MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium galatii TCC219

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020284	GGTGTA	2	12	2982	2993	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451811879
2	NC_020284	TTTTTC	2	12	3275	3286	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451811879
3	NC_020284	CTGATG	2	12	4129	4140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811879
4	NC_020284	CTATTA	2	12	5202	5213	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451811880
5	NC_020284	GTTATT	2	12	5697	5708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811880
6	NC_020284	TATTTT	2	12	6295	6306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451811881
7	NC_020284	AATTCT	2	12	13431	13442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451811885
8	NC_020284	AGGTGA	2	12	15412	15423	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451811887
9	NC_020284	TATTCT	2	12	17326	17337	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811889
10	NC_020284	AAATCT	2	12	24184	24195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811899
11	NC_020284	AACTGT	2	12	30799	30810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811907
12	NC_020284	ATTTTT	2	12	32062	32073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451811908
13	NC_020284	TGCTAA	2	12	32635	32646	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811909
14	NC_020284	TTTTCA	2	12	36746	36757	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811911
15	NC_020284	TGGGTC	2	12	38161	38172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451811912
16	NC_020284	AGCTAG	2	12	38266	38277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451811912
17	NC_020284	ACTAGT	2	12	39629	39640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811913
18	NC_020284	TTTGGA	2	12	39950	39961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451811913
19	NC_020284	TGCTGA	2	12	40247	40258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811913
20	NC_020284	TTTCTA	2	12	45897	45908	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811919
21	NC_020284	CTGTTG	2	12	47084	47095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451811920
22	NC_020284	TCAGAA	2	12	48291	48302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451811921
23	NC_020284	TTTGCT	2	12	52432	52443	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451811925
24	NC_020284	CAGAAA	2	12	52819	52830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451811926
25	NC_020284	AATGTT	2	12	57552	57563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451811931
26	NC_020284	GCAGCT	2	12	67023	67034	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451811939
27	NC_020284	TATTTG	2	12	70925	70936	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811943
28	NC_020284	TATTGT	2	12	72479	72490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811944
29	NC_020284	ATCTCT	2	12	72782	72793	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	451811944
30	NC_020284	ATGCGT	2	12	73632	73643	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811945
31	NC_020284	CAGAGA	2	12	74974	74985	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	451811946
32	NC_020284	CTGATG	2	12	75094	75105	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451811946
33	NC_020284	CACTAT	2	12	79295	79306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451811950
34	NC_020284	AAATGA	2	12	92298	92309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811959
35	NC_020284	ATATAA	2	12	93317	93328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451811959
36	NC_020284	TGCTAA	2	12	94952	94963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811960
37	NC_020284	ATCTAG	2	12	96400	96411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451811960
38	NC_020284	CAGAAA	2	12	102309	102320	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451811965
39	NC_020284	ACTTAA	2	12	102348	102359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811965
40	NC_020284	CTATAA	2	12	105594	105605	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451811968
41	NC_020284	TGATTT	2	12	108922	108933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811972
42	NC_020284	TCTTTA	2	12	109321	109332	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811973
43	NC_020284	GAAATA	2	12	110132	110143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451811974
44	NC_020284	TATTTC	2	12	123831	123842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451811986
45	NC_020284	TACCAG	2	12	124797	124808	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451811987
46	NC_020284	TTCTTG	2	12	124869	124880	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451811987
47	NC_020284	TTTGTA	2	12	130733	130744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451811992
48	NC_020284	AGCAAC	2	12	133113	133124	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	451811994
49	NC_020284	TGTTGC	2	12	138359	138370	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451811998
50	NC_020284	TACAAG	2	12	139912	139923	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451811999
51	NC_020284	GCTCCT	2	12	142767	142778	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	451812001
52	NC_020284	TTTATC	2	12	144411	144422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451812003
53	NC_020284	GCTGAT	2	12	144682	144693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451812004
54	NC_020284	AGGCAT	2	12	155006	155017	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451812010
55	NC_020284	TTCTAA	2	12	156153	156164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812011
56	NC_020284	ATGAAA	2	12	157587	157598	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451812012
57	NC_020284	TATACA	2	12	163129	163140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451812017
58	NC_020284	GAAAAT	2	12	164584	164595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451812017
59	NC_020284	TTATAA	2	12	166037	166048	50 %	50 %	0 %	0 %	451812019
60	NC_020284	ATTAAT	2	12	166353	166364	50 %	50 %	0 %	0 %	451812019
61	NC_020284	ATCTAT	2	12	168029	168040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812020
62	NC_020284	GATTAT	2	12	169106	169117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812020
63	NC_020284	TGTTTC	2	12	173728	173739	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451812023
64	NC_020284	TTTAGA	2	12	174664	174675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812024
65	NC_020284	TCTATA	2	12	176089	176100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812025
66	NC_020284	CATATT	2	12	179535	179546	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812029
67	NC_020284	AAATAA	2	12	181179	181190	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451812030
68	NC_020284	GTTGGT	2	12	185325	185336	0 %	50 %	50 %	0 %	451812034
69	NC_020284	ACATTT	2	12	196141	196152	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812039
70	NC_020284	CAGCCA	2	12	197081	197092	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451812039
71	NC_020284	CTAGCT	2	12	199883	199894	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451812043
72	NC_020284	AAAAAT	2	12	200944	200955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451812044
73	NC_020284	TAAAAA	2	12	201090	201101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	451812044
74	NC_020284	GAATTT	2	12	201376	201387	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812044
75	NC_020284	TGCAAT	2	12	204365	204376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451812047
76	NC_020284	GAAAAG	2	12	205760	205771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812048
77	NC_020284	GATGGT	3	18	205844	205861	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451812048
78	NC_020284	ATCGTG	2	12	218222	218233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451812057
79	NC_020284	GTTTTC	2	12	232201	232212	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451812063
80	NC_020284	TTGGAG	2	12	235616	235627	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451812066
81	NC_020284	TATGGT	2	12	252324	252335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451812082
82	NC_020284	GGTTGA	2	12	254692	254703	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451812083
83	NC_020284	ATATCT	2	12	256986	256997	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812087
84	NC_020284	TTTTAT	2	12	257201	257212	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451812087
85	NC_020284	TATTAA	2	12	258280	258291	50 %	50 %	0 %	0 %	451812088
86	NC_020284	AATTAA	2	12	264590	264601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812093
87	NC_020284	AAAGAT	2	12	272025	272036	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451812099
88	NC_020284	TTCTTT	2	12	272180	272191	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	451812099
89	NC_020284	TTCTTG	2	12	284417	284428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	451812110
90	NC_020284	ATGATA	2	12	284598	284609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812111
91	NC_020284	AAATTA	2	12	286076	286087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812111
92	NC_020284	GTATAT	2	12	291374	291385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812118
93	NC_020284	ATTTTA	2	12	293124	293135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812120
94	NC_020284	AATATT	2	12	294744	294755	50 %	50 %	0 %	0 %	451812122
95	NC_020284	AATTAA	2	12	296586	296597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812124
96	NC_020284	ATATGA	2	12	298268	298279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812126
97	NC_020284	ATAAGT	2	12	299927	299938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812126
98	NC_020284	TCTAAT	2	12	306697	306708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812134
99	NC_020284	GCTACA	2	12	306796	306807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451812134
100	NC_020284	CATAAT	2	12	307504	307515	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451812136
101	NC_020284	AGATTC	2	12	321060	321071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451812152
102	NC_020284	TATAAA	2	12	322017	322028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812152
103	NC_020284	AAGCAT	2	12	324743	324754	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451812156
104	NC_020284	TGGTAG	2	12	324977	324988	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	451812156
105	NC_020284	TGAAAA	2	12	329895	329906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451812159
106	NC_020284	GATAAA	2	12	331056	331067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451812159
107	NC_020284	TACACC	2	12	335389	335400	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	451812162
108	NC_020284	TATCAG	2	12	337331	337342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451812164
109	NC_020284	ATTATG	2	12	337619	337630	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812164
110	NC_020284	AGAAAT	2	12	341848	341859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451812167
111	NC_020284	TATAAA	2	12	344955	344966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812169
112	NC_020284	TATCAT	2	12	349331	349342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812173
113	NC_020284	ATTTTT	2	12	350626	350637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	451812174
114	NC_020284	TGATAC	2	12	352137	352148	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451812176
115	NC_020284	TAAAGA	2	12	353923	353934	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451812178
116	NC_020284	ATATAA	2	12	358278	358289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812182
117	NC_020284	AATTAG	2	12	371211	371222	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812197
118	NC_020284	AATTTG	2	12	371292	371303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812197
119	NC_020284	TATGAA	2	12	371431	371442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812197
120	NC_020284	ATTTAT	2	12	373137	373148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812199
121	NC_020284	TCCCAT	2	12	373673	373684	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451812199
122	NC_020284	GACCAG	2	12	374532	374543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451812201
123	NC_020284	CCATAG	2	12	375459	375470	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451812201
124	NC_020284	TAATTT	2	12	375529	375540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451812201
125	NC_020284	TTTCAT	2	12	381864	381875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451812205
126	NC_020284	TCCTGT	2	12	382866	382877	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451812207
127	NC_020284	ATCCAA	2	12	390530	390541	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451812214
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129	NC_020284	CTTTAT	2	12	392846	392857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451812215
130	NC_020284	CAACTA	2	12	394173	394184	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451812216
131	NC_020284	CCATAC	2	12	396158	396169	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	451812218
132	NC_020284	GAAAAA	2	12	397592	397603	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451812218
133	NC_020284	ATGTTT	2	12	399943	399954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451812220
134	NC_020284	CTATGT	2	12	400949	400960	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451812220
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136	NC_020284	TTGCTG	2	12	403025	403036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451812223
137	NC_020284	TACTTA	2	12	407776	407787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812230
138	NC_020284	TATTAA	2	12	408499	408510	50 %	50 %	0 %	0 %	451812230
139	NC_020284	TAAATA	2	12	410904	410915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812233
140	NC_020284	CTTACC	2	12	417802	417813	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451812237
141	NC_020284	ATAACC	2	12	418251	418262	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451812238
142	NC_020284	TAGATT	2	12	424987	424998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812244
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144	NC_020284	ATCATG	2	12	430475	430486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451812249
145	NC_020284	GATTTA	2	12	433897	433908	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812251
146	NC_020284	TTTTCC	2	12	434664	434675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451812253
147	NC_020284	TGTATT	2	12	435144	435155	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451812254
148	NC_020284	AATATA	2	12	437960	437971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451812255
149	NC_020284	TTTACA	2	12	438519	438530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812255
150	NC_020284	TGGATT	2	12	439481	439492	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451812256
151	NC_020284	ATGACC	2	12	441810	441821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451812258
152	NC_020284	CTATAG	2	12	455752	455763	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451812267
153	NC_020284	ATATCA	2	12	461972	461983	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451812275
154	NC_020284	ACCAGC	2	12	462384	462395	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451812275
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156	NC_020284	GAACAA	2	12	468283	468294	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	451812281
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191	NC_020284	ATCGTT	2	12	561643	561654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451812362
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217	NC_020284	ATTGAT	2	12	606167	606178	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812401
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219	NC_020284	ATGTTG	2	12	622372	622383	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451812414
220	NC_020284	ATTATC	2	12	628893	628904	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451812418
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222	NC_020284	AAGGAA	2	12	634135	634146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451812423
223	NC_020284	CCTAGT	2	12	636462	636473	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451812424
224	NC_020284	TATCTT	2	12	639065	639076	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	451812426
225	NC_020284	TAGCTA	2	12	642504	642515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451812428
226	NC_020284	AAATGC	2	12	644934	644945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451812429
227	NC_020284	GATTAT	2	12	645250	645261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812430
228	NC_020284	ATCACT	2	12	653136	653147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812434
229	NC_020284	TTAACA	2	12	656753	656764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	451812437
230	NC_020284	AAAAGA	2	12	657454	657465	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451812438
231	NC_020284	AGATAT	2	12	665051	665062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812446
232	NC_020284	ATGTTG	2	12	666377	666388	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451812447
233	NC_020284	AAATGC	2	12	667354	667365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451812448
234	NC_020284	TAATAG	2	12	668311	668322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812448
235	NC_020284	CCTGCT	2	12	669454	669465	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	451812450
236	NC_020284	TTCCAC	2	12	670007	670018	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	451812450
237	NC_020284	TAGGAT	2	12	670993	671004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451812451
238	NC_020284	AATTCC	2	12	676635	676646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451812456
239	NC_020284	GATTTA	2	12	684612	684623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812462
240	NC_020284	GCTGTT	2	12	685086	685097	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451812462
241	NC_020284	CCTCTG	2	12	689568	689579	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	451812465
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252	NC_020284	AGGTGG	2	12	714912	714923	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	451812493
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254	NC_020284	TTAGAA	2	12	718265	718276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	451812495
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260	NC_020284	CAGTAA	2	12	736047	736058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451812512
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262	NC_020284	CAGTAA	2	12	738972	738983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451812515
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264	NC_020284	TAGTAT	2	12	744655	744666	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	451812521
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269	NC_020284	CAGTAA	2	12	755910	755921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451812532
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.