MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020286	TCAAAA	2	12	42381	42392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020286	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020286	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020286	TTAAAT	2	12	74876	74887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020286	CGTTTA	2	12	120210	120221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020286	TTATAG	2	12	141088	141099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020286	AAGGGT	2	12	153372	153383	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020286	TAGCCC	2	12	172973	172984	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020286	TTAAGT	2	12	182226	182237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020286	GGGAAA	2	12	208451	208462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020286	ACCATT	2	12	260416	260427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020286	TAGGCT	2	12	299439	299450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020286	ATCCCC	2	12	327008	327019	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020286	GTTTTA	2	12	334544	334555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020286	ATGCTA	2	12	335712	335723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020286	GGCAAA	2	12	345299	345310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020286	TCGAAA	2	12	359509	359520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020286	TCAACG	2	12	382935	382946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020286	TGACCA	2	12	450388	450399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020286	TTTGAC	2	12	454562	454573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020286	CCATTG	2	12	454783	454794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020286	GTAACT	2	12	468792	468803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020286	CGGCCC	2	12	484851	484862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_020286	GGTTAT	2	12	491574	491585	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020286	AAAATC	2	12	538586	538597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020286	TTCTCT	2	12	549954	549965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020286	GGTTAG	2	12	565510	565521	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020286	AATGAT	2	12	583097	583108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020286	ATTTTC	2	12	605604	605615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020286	CGGACG	2	12	632801	632812	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020286	CTTGAA	2	12	663269	663280	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020286	TCCGCC	2	12	668159	668170	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020286	TCTTAA	2	12	692167	692178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020286	TTTCCC	2	12	728084	728095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020286	TCCCCC	2	12	755375	755386	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
36	NC_020286	CCTTAC	2	12	762797	762808	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020286	AAAATC	2	12	797337	797348	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020286	AAGTTA	2	12	799677	799688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020286	CTAGGA	2	12	826031	826042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020286	GCTTTA	2	12	843231	843242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020286	GAGGAT	2	12	843742	843753	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020286	CCCCAG	2	12	845574	845585	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020286	CTCTTA	2	12	852955	852966	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020286	GGCAAT	2	12	882854	882865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020286	AGCAAC	2	12	890896	890907	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020286	GGGAAT	2	12	903309	903320	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020286	TCAGTT	2	12	914240	914251	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020286	ATTTTA	2	12	919699	919710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020286	ACACCA	2	12	929680	929691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020286	AGAAAA	2	12	960785	960796	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020286	TTGAGT	2	12	987659	987670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020286	TACTCC	2	12	1025056	1025067	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020286	TATTAA	2	12	1030822	1030833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020286	TTAATT	2	12	1038714	1038725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020286	TTAACT	2	12	1039493	1039504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020286	AGTCCA	2	12	1075515	1075526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020286	TTGGCC	2	12	1116392	1116403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020286	AGAAGC	2	12	1116492	1116503	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020286	TTAGGT	2	12	1165745	1165756	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020286	ACCTCC	2	12	1170144	1170155	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_020286	GCTTAG	2	12	1190164	1190175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020286	TTTCCC	2	12	1196443	1196454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020286	GTTAAG	2	12	1291195	1291206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020286	CTTTGC	2	12	1321063	1321074	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020286	ATCATT	2	12	1324074	1324085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020286	AATTCA	2	12	1332866	1332877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020286	CCATCC	2	12	1345727	1345738	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020286	TTACCA	2	12	1373757	1373768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020286	TAAGAG	2	12	1383264	1383275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020286	AAGGAG	2	12	1421101	1421112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020286	TTCTGC	2	12	1422726	1422737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020286	GTATTT	2	12	1523001	1523012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020286	GGCAAA	2	12	1556850	1556861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020286	TAGCGA	2	12	1566673	1566684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020286	TTTAAC	2	12	1582992	1583003	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020286	GCTCCC	2	12	1585640	1585651	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020286	GCCAAA	2	12	1605269	1605280	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020286	AATTTA	2	12	1605809	1605820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020286	GAATCT	2	12	1646789	1646800	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020286	TAAAAG	2	12	1653692	1653703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020286	CATTAA	2	12	1654315	1654326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020286	CCCAGT	2	12	1667540	1667551	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020286	CATTGA	2	12	1670465	1670476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020286	TCAAAC	2	12	1686661	1686672	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020286	ACTGGG	2	12	1720572	1720583	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020286	ACTCAA	2	12	1784256	1784267	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020286	GGTAAA	2	12	1813792	1813803	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020286	GTTGTA	2	12	1830012	1830023	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020286	CTGTTA	2	12	1832067	1832078	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_020286	TAATGG	2	12	1849085	1849096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020286	AAACGA	2	12	1885456	1885467	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020286	TGGCAA	2	12	1920479	1920490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020286	TTATCT	2	12	1922515	1922526	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020286	ACAGAA	2	12	1971036	1971047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020286	GATTTC	2	12	1978801	1978812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020286	AGTCAA	2	12	2003064	2003075	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020286	CCCCAT	2	12	2011100	2011111	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_020286	GATTTT	2	12	2077505	2077516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020286	ATGGGG	2	12	2131332	2131343	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020286	TGATCG	2	12	2135841	2135852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020286	CTAAAC	2	12	2154681	2154692	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020286	TTTCAT	2	12	2190791	2190802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020286	CCCCTT	2	12	2227722	2227733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020286	ATCGTA	2	12	2259870	2259881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020286	GCAAAA	2	12	2262168	2262179	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_020286	TAGAAA	2	12	2287756	2287767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020286	TTTGCA	2	12	2287860	2287871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020286	AATCCC	2	12	2334313	2334324	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020286	TGGCTC	2	12	2386306	2386317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020286	TTTCTT	2	12	2401821	2401832	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020286	GACCAT	2	12	2420083	2420094	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020286	AGCTCA	2	12	2433663	2433674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020286	AAAAAC	2	12	2445402	2445413	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020286	ATCGCC	2	12	2458568	2458579	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020286	CCATTG	2	12	2553917	2553928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020286	CCATAT	2	12	2558655	2558666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020286	CCCATT	2	12	2596567	2596578	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020286	CTTTCC	2	12	2601853	2601864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020286	TAAATC	2	12	2629366	2629377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020286	TGGGCT	2	12	2643792	2643803	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020286	TCTACC	2	12	2653314	2653325	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020286	GACAGT	2	12	2705365	2705376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020286	CTAGTC	2	12	2767912	2767923	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020286	CCTGAC	2	12	2774678	2774689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020286	AGTAAG	2	12	2790407	2790418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020286	GAATAA	2	12	2828915	2828926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020286	GGAACT	2	12	2829071	2829082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_020286	TAGGGA	2	12	2834978	2834989	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020286	GGCAAA	2	12	2850761	2850772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020286	TCTAAG	2	12	2854725	2854736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020286	GATTGA	2	12	2859676	2859687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020286	ATTTCC	2	12	2882125	2882136	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020286	TAGAGC	2	12	2914775	2914786	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020286	AGACAG	2	12	2938963	2938974	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_020286	TAATTA	2	12	2945434	2945445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020286	TATTCT	2	12	2947961	2947972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_020286	TATAAT	2	12	2951545	2951556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020286	TAGCCC	2	12	2963898	2963909	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020286	TCTGTT	2	12	2995380	2995391	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_020286	TATCAT	2	12	3029551	3029562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_020286	CATAGT	2	12	3041337	3041348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_020286	TTGACA	2	12	3055619	3055630	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_020286	TAAGAG	2	12	3063605	3063616	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_020286	GAAAAT	2	12	3094465	3094476	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020286	ATTTCT	2	12	3101022	3101033	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_020286	TGATAC	2	12	3115626	3115637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_020286	AATCAA	2	12	3185472	3185483	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_020286	CTGGTT	2	12	3191651	3191662	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_020286	TGGGAT	2	12	3266241	3266252	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020286	GCCCTG	2	12	3282271	3282282	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
154	NC_020286	TTGAAC	2	12	3339376	3339387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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156	NC_020286	AATTAA	2	12	3413291	3413302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020286	AGGGGA	2	12	3416447	3416458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020286	TTTAAT	2	12	3419097	3419108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.