MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	TGCC	2	8	2109	2116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020287	CAAA	2	8	6294	6301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020287	TGTT	2	8	12523	12530	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020287	AGAA	2	8	16658	16665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020287	AGCA	2	8	17023	17030	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020287	AGCA	2	8	17095	17102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020287	AAAG	2	8	26266	26273	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020287	AATG	2	8	27335	27342	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020287	TAGA	2	8	29799	29806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020287	ATTC	2	8	29828	29835	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020287	ATCT	2	8	30086	30093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020287	CTCC	2	8	30157	30164	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_020287	GAAG	2	8	33426	33433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020287	GATG	2	8	34813	34820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020287	TTCT	2	8	35131	35138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020287	AGAA	2	8	39263	39270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020287	GCTA	2	8	41332	41339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020287	GGAG	2	8	41961	41968	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020287	TAAG	2	8	42081	42088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020287	ATTG	2	8	42648	42655	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020287	TAAT	2	8	49071	49078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020287	ATTT	2	8	49125	49132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020287	TTTA	2	8	65643	65650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020287	TGCT	2	8	65936	65943	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020287	CTAG	2	8	68282	68289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020287	GCCA	2	8	68947	68954	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020287	TTGT	2	8	69302	69309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020287	GGTA	2	8	72190	72197	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020287	CTTT	2	8	79498	79505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020287	ATTG	2	8	87570	87577	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020287	ATTG	2	8	87642	87649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020287	GAAG	2	8	87679	87686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020287	ATTG	2	8	87714	87721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020287	ATTG	2	8	87785	87792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020287	ATTG	2	8	87857	87864	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020287	ATTG	2	8	87932	87939	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020287	TCTT	2	8	87973	87980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020287	ATTG	2	8	88004	88011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020287	ATTG	2	8	88075	88082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020287	ATTG	2	8	88148	88155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020287	ATTG	2	8	88221	88228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020287	ATTG	2	8	88293	88300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020287	ATTG	2	8	88366	88373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020287	ATTG	2	8	88437	88444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020287	GTTA	2	8	88460	88467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020287	ATTG	2	8	88509	88516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020287	ATTG	2	8	88581	88588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020287	ATTG	2	8	88658	88665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020287	ATTG	2	8	88729	88736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020287	ATTG	2	8	88804	88811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020287	ATTG	2	8	88877	88884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020287	ATTG	2	8	88951	88958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020287	ATTG	2	8	89027	89034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020287	ATTG	2	8	89102	89109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020287	ATTG	2	8	89173	89180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020287	ATTG	2	8	89246	89253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020287	ATTG	2	8	89322	89329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020287	ATTG	2	8	89397	89404	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020287	ATTG	2	8	89472	89479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020287	ATTG	2	8	89554	89561	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020287	ATTG	2	8	89629	89636	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020287	TAAT	2	8	89666	89673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020287	ATTG	2	8	89701	89708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020287	ATTG	2	8	89776	89783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020287	ATTG	2	8	89854	89861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020287	ATTG	2	8	89931	89938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020287	ATTG	2	8	90002	90009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020287	ATTG	2	8	90085	90092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020287	CAGC	2	8	90108	90115	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020287	ATTG	2	8	90158	90165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020287	ATTG	2	8	90233	90240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020287	ATTG	2	8	90312	90319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020287	ATTG	2	8	90388	90395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020287	AAAT	2	8	92803	92810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020287	TCTT	2	8	94403	94410	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020287	AGAA	2	8	97621	97628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020287	AATT	2	8	99221	99228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020287	CTAT	2	8	99891	99898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020287	TAAC	2	8	99916	99923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.