MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803

Total Repeats: 1392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020286	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020286	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020286	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_020286	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020286	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020286	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020286	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020286	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020286	CCTA	2	8	13483	13490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020286	ATTG	2	8	14580	14587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020286	TGTT	2	8	14607	14614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020286	TTCA	2	8	17757	17764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020286	TGGG	2	8	17780	17787	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020286	TCTT	2	8	20430	20437	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020286	TTTG	2	8	20568	20575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020286	TAAT	2	8	27865	27872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020286	GGAC	2	8	27913	27920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020286	ATTA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020286	ATTT	2	8	35532	35539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020286	TAAT	2	8	46852	46859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020286	ATAA	2	8	46981	46988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020286	TGGT	2	8	52124	52131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020286	GGTC	2	8	53368	53375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020286	CCCT	2	8	58890	58897	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_020286	GTAT	2	8	59658	59665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020286	ATAC	2	8	59700	59707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020286	CTGG	2	8	60458	60465	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020286	ATTT	2	8	61627	61634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020286	ATTT	2	8	61649	61656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020286	TTAA	2	8	61693	61700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020286	TTAC	2	8	61715	61722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020286	ATTA	2	8	61760	61767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020286	ATTT	2	8	64365	64372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020286	ATGT	2	8	65764	65771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020286	ATCC	2	8	69233	69240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020286	CCCG	2	8	69258	69265	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_020286	TAAT	2	8	77973	77980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020286	CCGA	2	8	78286	78293	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020286	TAAA	2	8	82281	82288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020286	CTAT	2	8	92796	92803	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020286	CCGT	2	8	92809	92816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020286	ATTG	2	8	101869	101876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020286	TAAA	2	8	105117	105124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020286	TAAA	2	8	106563	106570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020286	CTAA	2	8	106807	106814	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020286	ATTA	2	8	106866	106873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020286	GTGG	2	8	106988	106995	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020286	TGGC	2	8	107262	107269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020286	CTAA	2	8	112624	112631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020286	AATT	2	8	114248	114255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020286	AATG	2	8	120088	120095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020286	ATTT	2	8	120143	120150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020286	TTGC	2	8	122017	122024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020286	CTTG	2	8	127077	127084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020286	TAAC	2	8	127111	127118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020286	TTTC	2	8	131091	131098	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020286	AGCC	2	8	132423	132430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020286	TTAT	2	8	134048	134055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020286	GGGC	2	8	134103	134110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020286	GTTA	2	8	134252	134259	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020286	CTGT	2	8	134353	134360	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020286	GATA	2	8	143874	143881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020286	CCTA	2	8	146869	146876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020286	AATT	2	8	153105	153112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020286	AGGG	2	8	153173	153180	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020286	AGAT	2	8	153533	153540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020286	GAAA	2	8	156715	156722	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020286	CAAG	2	8	168172	168179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020286	TAAA	2	8	168236	168243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020286	TAAT	2	8	168273	168280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020286	GGAA	2	8	168445	168452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020286	AATT	2	8	185675	185682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020286	ATTA	2	8	185718	185725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020286	TTGT	2	8	189110	189117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020286	CGGA	2	8	189751	189758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020286	GGAC	2	8	194817	194824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020286	TAAA	2	8	197601	197608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020286	AAGT	2	8	206546	206553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020286	CTAA	2	8	206646	206653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020286	GACA	2	8	210763	210770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020286	CCTG	2	8	211661	211668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020286	ACAA	2	8	215074	215081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020286	AACT	2	8	215254	215261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020286	AGGA	2	8	218379	218386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020286	CAAA	2	8	219192	219199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020286	GATT	2	8	219636	219643	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020286	ATAA	2	8	219788	219795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020286	TTAA	2	8	219954	219961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020286	CCAA	2	8	221535	221542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020286	GAAC	2	8	226781	226788	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020286	TATC	2	8	230628	230635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020286	AGGA	2	8	234220	234227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020286	TTAC	2	8	234259	234266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020286	GGAT	2	8	242224	242231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020286	AGGA	2	8	247028	247035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020286	TAAA	2	8	255722	255729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020286	CTTG	2	8	256441	256448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020286	CTAC	2	8	257310	257317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020286	GATA	2	8	259415	259422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020286	AAGC	2	8	259553	259560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020286	GAGG	2	8	261791	261798	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020286	ACTT	2	8	263993	264000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020286	GAAT	2	8	265392	265399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020286	AGTT	2	8	266642	266649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020286	TACT	2	8	271589	271596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020286	TTTG	2	8	273405	273412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020286	TCCT	2	8	273438	273445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020286	CAAA	2	8	274442	274449	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020286	GGAA	2	8	275694	275701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020286	TTTG	2	8	276361	276368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020286	ATGT	2	8	282838	282845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020286	TCAA	2	8	284491	284498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020286	TATT	2	8	286147	286154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020286	TAAA	2	8	287897	287904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020286	TAAA	2	8	287906	287913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020286	ATTT	2	8	291503	291510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020286	ATTA	2	8	293704	293711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020286	GGTT	2	8	298060	298067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020286	GGTT	2	8	298715	298722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020286	ATTT	2	8	299084	299091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020286	ATTT	2	8	299221	299228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020286	TTTG	2	8	299297	299304	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020286	TAAT	2	8	303670	303677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020286	CTAG	2	8	303679	303686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020286	TTAA	2	8	314224	314231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020286	CTTC	2	8	315111	315118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_020286	ATGA	2	8	316926	316933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020286	CAAT	2	8	316961	316968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020286	ATCC	2	8	316989	316996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020286	TGAA	2	8	317876	317883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020286	CGCC	2	8	318596	318603	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_020286	TTCG	2	8	320610	320617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020286	AGGA	2	8	321486	321493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020286	GGAA	2	8	321529	321536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020286	CCAA	2	8	323744	323751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020286	TTTC	2	8	324803	324810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020286	CCTT	2	8	326120	326127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020286	AGGG	2	8	335655	335662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020286	TAAA	2	8	338459	338466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020286	TAAA	2	8	340978	340985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020286	ATTG	2	8	342781	342788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020286	TCAG	2	8	343694	343701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020286	TAAT	2	8	344728	344735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020286	GCCT	2	8	345423	345430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_020286	TTTA	2	8	347885	347892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020286	AATT	2	8	351508	351515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020286	ATTC	2	8	359642	359649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_020286	AAAT	2	8	359985	359992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020286	AGCA	2	8	363424	363431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_020286	ATTG	2	8	365235	365242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020286	ATTT	2	8	369129	369136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020286	TTAT	2	8	372554	372561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_020286	TCCC	2	8	1142595	1142602	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
446	NC_020286	TTTA	2	8	1147870	1147877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_020286	TTGC	2	8	1148102	1148109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
448	NC_020286	ATTA	2	8	1156638	1156645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_020286	TTAA	2	8	1158641	1158648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_020286	TGGG	2	8	1161018	1161025	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
451	NC_020286	CCTG	2	8	1161086	1161093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
452	NC_020286	GAAA	2	8	1164019	1164026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_020286	GTTA	2	8	1164114	1164121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_020286	AAAG	2	8	1166644	1166651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
455	NC_020286	GGAG	2	8	1167499	1167506	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
456	NC_020286	ACTA	2	8	1180698	1180705	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
457	NC_020286	TGGT	2	8	1181282	1181289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
458	NC_020286	TTTC	2	8	1190394	1190401	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
459	NC_020286	TTCT	2	8	1202679	1202686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
460	NC_020286	AGAT	2	8	1205039	1205046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
461	NC_020286	TAGT	2	8	1206467	1206474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
462	NC_020286	GTTA	2	8	1209695	1209702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
463	NC_020286	AGTT	2	8	1210985	1210992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
464	NC_020286	TAGC	2	8	1212019	1212026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
465	NC_020286	CTTG	2	8	1212078	1212085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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468	NC_020286	TGGT	2	8	1213858	1213865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
469	NC_020286	AAAG	2	8	1220709	1220716	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
470	NC_020286	TGCT	2	8	1224313	1224320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
471	NC_020286	CAGG	2	8	1226434	1226441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
472	NC_020286	CTTT	2	8	1226690	1226697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
473	NC_020286	GAAA	2	8	1230181	1230188	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
474	NC_020286	GATG	2	8	1230716	1230723	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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478	NC_020286	TATT	2	8	1234758	1234765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_020286	ATTA	2	8	1238810	1238817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_020286	TCAT	2	8	1241499	1241506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
481	NC_020286	TTGG	2	8	1241517	1241524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_020286	AACA	2	8	1242900	1242907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_020286	ATTT	2	8	1253153	1253160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_020286	TAGG	2	8	1255310	1255317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
485	NC_020286	GATC	2	8	1266152	1266159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_020286	AGCC	2	8	1271741	1271748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
487	NC_020286	AGAA	2	8	1271813	1271820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_020286	TAAA	2	8	1291849	1291856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_020286	ATCT	2	8	1301508	1301515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
493	NC_020286	GAGC	2	8	1303216	1303223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_020286	TGGT	2	8	1303268	1303275	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
495	NC_020286	TGAG	2	8	1310068	1310075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
496	NC_020286	TTGT	2	8	1311289	1311296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_020286	CAAA	2	8	1313304	1313311	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
498	NC_020286	TAGA	2	8	1324047	1324054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_020286	TGCT	3	12	1330703	1330714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_020286	GGTT	2	8	1330863	1330870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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