MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E

Total Repeats: 684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020285	TCTAG	2	10	28	37	20 %	40 %	20 %	20 %	451812605
2	NC_020285	AGGCA	2	10	441	450	40 %	0 %	40 %	20 %	451812605
3	NC_020285	ATGTC	2	10	1782	1791	20 %	40 %	20 %	20 %	451812606
4	NC_020285	TAATT	2	10	2432	2441	40 %	60 %	0 %	0 %	451812606
5	NC_020285	TGCAA	2	10	3397	3406	40 %	20 %	20 %	20 %	451812607
6	NC_020285	GAAAA	2	10	4757	4766	80 %	0 %	20 %	0 %	451812607
7	NC_020285	TTGAT	2	10	8039	8048	20 %	60 %	20 %	0 %	451812609
8	NC_020285	GTATG	2	10	9470	9479	20 %	40 %	40 %	0 %	451812610
9	NC_020285	TACAT	2	10	10537	10546	40 %	40 %	0 %	20 %	451812612
10	NC_020285	TTGAT	2	10	11555	11564	20 %	60 %	20 %	0 %	451812612
11	NC_020285	TAATG	2	10	12242	12251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020285	TTTTA	2	10	12262	12271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020285	AACAT	2	10	12448	12457	60 %	20 %	0 %	20 %	451812613
14	NC_020285	CTGTT	2	10	14628	14637	0 %	60 %	20 %	20 %	451812614
15	NC_020285	AAAAC	2	10	17625	17634	80 %	0 %	0 %	20 %	451812617
16	NC_020285	AAATT	2	10	17739	17748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020285	GTTAT	2	10	18224	18233	20 %	60 %	20 %	0 %	451812618
18	NC_020285	CTTCT	2	10	19035	19044	0 %	60 %	0 %	40 %	451812620
19	NC_020285	CAATA	2	10	19093	19102	60 %	20 %	0 %	20 %	451812620
20	NC_020285	AAATC	2	10	19990	19999	60 %	20 %	0 %	20 %	451812622
21	NC_020285	GTTAA	2	10	20476	20485	40 %	40 %	20 %	0 %	451812622
22	NC_020285	ATTGC	2	10	21967	21976	20 %	40 %	20 %	20 %	451812624
23	NC_020285	ATTCT	2	10	22487	22496	20 %	60 %	0 %	20 %	451812625
24	NC_020285	AAAAT	2	10	22842	22851	80 %	20 %	0 %	0 %	451812626
25	NC_020285	TTATT	2	10	23017	23026	20 %	80 %	0 %	0 %	451812626
26	NC_020285	CTATC	2	10	26346	26355	20 %	40 %	0 %	40 %	451812629
27	NC_020285	TATTT	2	10	26812	26821	20 %	80 %	0 %	0 %	451812629
28	NC_020285	GCAAA	2	10	27179	27188	60 %	0 %	20 %	20 %	451812630
29	NC_020285	TTGAT	2	10	27906	27915	20 %	60 %	20 %	0 %	451812630
30	NC_020285	TTTAA	2	10	27940	27949	40 %	60 %	0 %	0 %	451812630
31	NC_020285	CTTTA	2	10	28539	28548	20 %	60 %	0 %	20 %	451812631
32	NC_020285	TTGCT	2	10	28941	28950	0 %	60 %	20 %	20 %	451812632
33	NC_020285	GATAA	2	10	31339	31348	60 %	20 %	20 %	0 %	451812635
34	NC_020285	ATTTG	2	10	32131	32140	20 %	60 %	20 %	0 %	451812636
35	NC_020285	GTAAT	2	10	34129	34138	40 %	40 %	20 %	0 %	451812638
36	NC_020285	TGCTA	2	10	34451	34460	20 %	40 %	20 %	20 %	451812638
37	NC_020285	AGAAT	2	10	39214	39223	60 %	20 %	20 %	0 %	451812641
38	NC_020285	GTTTT	2	10	40944	40953	0 %	80 %	20 %	0 %	451812642
39	NC_020285	TTTCT	2	10	42014	42023	0 %	80 %	0 %	20 %	451812643
40	NC_020285	TAATC	2	10	43154	43163	40 %	40 %	0 %	20 %	451812645
41	NC_020285	ATATA	2	10	45164	45173	60 %	40 %	0 %	0 %	451812646
42	NC_020285	TCTTA	2	10	45324	45333	20 %	60 %	0 %	20 %	451812646
43	NC_020285	GGATA	2	10	47173	47182	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020285	CATGG	2	10	48381	48390	20 %	20 %	40 %	20 %	451812648
45	NC_020285	TAACT	2	10	49379	49388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020285	AAAAG	2	10	49829	49838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020285	TGGTT	2	10	50628	50637	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020285	TCTTT	2	10	51067	51076	0 %	80 %	0 %	20 %	451812650
49	NC_020285	ATTAA	2	10	51089	51098	60 %	40 %	0 %	0 %	451812650
50	NC_020285	TTTAT	2	10	51712	51721	20 %	80 %	0 %	0 %	451812651
51	NC_020285	AGCAT	2	10	57735	57744	40 %	20 %	20 %	20 %	451812658
52	NC_020285	TGCAG	2	10	57931	57940	20 %	20 %	40 %	20 %	451812658
53	NC_020285	AATAG	2	10	58725	58734	60 %	20 %	20 %	0 %	451812659
54	NC_020285	GAGGT	2	10	61042	61051	20 %	20 %	60 %	0 %	451812660
55	NC_020285	TATGT	2	10	61505	61514	20 %	60 %	20 %	0 %	451812661
56	NC_020285	ATTAA	2	10	64154	64163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020285	GAAAA	2	10	64468	64477	80 %	0 %	20 %	0 %	451812663
58	NC_020285	GTTTG	2	10	64824	64833	0 %	60 %	40 %	0 %	451812663
59	NC_020285	TCTAA	2	10	65107	65116	40 %	40 %	0 %	20 %	451812663
60	NC_020285	TAATA	2	10	65423	65432	60 %	40 %	0 %	0 %	451812664
61	NC_020285	TATTT	2	10	65550	65559	20 %	80 %	0 %	0 %	451812664
62	NC_020285	ATTCT	2	10	67044	67053	20 %	60 %	0 %	20 %	451812666
63	NC_020285	AGAAA	2	10	67359	67368	80 %	0 %	20 %	0 %	451812666
64	NC_020285	TAGTT	2	10	68255	68264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020285	TTTAT	2	10	69057	69066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020285	AGAAT	2	10	70308	70317	60 %	20 %	20 %	0 %	451812669
67	NC_020285	TATTT	2	10	70966	70975	20 %	80 %	0 %	0 %	451812670
68	NC_020285	AATGA	2	10	73876	73885	60 %	20 %	20 %	0 %	451812672
69	NC_020285	TGAGT	2	10	76122	76131	20 %	40 %	40 %	0 %	451812675
70	NC_020285	AAAAT	2	10	80237	80246	80 %	20 %	0 %	0 %	451812678
71	NC_020285	AGTTT	2	10	80975	80984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020285	TTTAT	2	10	83104	83113	20 %	80 %	0 %	0 %	451812680
73	NC_020285	ATAGA	2	10	85776	85785	60 %	20 %	20 %	0 %	451812681
74	NC_020285	AGGAA	2	10	85881	85890	60 %	0 %	40 %	0 %	451812681
75	NC_020285	TGAAT	2	10	88078	88087	40 %	40 %	20 %	0 %	451812683
76	NC_020285	TAGGA	2	10	88651	88660	40 %	20 %	40 %	0 %	451812683
77	NC_020285	TATTT	2	10	88762	88771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020285	TTAGA	2	10	88915	88924	40 %	40 %	20 %	0 %	451812684
79	NC_020285	TATAT	2	10	90876	90885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020285	TTATA	2	10	91163	91172	40 %	60 %	0 %	0 %	451812685
81	NC_020285	GAGTT	2	10	91206	91215	20 %	40 %	40 %	0 %	451812685
82	NC_020285	ATCTT	2	10	91269	91278	20 %	60 %	0 %	20 %	451812685
83	NC_020285	ATTTG	2	10	96734	96743	20 %	60 %	20 %	0 %	451812687
84	NC_020285	ATGGC	2	10	99683	99692	20 %	20 %	40 %	20 %	451812689
85	NC_020285	GCTTA	2	10	100390	100399	20 %	40 %	20 %	20 %	451812689
86	NC_020285	AGATG	2	10	102472	102481	40 %	20 %	40 %	0 %	451812692
87	NC_020285	ATATT	2	10	102593	102602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020285	ATATA	2	10	104183	104192	60 %	40 %	0 %	0 %	451812693
89	NC_020285	TGATT	2	10	104215	104224	20 %	60 %	20 %	0 %	451812693
90	NC_020285	GGAAG	2	10	104945	104954	40 %	0 %	60 %	0 %	451812694
91	NC_020285	TGCTT	2	10	105507	105516	0 %	60 %	20 %	20 %	451812695
92	NC_020285	TATCT	2	10	105690	105699	20 %	60 %	0 %	20 %	451812695
93	NC_020285	TAATA	2	10	106618	106627	60 %	40 %	0 %	0 %	451812696
94	NC_020285	TTTAT	2	10	107866	107875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020285	ATGGA	2	10	108419	108428	40 %	20 %	40 %	0 %	451812698
96	NC_020285	TTATT	2	10	109182	109191	20 %	80 %	0 %	0 %	451812700
97	NC_020285	TAATT	2	10	111473	111482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020285	ATTTG	2	10	114103	114112	20 %	60 %	20 %	0 %	451812705
99	NC_020285	ATGGG	2	10	117388	117397	20 %	20 %	60 %	0 %	451812706
100	NC_020285	ATTGA	2	10	117571	117580	40 %	40 %	20 %	0 %	451812706
101	NC_020285	TAGAA	2	10	118145	118154	60 %	20 %	20 %	0 %	451812707
102	NC_020285	TACAT	2	10	118612	118621	40 %	40 %	0 %	20 %	451812708
103	NC_020285	CATTA	2	10	119194	119203	40 %	40 %	0 %	20 %	451812708
104	NC_020285	TGTCT	2	10	119265	119274	0 %	60 %	20 %	20 %	451812708
105	NC_020285	GCGGA	2	10	122459	122468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020285	CATGC	2	10	122683	122692	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_020285	TATCC	2	10	127028	127037	20 %	40 %	0 %	40 %	451812716
108	NC_020285	TTCTA	2	10	127295	127304	20 %	60 %	0 %	20 %	451812716
109	NC_020285	TAATC	2	10	127394	127403	40 %	40 %	0 %	20 %	451812716
110	NC_020285	ATTTT	2	10	127491	127500	20 %	80 %	0 %	0 %	451812716
111	NC_020285	TGTTA	2	10	129233	129242	20 %	60 %	20 %	0 %	451812717
112	NC_020285	TTCAG	2	10	134817	134826	20 %	40 %	20 %	20 %	451812723
113	NC_020285	TGTCT	2	10	134946	134955	0 %	60 %	20 %	20 %	451812723
114	NC_020285	CAGGT	2	10	138222	138231	20 %	20 %	40 %	20 %	451812725
115	NC_020285	CAAAG	2	10	144155	144164	60 %	0 %	20 %	20 %	451812730
116	NC_020285	GTTTA	2	10	148199	148208	20 %	60 %	20 %	0 %	451812733
117	NC_020285	TTATA	2	10	152204	152213	40 %	60 %	0 %	0 %	451812734
118	NC_020285	TTTTA	2	10	152918	152927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020285	TTGAT	2	10	155049	155058	20 %	60 %	20 %	0 %	451812737
120	NC_020285	TATAT	2	10	155334	155343	40 %	60 %	0 %	0 %	451812737
121	NC_020285	AACAA	2	10	155640	155649	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020285	TTGTT	2	10	155679	155688	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020285	ATTTG	2	10	156015	156024	20 %	60 %	20 %	0 %	451812738
124	NC_020285	GAAAA	2	10	157587	157596	80 %	0 %	20 %	0 %	451812739
125	NC_020285	ATAGG	2	10	159668	159677	40 %	20 %	40 %	0 %	451812740
126	NC_020285	ATACT	2	10	160670	160679	40 %	40 %	0 %	20 %	451812740
127	NC_020285	GAAAT	2	10	160687	160696	60 %	20 %	20 %	0 %	451812740
128	NC_020285	TAAGG	2	10	160917	160926	40 %	20 %	40 %	0 %	451812740
129	NC_020285	GTTTT	2	10	161313	161322	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020285	TGTTT	2	10	161925	161934	0 %	80 %	20 %	0 %	451812742
131	NC_020285	TTTGT	2	10	162174	162183	0 %	80 %	20 %	0 %	451812742
132	NC_020285	AAGAG	2	10	163341	163350	60 %	0 %	40 %	0 %	451812744
133	NC_020285	TTCTT	2	10	166092	166101	0 %	80 %	0 %	20 %	451812746
134	NC_020285	TTTAA	2	10	170713	170722	40 %	60 %	0 %	0 %	451812748
135	NC_020285	TTTTA	2	10	171721	171730	20 %	80 %	0 %	0 %	451812749
136	NC_020285	CTCGT	2	10	173214	173223	0 %	40 %	20 %	40 %	451812749
137	NC_020285	TAATT	2	10	176956	176965	40 %	60 %	0 %	0 %	451812752
138	NC_020285	ATGGT	2	10	177139	177148	20 %	40 %	40 %	0 %	451812753
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142	NC_020285	TCTGT	2	10	185802	185811	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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148	NC_020285	CTCAT	2	10	193013	193022	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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168	NC_020285	TCGTG	2	10	225222	225231	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_020285	CTCAT	2	10	228716	228725	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
170	NC_020285	TTGAT	2	10	229897	229906	20 %	60 %	20 %	0 %	451812787
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250	NC_020285	GATTG	2	10	331726	331735	20 %	40 %	40 %	0 %	451812886
251	NC_020285	ATTAT	2	10	332349	332358	40 %	60 %	0 %	0 %	451812886
252	NC_020285	TGCCT	2	10	332738	332747	0 %	40 %	20 %	40 %	451812887
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254	NC_020285	TCATA	2	10	334825	334834	40 %	40 %	0 %	20 %	451812888
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256	NC_020285	TTCAT	2	10	336608	336617	20 %	60 %	0 %	20 %	451812889
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261	NC_020285	TTATC	2	10	342448	342457	20 %	60 %	0 %	20 %	451812893
262	NC_020285	ATTTA	2	10	342681	342690	40 %	60 %	0 %	0 %	451812893
263	NC_020285	AATGG	2	10	343390	343399	40 %	20 %	40 %	0 %	451812893
264	NC_020285	AAACA	2	10	343512	343521	80 %	0 %	0 %	20 %	451812893
265	NC_020285	TGTTT	2	10	343827	343836	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020285	ATTCA	2	10	345267	345276	40 %	40 %	0 %	20 %	451812895
267	NC_020285	GCAAT	2	10	347336	347345	40 %	20 %	20 %	20 %	451812897
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