MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816675
2	NC_020287	TTA	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816675
3	NC_020287	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816675
4	NC_020287	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816675
5	NC_020287	CTT	3	9	382	390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816675
6	NC_020287	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816675
7	NC_020287	TCA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816675
8	NC_020287	CCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816676
9	NC_020287	ACT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816676
10	NC_020287	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816676
11	NC_020287	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
12	NC_020287	TGT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816676
13	NC_020287	TAT	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
14	NC_020287	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
15	NC_020287	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816676
16	NC_020287	TCT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816676
17	NC_020287	ATT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816677
18	NC_020287	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816677
19	NC_020287	CTC	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816677
20	NC_020287	TTG	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816677
21	NC_020287	CGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816677
22	NC_020287	TAA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816677
23	NC_020287	CCA	3	9	1987	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816678
24	NC_020287	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816678
25	NC_020287	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816679
26	NC_020287	TGA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816679
27	NC_020287	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816679
28	NC_020287	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816679
29	NC_020287	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816679
30	NC_020287	GAT	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816679
31	NC_020287	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816679
32	NC_020287	CTA	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816680
33	NC_020287	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816680
34	NC_020287	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816680
35	NC_020287	AAG	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816680
36	NC_020287	TGT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816680
37	NC_020287	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816680
38	NC_020287	TTG	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816680
39	NC_020287	ATT	3	9	3370	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816681
40	NC_020287	CGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816681
41	NC_020287	ATC	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816681
42	NC_020287	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816681
43	NC_020287	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816681
44	NC_020287	TAG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816681
45	NC_020287	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
46	NC_020287	GAG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816682
47	NC_020287	GAG	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816682
48	NC_020287	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
49	NC_020287	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816682
50	NC_020287	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
51	NC_020287	AGA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816682
52	NC_020287	AAT	2	6	4820	4825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
53	NC_020287	TGA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
54	NC_020287	AAG	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816682
55	NC_020287	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816682
56	NC_020287	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
57	NC_020287	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816683
58	NC_020287	CTC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816683
59	NC_020287	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816683
60	NC_020287	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816683
61	NC_020287	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816683
62	NC_020287	CTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816683
63	NC_020287	CAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816683
64	NC_020287	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816684
65	NC_020287	TAG	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
66	NC_020287	CAG	3	9	6700	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816684
67	NC_020287	ATC	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816684
68	NC_020287	ATT	2	6	6816	6821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816684
69	NC_020287	TGA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
70	NC_020287	GCG	2	6	7000	7005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816684
71	NC_020287	ATT	2	6	7297	7302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816684
72	NC_020287	AGT	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
73	NC_020287	GTC	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816684
74	NC_020287	AGA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816684
75	NC_020287	CAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816684
76	NC_020287	TGG	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816684
77	NC_020287	TCT	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816684
78	NC_020287	AGC	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816684
79	NC_020287	AGA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816684
80	NC_020287	GTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816684
81	NC_020287	AAT	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816684
82	NC_020287	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
83	NC_020287	CCA	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816684
84	NC_020287	ACA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
85	NC_020287	CTT	2	6	8540	8545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816685
86	NC_020287	GAA	2	6	8627	8632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816685
87	NC_020287	GGT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816685
88	NC_020287	AAC	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
89	NC_020287	ATA	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816685
90	NC_020287	ACA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
91	NC_020287	ATC	2	6	9126	9131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816685
92	NC_020287	CTA	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816685
93	NC_020287	ACC	2	6	9264	9269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816685
94	NC_020287	ACA	2	6	9281	9286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
95	NC_020287	CTG	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816685
96	NC_020287	TTA	2	6	9539	9544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816685
97	NC_020287	CAA	2	6	9595	9600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
98	NC_020287	GGA	2	6	9805	9810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816685
99	NC_020287	GAA	2	6	9953	9958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816685
100	NC_020287	AAC	2	6	10107	10112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
101	NC_020287	TAA	2	6	10195	10200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816685
102	NC_020287	AGG	2	6	10210	10215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816685
103	NC_020287	CAA	2	6	10310	10315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
104	NC_020287	AGT	2	6	10360	10365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816685
105	NC_020287	CAA	3	9	10435	10443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
106	NC_020287	AGA	2	6	10528	10533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816685
107	NC_020287	TTG	2	6	10631	10636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816685
108	NC_020287	GCC	2	6	10823	10828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816685
109	NC_020287	GTA	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816685
110	NC_020287	TCC	2	6	10837	10842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816685
111	NC_020287	AGG	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816685
112	NC_020287	GAG	2	6	11171	11176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816685
113	NC_020287	ATT	2	6	11246	11251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816685
114	NC_020287	TCC	2	6	11370	11375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816685
115	NC_020287	AAC	2	6	11379	11384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
116	NC_020287	CAA	2	6	11441	11446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
117	NC_020287	CTT	2	6	11555	11560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816686
118	NC_020287	AAG	2	6	12383	12388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816686
119	NC_020287	ATG	2	6	12407	12412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816686
120	NC_020287	CAA	2	6	12445	12450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816686
121	NC_020287	TGG	2	6	12486	12491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816686
122	NC_020287	AAG	3	9	12493	12501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816686
123	NC_020287	ATT	2	6	12809	12814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816687
124	NC_020287	GCT	2	6	12968	12973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816687
125	NC_020287	TAT	2	6	12983	12988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816687
126	NC_020287	TGG	2	6	13006	13011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816687
127	NC_020287	TCT	2	6	13145	13150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816687
128	NC_020287	ATC	2	6	13221	13226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816687
129	NC_020287	CAA	2	6	13256	13261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816687
130	NC_020287	GTT	2	6	13280	13285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816687
131	NC_020287	ATT	2	6	13329	13334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816687
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