MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium blastocrithidii TCC012E

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020285	TAATG	2	10	12242	12251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020285	TTTTA	2	10	12262	12271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020285	AAATT	2	10	17739	17748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020285	GGATA	2	10	47173	47182	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020285	TAACT	2	10	49379	49388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020285	AAAAG	2	10	49829	49838	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020285	TGGTT	2	10	50628	50637	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020285	ATTAA	2	10	64154	64163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020285	TAGTT	2	10	68255	68264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020285	TTTAT	2	10	69057	69066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020285	AGTTT	2	10	80975	80984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020285	TATTT	2	10	88762	88771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020285	TATAT	2	10	90876	90885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020285	ATATT	2	10	102593	102602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020285	TTTAT	2	10	107866	107875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020285	TAATT	2	10	111473	111482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020285	GCGGA	2	10	122459	122468	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020285	CATGC	2	10	122683	122692	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020285	TTTTA	2	10	152918	152927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020285	AACAA	2	10	155640	155649	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020285	TTGTT	2	10	155679	155688	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020285	GTTTT	2	10	161313	161322	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020285	TCTGT	2	10	185802	185811	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020285	ATTTC	2	10	186889	186898	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020285	TCGTG	2	10	189519	189528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020285	CTCAT	2	10	193013	193022	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020285	TATCT	2	10	220242	220251	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020285	TCATT	2	10	220303	220312	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020285	TCGTG	2	10	225222	225231	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020285	CTCAT	2	10	228716	228725	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_020285	TATGT	2	10	233638	233647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020285	CATTT	2	10	240103	240112	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020285	AATTA	2	10	249601	249610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020285	AGTTA	2	10	252371	252380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020285	GATCA	2	10	263437	263446	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020285	CCTTT	2	10	288651	288660	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_020285	ATTTT	2	10	297730	297739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020285	TATTT	3	15	301475	301489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020285	GTTAT	2	10	307825	307834	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020285	TTTTA	2	10	307856	307865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020285	TAATT	2	10	312435	312444	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020285	ATTAA	2	10	322810	322819	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020285	TTAAG	2	10	325079	325088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020285	TGTTT	2	10	343827	343836	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020285	TATTT	2	10	350274	350283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020285	ATAAA	2	10	350308	350317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020285	GCAAT	2	10	353560	353569	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020285	TTTTA	2	10	358822	358831	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020285	ATATT	2	10	364487	364496	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020285	TATAC	2	10	384836	384845	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_020285	TATTT	2	10	385967	385976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020285	TATAA	2	10	411261	411270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020285	TAAAT	2	10	422238	422247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020285	AAATT	2	10	436505	436514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020285	AATCT	2	10	436625	436634	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020285	ATTTA	2	10	438030	438039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020285	ATTTT	2	10	438104	438113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020285	TATAT	2	10	453882	453891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020285	TATCA	2	10	455099	455108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020285	TAAAA	2	10	455653	455662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020285	TAATA	2	10	474693	474702	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020285	TTAAA	2	10	475024	475033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020285	AATCT	2	10	486930	486939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020285	TATAT	2	10	492538	492547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020285	CTTAG	2	10	492587	492596	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020285	ACCTA	2	10	513745	513754	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_020285	TTTCT	2	10	516316	516325	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020285	ATAAA	2	10	524749	524758	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020285	CAAAT	2	10	532018	532027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020285	AATGA	2	10	532054	532063	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020285	AATAA	2	10	532133	532142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020285	CATCA	2	10	534738	534747	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020285	TTTTA	2	10	554925	554934	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020285	TAAAA	2	10	561712	561721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020285	ATTAG	2	10	565675	565684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020285	GATAA	2	10	565710	565719	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020285	TACAA	2	10	586804	586813	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020285	TAGAA	2	10	591701	591710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020285	GAAAT	2	10	591736	591745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020285	AAAAT	2	10	603107	603116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020285	AAACA	2	10	603268	603277	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020285	GTACT	2	10	603522	603531	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020285	TTAAT	2	10	605312	605321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020285	AGAAA	2	10	605572	605581	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020285	CAATA	2	10	606963	606972	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020285	AAATT	2	10	607279	607288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020285	ATGAT	2	10	608427	608436	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020285	TAAAT	2	10	611854	611863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020285	TAATA	2	10	627004	627013	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020285	ATTTA	2	10	629366	629375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020285	TAAAC	2	10	639677	639686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020285	CTATA	2	10	639750	639759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020285	TCCTG	2	10	639879	639888	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_020285	GATGA	2	10	644247	644256	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020285	CACGA	2	10	647742	647751	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_020285	AGCTC	2	10	649016	649025	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_020285	AATTT	2	10	650874	650883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020285	AAATT	2	10	651431	651440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020285	GTATA	2	10	661343	661352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020285	ACAAA	2	10	661398	661407	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020285	AATGA	2	10	671227	671236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020285	CCGAA	2	10	675158	675167	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_020285	TATAC	2	10	679926	679935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020285	AATTT	2	10	680038	680047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020285	ATTTT	2	10	696999	697008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020285	ATTAC	2	10	707138	707147	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020285	ATTTT	2	10	711302	711311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020285	TATAT	2	10	711321	711330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020285	ATAAA	2	10	727001	727010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020285	AATCA	2	10	749939	749948	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020285	TAAAT	2	10	753474	753483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020285	CTAAT	2	10	762764	762773	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020285	ATATA	2	10	765910	765919	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020285	ATTAA	2	10	769606	769615	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020285	CTACA	2	10	772619	772628	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_020285	TAAGA	2	10	789436	789445	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020285	AACAA	2	10	799369	799378	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020285	AAAAT	2	10	812577	812586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020285	TATCA	2	10	819766	819775	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.