MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020283	ATTTA	2	10	34083	34092	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020283	TTTAA	2	10	37541	37550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020283	AATTT	2	10	39120	39129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020283	ATTAA	2	10	39171	39180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020283	ATTTA	2	10	50166	50175	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020283	GAGAT	2	10	51959	51968	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020283	TAATT	2	10	54588	54597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020283	TTTAT	2	10	66646	66655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020283	TAATT	2	10	82950	82959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020283	TAATT	2	10	82964	82973	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020283	TGATT	2	10	97044	97053	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020283	TTATA	2	10	100984	100993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020283	GCGGA	2	10	121125	121134	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020283	CATGC	2	10	121336	121345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_020283	TAAAT	2	10	121452	121461	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020283	TTTGA	2	10	137989	137998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020283	TTTTA	2	10	140000	140009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020283	TTAAT	2	10	150124	150133	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020283	TAAAT	2	10	169130	169139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020283	TTATG	2	10	175516	175525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020283	TTAAT	2	10	175638	175647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020283	TATTT	2	10	180338	180347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020283	TCGTG	2	10	190355	190364	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020283	AATTT	2	10	191144	191153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020283	GGGAG	2	10	191873	191882	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020283	CTCAT	2	10	193874	193883	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020283	AATAT	2	10	195692	195701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020283	AATGA	2	10	199125	199134	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020283	TGTAG	2	10	203295	203304	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020283	ATGTT	2	10	215534	215543	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020283	CAATA	2	10	215607	215616	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020283	AACAA	2	10	219684	219693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020283	TTATT	2	10	223527	223536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020283	TCGTG	2	10	228241	228250	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020283	AATTT	2	10	229030	229039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020283	GGGAG	2	10	229759	229768	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020283	CTCAT	2	10	231760	231769	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_020283	GTATT	3	15	237112	237126	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020283	TTGAA	2	10	240445	240454	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020283	GTTTT	2	10	253125	253134	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020283	TTATT	2	10	254278	254287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020283	TAAAG	2	10	257369	257378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020283	TAATT	2	10	257402	257411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020283	CAGAA	2	10	259528	259537	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020283	CAAAA	2	10	259648	259657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020283	GTATA	2	10	295135	295144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020283	TTTAA	2	10	311668	311677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020283	TGATT	2	10	312784	312793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020283	TATAT	2	10	315292	315301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020283	TAAAA	2	10	315703	315712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020283	CTTTC	2	10	322864	322873	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_020283	ATTTA	2	10	327713	327722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020283	TATAG	2	10	373801	373810	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020283	GATTA	2	10	374259	374268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020283	TATGA	2	10	392252	392261	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020283	GAAAG	2	10	392266	392275	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020283	GCAAA	2	10	392584	392593	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020283	TTAAA	2	10	392815	392824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020283	ATATT	2	10	398797	398806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020283	AAACA	2	10	404639	404648	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020283	ATCTA	2	10	415018	415027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020283	AATAA	2	10	415880	415889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020283	ACAAT	2	10	418484	418493	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020283	TTTAA	2	10	423142	423151	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020283	CATAT	2	10	434415	434424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020283	AATAA	2	10	436032	436041	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020283	TAAAA	2	10	436093	436102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020283	AAAAT	2	10	440816	440825	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020283	TAATA	2	10	446397	446406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020283	ATATA	2	10	448097	448106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020283	AAAAT	2	10	448776	448785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020283	TATAA	2	10	452303	452312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020283	TAAAA	2	10	458223	458232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020283	TTTAT	2	10	469346	469355	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020283	ATTTA	2	10	480473	480482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020283	ATTTA	2	10	480645	480654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020283	TGTAT	2	10	481301	481310	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020283	TAAAA	2	10	519986	519995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020283	TTAAA	2	10	522414	522423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020283	AATAA	2	10	522598	522607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020283	ATAAA	2	10	526197	526206	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020283	TACAA	2	10	537451	537460	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020283	ATTTA	2	10	541829	541838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020283	ATTTT	2	10	559194	559203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020283	TTAAA	2	10	560176	560185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020283	AATAA	2	10	562024	562033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020283	ATAAA	2	10	563257	563266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020283	CGAAA	2	10	571667	571676	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020283	CAAAA	2	10	575700	575709	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020283	AATTA	2	10	581636	581645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020283	TAGAA	2	10	587210	587219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020283	AGTAT	2	10	622208	622217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020283	CATAA	2	10	628591	628600	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020283	ATTTC	2	10	632107	632116	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020283	CTATC	2	10	645340	645349	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_020283	AATTT	2	10	645448	645457	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020283	GATGA	2	10	649660	649669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020283	CTCCC	2	10	651662	651671	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_020283	AAATT	2	10	652391	652400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020283	CACGA	2	10	653180	653189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_020283	TAAAA	2	10	678071	678080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020283	ACTAG	2	10	678142	678151	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020283	CAAAT	2	10	679893	679902	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020283	CAAAA	2	10	688393	688402	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020283	AAAAT	2	10	688558	688567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020283	AATTA	2	10	692557	692566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020283	TTAAT	2	10	701406	701415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020283	CTTTT	2	10	705865	705874	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_020283	TAAAA	2	10	710011	710020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020283	ATCAA	2	10	726431	726440	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020283	GATTT	2	10	726485	726494	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020283	AAATT	2	10	726579	726588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020283	ATTAT	2	10	726813	726822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020283	AATAT	2	10	732043	732052	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020283	TAAAA	2	10	733150	733159	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020283	AACAT	2	10	752820	752829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020283	AATTA	2	10	770740	770749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020283	ATACA	2	10	779251	779260	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020283	TAAAT	2	10	779477	779486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020283	TTTAA	2	10	782535	782544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020283	TAAAA	2	10	784046	784055	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020283	TAAAA	2	10	785940	785949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020283	AAAAC	2	10	811055	811064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020283	AAAAT	2	10	814573	814582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020283	TAAAT	2	10	817585	817594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.