MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020283	ATTTAG	2	12	16670	16681	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020283	AATTTT	2	12	63804	63815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020283	ATATTT	2	12	81676	81687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020283	GTAATA	2	12	131749	131760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020283	TATCTT	2	12	131781	131792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020283	TATTTT	2	12	134933	134944	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020283	TAATAT	2	12	137941	137952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020283	AAATTA	2	12	153849	153860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020283	TTTTAT	2	12	199356	199367	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020283	TTGTGT	2	12	205556	205567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020283	TAAATA	2	12	237060	237071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020283	TTTAAA	2	12	237411	237422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020283	AATTAT	2	12	240479	240490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020283	AATTTA	2	12	240634	240645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020283	TTTTAT	2	12	308062	308073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020283	AATAAA	2	12	312758	312769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020283	AAAATT	2	12	312875	312886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020283	TAGCAT	2	12	320123	320134	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020283	ATTTAA	2	12	355382	355393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020283	ATAACA	2	12	355533	355544	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020283	ATTTAT	2	12	386530	386541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020283	CTATTT	2	12	392944	392955	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020283	GTATAT	2	12	393052	393063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020283	TTTATT	2	12	401578	401589	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020283	AAAACA	2	12	436017	436028	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020283	ATTAAT	2	12	446257	446268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020283	GATAAA	2	12	460292	460303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020283	TAAAAA	2	12	486602	486613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020283	TTATAA	2	12	491257	491268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020283	AAAAAT	2	12	496855	496866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020283	TAAAAT	2	12	498783	498794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020283	ATATTT	2	12	517566	517577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020283	ATTGAA	2	12	528593	528604	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020283	ATATTT	2	12	595714	595725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020283	AAATAT	2	12	595728	595739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020283	GATTTT	2	12	632055	632066	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020283	ATAATT	2	12	652246	652257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020283	AAAAAG	2	12	663547	663558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020283	AATTTA	2	12	696010	696021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020283	TAACGA	2	12	698097	698108	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020283	ACAAAA	2	12	704942	704953	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020283	TTTTAA	2	12	718225	718236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020283	TAATAT	2	12	727010	727021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020283	TGATTG	2	12	769155	769166	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020283	GTCCAG	2	12	784831	784842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.