MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	451816675
2	NC_020287	T	7	7	672	678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020287	T	6	6	715	720	0 %	100 %	0 %	0 %	451816676
4	NC_020287	T	6	6	1168	1173	0 %	100 %	0 %	0 %	451816676
5	NC_020287	T	6	6	1248	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	451816676
6	NC_020287	A	6	6	1735	1740	100 %	0 %	0 %	0 %	451816677
7	NC_020287	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020287	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	451816679
9	NC_020287	G	6	6	2790	2795	0 %	0 %	100 %	0 %	451816679
10	NC_020287	T	6	6	3058	3063	0 %	100 %	0 %	0 %	451816680
11	NC_020287	A	7	7	4183	4189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020287	A	7	7	4445	4451	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
13	NC_020287	A	6	6	4489	4494	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
14	NC_020287	G	6	6	4648	4653	0 %	0 %	100 %	0 %	451816682
15	NC_020287	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
16	NC_020287	A	7	7	5003	5009	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
17	NC_020287	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	451816682
18	NC_020287	G	6	6	5890	5895	0 %	0 %	100 %	0 %	451816683
19	NC_020287	A	6	6	7101	7106	100 %	0 %	0 %	0 %	451816684
20	NC_020287	A	7	7	7277	7283	100 %	0 %	0 %	0 %	451816684
21	NC_020287	A	6	6	7733	7738	100 %	0 %	0 %	0 %	451816684
22	NC_020287	A	6	6	7862	7867	100 %	0 %	0 %	0 %	451816684
23	NC_020287	T	6	6	8183	8188	0 %	100 %	0 %	0 %	451816684
24	NC_020287	T	6	6	8510	8515	0 %	100 %	0 %	0 %	451816684
25	NC_020287	A	7	7	8743	8749	100 %	0 %	0 %	0 %	451816685
26	NC_020287	A	6	6	9249	9254	100 %	0 %	0 %	0 %	451816685
27	NC_020287	A	7	7	9464	9470	100 %	0 %	0 %	0 %	451816685
28	NC_020287	A	7	7	10096	10102	100 %	0 %	0 %	0 %	451816685
29	NC_020287	A	6	6	10572	10577	100 %	0 %	0 %	0 %	451816685
30	NC_020287	T	6	6	10995	11000	0 %	100 %	0 %	0 %	451816685
31	NC_020287	A	6	6	11089	11094	100 %	0 %	0 %	0 %	451816685
32	NC_020287	T	9	9	12649	12657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020287	T	8	8	12717	12724	0 %	100 %	0 %	0 %	451816687
34	NC_020287	T	7	7	12793	12799	0 %	100 %	0 %	0 %	451816687
35	NC_020287	A	7	7	13494	13500	100 %	0 %	0 %	0 %	451816688
36	NC_020287	T	6	6	13675	13680	0 %	100 %	0 %	0 %	451816688
37	NC_020287	A	6	6	14068	14073	100 %	0 %	0 %	0 %	451816688
38	NC_020287	T	7	7	14160	14166	0 %	100 %	0 %	0 %	451816688
39	NC_020287	A	6	6	14492	14497	100 %	0 %	0 %	0 %	451816689
40	NC_020287	A	6	6	14562	14567	100 %	0 %	0 %	0 %	451816689
41	NC_020287	A	7	7	14725	14731	100 %	0 %	0 %	0 %	451816689
42	NC_020287	A	7	7	14776	14782	100 %	0 %	0 %	0 %	451816689
43	NC_020287	A	6	6	14846	14851	100 %	0 %	0 %	0 %	451816690
44	NC_020287	A	6	6	14897	14902	100 %	0 %	0 %	0 %	451816690
45	NC_020287	C	6	6	15344	15349	0 %	0 %	0 %	100 %	451816690
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49	NC_020287	G	7	7	16147	16153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020287	T	6	6	17806	17811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020287	T	7	7	18457	18463	0 %	100 %	0 %	0 %	451816694
52	NC_020287	T	6	6	19966	19971	0 %	100 %	0 %	0 %	451816695
53	NC_020287	T	6	6	20259	20264	0 %	100 %	0 %	0 %	451816695
54	NC_020287	A	6	6	20284	20289	100 %	0 %	0 %	0 %	451816695
55	NC_020287	A	6	6	20447	20452	100 %	0 %	0 %	0 %	451816695
56	NC_020287	A	6	6	20661	20666	100 %	0 %	0 %	0 %	451816695
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68	NC_020287	A	6	6	25141	25146	100 %	0 %	0 %	0 %	451816699
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70	NC_020287	A	6	6	25765	25770	100 %	0 %	0 %	0 %	451816700
71	NC_020287	T	6	6	26209	26214	0 %	100 %	0 %	0 %	451816700
72	NC_020287	A	6	6	26354	26359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020287	A	7	7	26439	26445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.