88932	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020287	CGCTT	2	10	89039	89048	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020287	TGAAT	2	10	90433	90442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020287	AGGGG	2	10	93691	93700	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020287	CACCG	2	10	94561	94570	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_020287	TAACT	2	10	94595	94604	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020287	CCAAA	2	10	100501	100510	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.