MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020285	TATTTT	2	12	27131	27142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020285	TTTAAT	2	12	50747	50758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020285	TTTTAA	2	12	59157	59168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020285	ATATAA	2	12	80076	80087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020285	ATTAAT	2	12	129583	129594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020285	TAAAAT	2	12	134695	134706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020285	TGATAT	2	12	137874	137885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020285	ATTTTT	2	12	161233	161244	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020285	TCGGGG	2	12	169583	169594	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020285	TTGAAA	2	12	193430	193441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020285	TCTATG	2	12	204646	204657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020285	TTGAAA	2	12	229133	229144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020285	ATATAG	2	12	231064	231075	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020285	AATTTT	2	12	236720	236731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020285	ATTTTT	2	12	243450	243461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020285	ACTTAA	2	12	263820	263831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020285	TCTTAT	2	12	270513	270524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020285	GGTTAT	2	12	270765	270776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020285	TTTATT	2	12	271143	271154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020285	AATAAA	2	12	284188	284199	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020285	ATATTA	2	12	384872	384883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020285	AAAATA	2	12	422187	422198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020285	TATAAA	2	12	451888	451899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020285	ATTAAT	4	24	453578	453601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020285	AGTAAC	2	12	516603	516614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020285	AATTAT	2	12	526693	526704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020285	TTATAT	2	12	532168	532179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020285	ACAAAG	2	12	562036	562047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020285	AATTTA	2	12	603286	603297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020285	GCAATA	2	12	603484	603495	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020285	ATTGAT	2	12	604096	604107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020285	TCTGGA	2	12	606259	606270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020285	GCAATA	2	12	609624	609635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020285	TATAAT	2	12	626509	626520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020285	GAATAG	2	12	643458	643469	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020285	AATTTC	2	12	643827	643838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020285	TCGATA	3	18	656740	656757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020285	AAAAAC	2	12	669674	669685	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020285	TAACAC	2	12	692261	692272	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020285	TTCTGT	2	12	699502	699513	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020285	ATATGA	2	12	711362	711373	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020285	CCCCAG	2	12	717315	717326	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_020285	AATTAT	2	12	737030	737041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020285	TTAAAT	2	12	755242	755253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020285	ACAAGA	2	12	762723	762734	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020285	AAAACA	2	12	794364	794375	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.