MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii TCC036E

Total Repeats: 341

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020283	ATAA	2	8	8431	8438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020283	AAAT	2	8	8687	8694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020283	ATTA	2	8	9945	9952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020283	TATG	2	8	12460	12467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020283	TAAA	2	8	14223	14230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020283	TTAA	2	8	18900	18907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020283	TTAA	2	8	18969	18976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020283	TAGT	2	8	19071	19078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020283	TAAT	3	12	27720	27731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020283	ATAA	2	8	27740	27747	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020283	ATTT	2	8	34098	34105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020283	ATTA	2	8	38957	38964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020283	TGTT	2	8	39000	39007	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020283	GAAT	2	8	45031	45038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020283	ATTG	2	8	45199	45206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020283	AATT	2	8	46709	46716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020283	GATT	2	8	50670	50677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020283	AAGG	2	8	55535	55542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020283	GTTA	2	8	57419	57426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020283	AGAT	2	8	58754	58761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020283	ATTA	2	8	58775	58782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020283	TTGA	2	8	63495	63502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020283	TTTG	2	8	64795	64802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020283	ATTT	2	8	66570	66577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020283	TATT	2	8	66700	66707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020283	ATTT	2	8	75232	75239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020283	ATTT	2	8	76007	76014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020283	GTTT	2	8	79727	79734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020283	TTTG	2	8	89842	89849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020283	TATT	2	8	100777	100784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020283	AATC	2	8	100846	100853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020283	ATTT	2	8	103325	103332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020283	ACTC	2	8	103362	103369	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020283	TGAT	2	8	103786	103793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020283	AAAT	2	8	104088	104095	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020283	TCCT	2	8	104270	104277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_020283	ATTT	2	8	105995	106002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020283	AATT	2	8	107385	107392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020283	TAAG	2	8	109050	109057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020283	TAAT	2	8	111176	111183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020283	TCAC	2	8	111318	111325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020283	CATT	2	8	111333	111340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020283	ATTT	2	8	111396	111403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020283	TGTA	2	8	111445	111452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020283	GTTT	2	8	117921	117928	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020283	AAAT	2	8	118996	119003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020283	ATTT	2	8	128187	128194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020283	TAAA	2	8	137743	137750	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020283	TAAA	2	8	137896	137903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020283	TATT	2	8	143930	143937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020283	TGTT	2	8	160125	160132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020283	CTAT	2	8	169402	169409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020283	TAAT	2	8	170556	170563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020283	ATTT	2	8	173849	173856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020283	TTAT	2	8	175550	175557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020283	TGTT	2	8	175587	175594	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020283	ATTT	2	8	180247	180254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020283	ATTT	2	8	186209	186216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020283	AGCT	2	8	186312	186319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020283	ATTT	2	8	186327	186334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020283	TTAA	2	8	187696	187703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020283	TATT	2	8	188998	189005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020283	GATA	2	8	189035	189042	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020283	ACAA	2	8	189168	189175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020283	GAAA	2	8	189877	189884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020283	TACC	2	8	190265	190272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020283	ATTA	2	8	191284	191291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020283	AAAC	2	8	191475	191482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020283	ACCC	2	8	191511	191518	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_020283	ACTG	2	8	191534	191541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020283	GCGA	2	8	191631	191638	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020283	AAAG	2	8	192466	192473	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020283	ATTA	2	8	194307	194314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020283	TGTT	2	8	194368	194375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020283	TTTA	2	8	194521	194528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020283	ATTG	2	8	198470	198477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020283	TTAA	2	8	198566	198573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020283	TTGA	2	8	198621	198628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020283	ATTT	2	8	199099	199106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020283	AAAT	2	8	199175	199182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020283	AATT	2	8	199291	199298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020283	TAGT	2	8	199322	199329	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020283	TACT	2	8	199405	199412	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020283	TAAT	2	8	203317	203324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020283	TTAT	2	8	205529	205536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020283	TTAC	2	8	208759	208766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020283	TAAC	2	8	208781	208788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020283	TGGA	2	8	208920	208927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020283	TTGT	2	8	211534	211541	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020283	TAAA	2	8	212507	212514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020283	ATTA	2	8	215167	215174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020283	CCAA	2	8	215364	215371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020283	TATT	2	8	215771	215778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020283	TGAT	2	8	215849	215856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020283	AAAT	2	8	217998	218005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020283	TTAC	2	8	223367	223374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020283	TATT	2	8	226884	226891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020283	GATA	2	8	226921	226928	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020283	ACAA	2	8	227054	227061	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020283	GAAA	2	8	227763	227770	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020283	TACC	2	8	228151	228158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020283	ATTA	2	8	229170	229177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020283	AAAC	2	8	229361	229368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020283	ACCC	2	8	229397	229404	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_020283	ACTG	2	8	229420	229427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020283	GCGA	2	8	229517	229524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020283	AAAG	2	8	230352	230359	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020283	ATTA	2	8	232193	232200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020283	TGTT	2	8	232254	232261	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020283	TTTA	2	8	232407	232414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020283	AAAT	2	8	233288	233295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020283	TTAT	2	8	237002	237009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020283	TATT	2	8	237104	237111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020283	TTAC	2	8	237129	237136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_020283	TTAA	2	8	240695	240702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020283	ATTA	2	8	248585	248592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020283	ATTA	2	8	248640	248647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020283	TCTA	2	8	249847	249854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020283	TATT	2	8	254265	254272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020283	GTTT	2	8	255510	255517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020283	AAAT	2	8	257174	257181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020283	ATTA	2	8	257445	257452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020283	AGAA	2	8	259826	259833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020283	ATCT	2	8	259843	259850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020283	GAAG	2	8	259884	259891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020283	TATT	2	8	259949	259956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020283	ATTT	2	8	259989	259996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020283	TATT	2	8	260966	260973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020283	CTAA	2	8	267378	267385	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020283	ATTA	2	8	268138	268145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020283	TAAG	2	8	268272	268279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020283	TAGT	2	8	274621	274628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020283	TTAT	2	8	276633	276640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020283	TATT	2	8	276767	276774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020283	CTAA	2	8	282649	282656	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020283	CAGA	2	8	283961	283968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_020283	AAAT	2	8	286013	286020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020283	TTTG	2	8	286531	286538	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020283	GAAG	2	8	289598	289605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020283	TTAT	2	8	289647	289654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020283	ATTT	2	8	297751	297758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020283	GTTT	2	8	297815	297822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020283	TTTC	2	8	300392	300399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_020283	TATT	2	8	311508	311515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020283	TATT	2	8	311603	311610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020283	TAAT	2	8	311647	311654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020283	AGAT	2	8	317483	317490	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020283	TCAT	2	8	318893	318900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020283	GTTT	2	8	320313	320320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020283	TCTT	2	8	322427	322434	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020283	TAAT	2	8	322451	322458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020283	ACTT	2	8	322464	322471	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.