MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	TCTT	2	8	1024	1031	0 %	75 %	0 %	25 %	451816676
2	NC_020287	CTTC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	451816676
3	NC_020287	CAAA	2	8	1426	1433	75 %	0 %	0 %	25 %	451816677
4	NC_020287	ATCA	2	8	1798	1805	50 %	25 %	0 %	25 %	451816677
5	NC_020287	CCCG	2	8	1968	1975	0 %	0 %	25 %	75 %	451816678
6	NC_020287	TGCC	2	8	2109	2116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020287	TGAA	2	8	2396	2403	50 %	25 %	25 %	0 %	451816679
8	NC_020287	GGCA	2	8	2418	2425	25 %	0 %	50 %	25 %	451816679
9	NC_020287	TATC	2	8	4274	4281	25 %	50 %	0 %	25 %	451816682
10	NC_020287	GCAA	2	8	4439	4446	50 %	0 %	25 %	25 %	451816682
11	NC_020287	AGGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	451816682
12	NC_020287	ATTA	2	8	5508	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	451816683
13	NC_020287	TAAA	2	8	6006	6013	75 %	25 %	0 %	0 %	451816683
14	NC_020287	CAAA	2	8	6294	6301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020287	CTGC	2	8	6613	6620	0 %	25 %	25 %	50 %	451816684
16	NC_020287	CAAT	2	8	8312	8319	50 %	25 %	0 %	25 %	451816684
17	NC_020287	ATTT	2	8	8665	8672	25 %	75 %	0 %	0 %	451816685
18	NC_020287	TACT	2	8	9144	9151	25 %	50 %	0 %	25 %	451816685
19	NC_020287	ATTT	2	8	9377	9384	25 %	75 %	0 %	0 %	451816685
20	NC_020287	TTCC	2	8	10287	10294	0 %	50 %	0 %	50 %	451816685
21	NC_020287	TATC	2	8	10324	10331	25 %	50 %	0 %	25 %	451816685
22	NC_020287	AATT	2	8	11178	11185	50 %	50 %	0 %	0 %	451816685
23	NC_020287	AACT	2	8	11453	11460	50 %	25 %	0 %	25 %	451816685
24	NC_020287	AAAC	2	8	11722	11729	75 %	0 %	0 %	25 %	451816686
25	NC_020287	TTGG	2	8	12178	12185	0 %	50 %	50 %	0 %	451816686
26	NC_020287	TAAA	2	8	12320	12327	75 %	25 %	0 %	0 %	451816686
27	NC_020287	TGTT	2	8	12523	12530	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020287	GTAG	2	8	13067	13074	25 %	25 %	50 %	0 %	451816687
29	NC_020287	TTTA	2	8	13300	13307	25 %	75 %	0 %	0 %	451816687
30	NC_020287	TAAT	2	8	13432	13439	50 %	50 %	0 %	0 %	451816687
31	NC_020287	GGGT	2	8	14092	14099	0 %	25 %	75 %	0 %	451816688
32	NC_020287	ACTT	2	8	14101	14108	25 %	50 %	0 %	25 %	451816688
33	NC_020287	CTTA	2	8	14244	14251	25 %	50 %	0 %	25 %	451816689
34	NC_020287	CAAT	2	8	15154	15161	50 %	25 %	0 %	25 %	451816690
35	NC_020287	GAGT	2	8	15655	15662	25 %	25 %	50 %	0 %	451816690
36	NC_020287	TACC	2	8	15691	15698	25 %	25 %	0 %	50 %	451816690
37	NC_020287	GTTT	2	8	15874	15881	0 %	75 %	25 %	0 %	451816691
38	NC_020287	GTCA	2	8	15938	15945	25 %	25 %	25 %	25 %	451816691
39	NC_020287	AGAA	2	8	16658	16665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020287	AGCA	2	8	17023	17030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020287	AGCA	2	8	17095	17102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020287	TCCC	2	8	17369	17376	0 %	25 %	0 %	75 %	451816692
43	NC_020287	GAAA	2	8	18433	18440	75 %	0 %	25 %	0 %	451816694
44	NC_020287	GTTT	2	8	18494	18501	0 %	75 %	25 %	0 %	451816694
45	NC_020287	AAAC	2	8	20135	20142	75 %	0 %	0 %	25 %	451816695
46	NC_020287	ATTT	2	8	20254	20261	25 %	75 %	0 %	0 %	451816695
47	NC_020287	ACAA	2	8	20437	20444	75 %	0 %	0 %	25 %	451816695
48	NC_020287	GGAG	2	8	20699	20706	25 %	0 %	75 %	0 %	451816695
49	NC_020287	CTTC	2	8	20874	20881	0 %	50 %	0 %	50 %	451816695
50	NC_020287	TTGG	2	8	20962	20969	0 %	50 %	50 %	0 %	451816695
51	NC_020287	AAAG	2	8	21524	21531	75 %	0 %	25 %	0 %	451816695
52	NC_020287	CTTT	2	8	22956	22963	0 %	75 %	0 %	25 %	451816698
53	NC_020287	CTCA	2	8	24277	24284	25 %	25 %	0 %	50 %	451816699
54	NC_020287	GGTA	2	8	25090	25097	25 %	25 %	50 %	0 %	451816699
55	NC_020287	CACT	2	8	25342	25349	25 %	25 %	0 %	50 %	451816700
56	NC_020287	GGAA	2	8	25673	25680	50 %	0 %	50 %	0 %	451816700
57	NC_020287	ACCC	2	8	25869	25876	25 %	0 %	0 %	75 %	451816700
58	NC_020287	AAAG	2	8	26266	26273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020287	AATT	2	8	26586	26593	50 %	50 %	0 %	0 %	451816701
60	NC_020287	TAAG	2	8	26742	26749	50 %	25 %	25 %	0 %	451816701
61	NC_020287	AATG	2	8	27335	27342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020287	CAAA	2	8	28242	28249	75 %	0 %	0 %	25 %	451816703
63	NC_020287	ACAA	2	8	28408	28415	75 %	0 %	0 %	25 %	451816704
64	NC_020287	CATT	2	8	28430	28437	25 %	50 %	0 %	25 %	451816704
65	NC_020287	CCAC	2	8	28889	28896	25 %	0 %	0 %	75 %	451816705
66	NC_020287	TAGA	2	8	29799	29806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020287	ATTC	2	8	29828	29835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020287	ACCA	2	8	29999	30006	50 %	0 %	0 %	50 %	451816707
69	NC_020287	ATCT	2	8	30086	30093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020287	CTCC	2	8	30157	30164	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_020287	CACC	2	8	31300	31307	25 %	0 %	0 %	75 %	451816708
72	NC_020287	CTGT	2	8	32064	32071	0 %	50 %	25 %	25 %	451816708
73	NC_020287	CTCC	2	8	32206	32213	0 %	25 %	0 %	75 %	451816708
74	NC_020287	CAAA	2	8	32707	32714	75 %	0 %	0 %	25 %	451816708
75	NC_020287	TCAA	2	8	32886	32893	50 %	25 %	0 %	25 %	451816708
76	NC_020287	GAAG	2	8	33426	33433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020287	CCCA	2	8	34506	34513	25 %	0 %	0 %	75 %	451816712
78	NC_020287	GTTG	2	8	34640	34647	0 %	50 %	50 %	0 %	451816712
79	NC_020287	TCCT	2	8	34648	34655	0 %	50 %	0 %	50 %	451816712
80	NC_020287	GATG	2	8	34813	34820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020287	TTCT	2	8	35131	35138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020287	GTAA	2	8	35494	35501	50 %	25 %	25 %	0 %	451816714
83	NC_020287	TTTC	2	8	35640	35647	0 %	75 %	0 %	25 %	451816714
84	NC_020287	TGGC	2	8	35989	35996	0 %	25 %	50 %	25 %	451816715
85	NC_020287	CATT	2	8	37843	37850	25 %	50 %	0 %	25 %	451816717
86	NC_020287	CCAA	2	8	37946	37953	50 %	0 %	0 %	50 %	451816717
87	NC_020287	AGGT	2	8	38096	38103	25 %	25 %	50 %	0 %	451816717
88	NC_020287	TGAT	2	8	38852	38859	25 %	50 %	25 %	0 %	451816718
89	NC_020287	TGAC	2	8	39023	39030	25 %	25 %	25 %	25 %	451816719
90	NC_020287	AGCA	2	8	39233	39240	50 %	0 %	25 %	25 %	451816719
91	NC_020287	AGAA	2	8	39263	39270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020287	GCTA	2	8	41332	41339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020287	GATA	2	8	41589	41596	50 %	25 %	25 %	0 %	451816722
94	NC_020287	TCCC	2	8	41841	41848	0 %	25 %	0 %	75 %	451816723
95	NC_020287	ACTA	2	8	41849	41856	50 %	25 %	0 %	25 %	451816723
96	NC_020287	GGAG	2	8	41961	41968	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020287	TAAG	2	8	42081	42088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020287	TAGG	2	8	42582	42589	25 %	25 %	50 %	0 %	451816724
99	NC_020287	ATTG	2	8	42648	42655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020287	AGGG	2	8	43203	43210	25 %	0 %	75 %	0 %	451816725
101	NC_020287	AATT	2	8	43478	43485	50 %	50 %	0 %	0 %	451816726
102	NC_020287	ATGT	2	8	43608	43615	25 %	50 %	25 %	0 %	451816726
103	NC_020287	GGGA	2	8	44302	44309	25 %	0 %	75 %	0 %	451816727
104	NC_020287	CTCC	2	8	44374	44381	0 %	25 %	0 %	75 %	451816727
105	NC_020287	GGCG	2	8	44499	44506	0 %	0 %	75 %	25 %	451816727
106	NC_020287	ATTT	2	8	44546	44553	25 %	75 %	0 %	0 %	451816727
107	NC_020287	TCTT	2	8	46320	46327	0 %	75 %	0 %	25 %	451816729
108	NC_020287	AGTT	2	8	47046	47053	25 %	50 %	25 %	0 %	451816731
109	NC_020287	TGAT	2	8	47177	47184	25 %	50 %	25 %	0 %	451816731
110	NC_020287	GTTG	2	8	47897	47904	0 %	50 %	50 %	0 %	451816731
111	NC_020287	CCAA	2	8	47987	47994	50 %	0 %	0 %	50 %	451816731
112	NC_020287	TAAT	2	8	49071	49078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020287	ATTT	2	8	49125	49132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020287	ACTG	2	8	49441	49448	25 %	25 %	25 %	25 %	451816732
115	NC_020287	CCTA	2	8	49612	49619	25 %	25 %	0 %	50 %	451816732
116	NC_020287	AGAA	2	8	49734	49741	75 %	0 %	25 %	0 %	451816732
117	NC_020287	AGTG	2	8	50077	50084	25 %	25 %	50 %	0 %	451816732
118	NC_020287	CAAA	2	8	50351	50358	75 %	0 %	0 %	25 %	451816732
119	NC_020287	GTGG	2	8	50578	50585	0 %	25 %	75 %	0 %	451816733
120	NC_020287	CATT	2	8	50903	50910	25 %	50 %	0 %	25 %	451816733
121	NC_020287	ATTG	2	8	51147	51154	25 %	50 %	25 %	0 %	451816733
122	NC_020287	GATT	2	8	51516	51523	25 %	50 %	25 %	0 %	451816733
123	NC_020287	GTCT	2	8	51945	51952	0 %	50 %	25 %	25 %	451816734
124	NC_020287	TTGA	2	8	52521	52528	25 %	50 %	25 %	0 %	451816734
125	NC_020287	TAAT	2	8	52832	52839	50 %	50 %	0 %	0 %	451816734
126	NC_020287	TCGT	2	8	52908	52915	0 %	50 %	25 %	25 %	451816734
127	NC_020287	CATA	2	8	53192	53199	50 %	25 %	0 %	25 %	451816734
128	NC_020287	GAAG	2	8	53698	53705	50 %	0 %	50 %	0 %	451816734
129	NC_020287	TTAA	2	8	54011	54018	50 %	50 %	0 %	0 %	451816735
130	NC_020287	GCCA	2	8	54162	54169	25 %	0 %	25 %	50 %	451816735
131	NC_020287	AACT	2	8	54406	54413	50 %	25 %	0 %	25 %	451816735
132	NC_020287	TGAC	2	8	54724	54731	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
133	NC_020287	GATT	2	8	55226	55233	25 %	50 %	25 %	0 %	451816736
134	NC_020287	ATCG	2	8	55386	55393	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
135	NC_020287	GGTA	2	8	55475	55482	25 %	25 %	50 %	0 %	451816736
136	NC_020287	CGAT	2	8	55789	55796	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
137	NC_020287	CCCT	2	8	55804	55811	0 %	25 %	0 %	75 %	451816736
138	NC_020287	AGCT	2	8	55868	55875	25 %	25 %	25 %	25 %	451816736
139	NC_020287	CCAC	2	8	56041	56048	25 %	0 %	0 %	75 %	451816736
140	NC_020287	AATT	2	8	57369	57376	50 %	50 %	0 %	0 %	451816737
141	NC_020287	CAAA	3	12	57528	57539	75 %	0 %	0 %	25 %	451816737
142	NC_020287	ATTT	2	8	57810	57817	25 %	75 %	0 %	0 %	451816737
143	NC_020287	TCTT	2	8	58085	58092	0 %	75 %	0 %	25 %	451816737
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.