MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong2

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020276	CCGA	2	8	680	687	25 %	0 %	25 %	50 %	451770597
2	NC_020276	CGGC	2	8	694	701	0 %	0 %	50 %	50 %	451770597
3	NC_020276	CCGT	2	8	975	982	0 %	25 %	25 %	50 %	451770598
4	NC_020276	CCAC	2	8	1504	1511	25 %	0 %	0 %	75 %	451770598
5	NC_020276	CCAC	2	8	1658	1665	25 %	0 %	0 %	75 %	451770599
6	NC_020276	ACTG	2	8	2040	2047	25 %	25 %	25 %	25 %	451770599
7	NC_020276	CCGC	2	8	2654	2661	0 %	0 %	25 %	75 %	451770599
8	NC_020276	CCAG	2	8	2816	2823	25 %	0 %	25 %	50 %	451770599
9	NC_020276	CGAT	2	8	2903	2910	25 %	25 %	25 %	25 %	451770599
10	NC_020276	CCGC	2	8	2981	2988	0 %	0 %	25 %	75 %	451770599
11	NC_020276	CCGG	2	8	3678	3685	0 %	0 %	50 %	50 %	451770601
12	NC_020276	AGGT	2	8	3732	3739	25 %	25 %	50 %	0 %	451770601
13	NC_020276	CGGA	2	8	3850	3857	25 %	0 %	50 %	25 %	451770601
14	NC_020276	CGCT	2	8	3874	3881	0 %	25 %	25 %	50 %	451770601
15	NC_020276	CGCC	2	8	4011	4018	0 %	0 %	25 %	75 %	451770601
16	NC_020276	CACC	2	8	4300	4307	25 %	0 %	0 %	75 %	451770601
17	NC_020276	CGGC	2	8	4315	4322	0 %	0 %	50 %	50 %	451770601
18	NC_020276	CTGT	2	8	4665	4672	0 %	50 %	25 %	25 %	451770603
19	NC_020276	GGTA	2	8	5012	5019	25 %	25 %	50 %	0 %	451770603
20	NC_020276	CACC	2	8	5026	5033	25 %	0 %	0 %	75 %	451770603
21	NC_020276	CGGC	2	8	5124	5131	0 %	0 %	50 %	50 %	451770603
22	NC_020276	CCGG	2	8	5784	5791	0 %	0 %	50 %	50 %	451770604
23	NC_020276	AGTC	2	8	5848	5855	25 %	25 %	25 %	25 %	451770604
24	NC_020276	GGCC	2	8	6148	6155	0 %	0 %	50 %	50 %	451770604
25	NC_020276	CATC	2	8	6199	6206	25 %	25 %	0 %	50 %	451770604
26	NC_020276	CGGC	2	8	6352	6359	0 %	0 %	50 %	50 %	451770604
27	NC_020276	CGGC	2	8	6430	6437	0 %	0 %	50 %	50 %	451770604
28	NC_020276	CCGG	2	8	6726	6733	0 %	0 %	50 %	50 %	451770604
29	NC_020276	GCCC	2	8	6742	6749	0 %	0 %	25 %	75 %	451770604
30	NC_020276	GGCG	2	8	6815	6822	0 %	0 %	75 %	25 %	451770604
31	NC_020276	TTTG	2	8	7225	7232	0 %	75 %	25 %	0 %	451770604
32	NC_020276	AGCG	2	8	7520	7527	25 %	0 %	50 %	25 %	451770604
33	NC_020276	CATC	2	8	7797	7804	25 %	25 %	0 %	50 %	451770605
34	NC_020276	GTGA	2	8	8521	8528	25 %	25 %	50 %	0 %	451770606
35	NC_020276	GGCC	2	8	9361	9368	0 %	0 %	50 %	50 %	451770607
36	NC_020276	TCGA	2	8	9933	9940	25 %	25 %	25 %	25 %	451770608
37	NC_020276	GCCG	2	8	9956	9963	0 %	0 %	50 %	50 %	451770608
38	NC_020276	CGGT	2	8	10258	10265	0 %	25 %	50 %	25 %	451770608
39	NC_020276	CGGC	2	8	11263	11270	0 %	0 %	50 %	50 %	451770609
40	NC_020276	CGTG	2	8	11472	11479	0 %	25 %	50 %	25 %	451770609
41	NC_020276	TTGC	2	8	11628	11635	0 %	50 %	25 %	25 %	451770609
42	NC_020276	GCCG	2	8	12957	12964	0 %	0 %	50 %	50 %	451770611
43	NC_020276	GCCG	2	8	13023	13030	0 %	0 %	50 %	50 %	451770611
44	NC_020276	GATG	2	8	13259	13266	25 %	25 %	50 %	0 %	451770612
45	NC_020276	CCGG	2	8	13431	13438	0 %	0 %	50 %	50 %	451770613
46	NC_020276	ACCG	2	8	13470	13477	25 %	0 %	25 %	50 %	451770613
47	NC_020276	GGCT	2	8	13500	13507	0 %	25 %	50 %	25 %	451770613
48	NC_020276	GCCG	2	8	13574	13581	0 %	0 %	50 %	50 %	451770613
49	NC_020276	TGGC	2	8	14184	14191	0 %	25 %	50 %	25 %	451770613
50	NC_020276	CGGC	2	8	14250	14257	0 %	0 %	50 %	50 %	451770613
51	NC_020276	GGCC	2	8	14487	14494	0 %	0 %	50 %	50 %	451770613
52	NC_020276	CACC	2	8	14898	14905	25 %	0 %	0 %	75 %	451770613
53	NC_020276	GTGG	2	8	14933	14940	0 %	25 %	75 %	0 %	451770613
54	NC_020276	CACG	2	8	14999	15006	25 %	0 %	25 %	50 %	451770613
55	NC_020276	CGAC	2	8	15505	15512	25 %	0 %	25 %	50 %	451770614
56	NC_020276	CGCC	2	8	15550	15557	0 %	0 %	25 %	75 %	451770614
57	NC_020276	GACG	2	8	16568	16575	25 %	0 %	50 %	25 %	451770617
58	NC_020276	GCCG	2	8	16652	16659	0 %	0 %	50 %	50 %	451770617
59	NC_020276	CGGC	2	8	17455	17462	0 %	0 %	50 %	50 %	451770619

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.