MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020287	CA	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	451816675
3	NC_020287	AT	3	6	599	604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020287	AT	3	6	1133	1138	50 %	50 %	0 %	0 %	451816676
5	NC_020287	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	451816680
6	NC_020287	TC	3	6	3890	3895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020287	AT	3	6	4419	4424	50 %	50 %	0 %	0 %	451816682
8	NC_020287	AG	3	6	4885	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	451816682
9	NC_020287	TG	3	6	5205	5210	0 %	50 %	50 %	0 %	451816682
10	NC_020287	GA	3	6	6034	6039	50 %	0 %	50 %	0 %	451816683
11	NC_020287	CT	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	451816684
12	NC_020287	AG	3	6	7092	7097	50 %	0 %	50 %	0 %	451816684
13	NC_020287	AT	3	6	8946	8951	50 %	50 %	0 %	0 %	451816685
14	NC_020287	CT	3	6	12644	12649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020287	GA	3	6	12732	12737	50 %	0 %	50 %	0 %	451816687
16	NC_020287	TG	3	6	14535	14540	0 %	50 %	50 %	0 %	451816689
17	NC_020287	GT	3	6	15919	15924	0 %	50 %	50 %	0 %	451816691
18	NC_020287	AT	3	6	16860	16865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020287	AT	3	6	17767	17772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020287	AT	4	8	20338	20345	50 %	50 %	0 %	0 %	451816695
21	NC_020287	GA	3	6	20414	20419	50 %	0 %	50 %	0 %	451816695
22	NC_020287	AT	3	6	20512	20517	50 %	50 %	0 %	0 %	451816695
23	NC_020287	AT	3	6	20741	20746	50 %	50 %	0 %	0 %	451816695
24	NC_020287	CT	3	6	21456	21461	0 %	50 %	0 %	50 %	451816695
25	NC_020287	GA	3	6	21874	21879	50 %	0 %	50 %	0 %	451816696
26	NC_020287	AT	3	6	22038	22043	50 %	50 %	0 %	0 %	451816696
27	NC_020287	AG	3	6	27355	27360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020287	TC	4	8	27752	27759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020287	GA	3	6	29880	29885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020287	TG	3	6	31401	31406	0 %	50 %	50 %	0 %	451816708
31	NC_020287	TC	3	6	32365	32370	0 %	50 %	0 %	50 %	451816708
32	NC_020287	AT	3	6	35420	35425	50 %	50 %	0 %	0 %	451816714
33	NC_020287	GC	3	6	35972	35977	0 %	0 %	50 %	50 %	451816715
34	NC_020287	AG	3	6	37462	37467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020287	AG	3	6	37818	37823	50 %	0 %	50 %	0 %	451816716
36	NC_020287	GA	3	6	38315	38320	50 %	0 %	50 %	0 %	451816718
37	NC_020287	AG	3	6	40276	40281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020287	AG	4	8	40424	40431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020287	GA	3	6	40588	40593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020287	TA	3	6	42640	42645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020287	TA	3	6	42662	42667	50 %	50 %	0 %	0 %	451816725
42	NC_020287	CT	4	8	43616	43623	0 %	50 %	0 %	50 %	451816726
43	NC_020287	CT	3	6	43625	43630	0 %	50 %	0 %	50 %	451816726
44	NC_020287	GA	3	6	44065	44070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020287	TA	3	6	44607	44612	50 %	50 %	0 %	0 %	451816727
46	NC_020287	GC	3	6	44903	44908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020287	AG	3	6	45603	45608	50 %	0 %	50 %	0 %	451816728
48	NC_020287	TG	3	6	46371	46376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020287	AG	3	6	51223	51228	50 %	0 %	50 %	0 %	451816733
50	NC_020287	CA	3	6	55655	55660	50 %	0 %	0 %	50 %	451816736
51	NC_020287	TC	3	6	57943	57948	0 %	50 %	0 %	50 %	451816737
52	NC_020287	TC	3	6	58616	58621	0 %	50 %	0 %	50 %	451816738
53	NC_020287	AT	3	6	59419	59424	50 %	50 %	0 %	0 %	451816738
54	NC_020287	CT	3	6	61417	61422	0 %	50 %	0 %	50 %	451816739
55	NC_020287	AG	3	6	61455	61460	50 %	0 %	50 %	0 %	451816739
56	NC_020287	CA	3	6	64503	64508	50 %	0 %	0 %	50 %	451816745
57	NC_020287	AC	3	6	65621	65626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020287	CT	3	6	68043	68048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020287	TC	3	6	70581	70586	0 %	50 %	0 %	50 %	451816748
60	NC_020287	GT	3	6	72959	72964	0 %	50 %	50 %	0 %	451816751
61	NC_020287	GA	3	6	74548	74553	50 %	0 %	50 %	0 %	451816752
62	NC_020287	CT	3	6	75118	75123	0 %	50 %	0 %	50 %	451816753
63	NC_020287	GA	3	6	77678	77683	50 %	0 %	50 %	0 %	451816756
64	NC_020287	TC	3	6	77783	77788	0 %	50 %	0 %	50 %	451816756
65	NC_020287	GA	3	6	79983	79988	50 %	0 %	50 %	0 %	451816757
66	NC_020287	GA	3	6	80821	80826	50 %	0 %	50 %	0 %	451816758
67	NC_020287	GA	3	6	81264	81269	50 %	0 %	50 %	0 %	451816759
68	NC_020287	CT	3	6	85072	85077	0 %	50 %	0 %	50 %	451816761
69	NC_020287	CT	3	6	86076	86081	0 %	50 %	0 %	50 %	451816763
70	NC_020287	TA	3	6	97672	97677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020287	GA	3	6	98171	98176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020287	TA	3	6	98262	98267	50 %	50 %	0 %	0 %	451816775
73	NC_020287	AT	3	6	98301	98306	50 %	50 %	0 %	0 %	451816775
74	NC_020287	AC	3	6	99427	99432	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.