MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong2

Total Repeats: 315

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020276	TGT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770596
2	NC_020276	TGT	2	6	156	161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770596
3	NC_020276	GCC	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
4	NC_020276	ACG	2	6	514	519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770597
5	NC_020276	CCG	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
6	NC_020276	CAC	2	6	581	586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770597
7	NC_020276	CAA	2	6	587	592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770597
8	NC_020276	GCT	2	6	601	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770597
9	NC_020276	CAG	2	6	656	661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770597
10	NC_020276	GCC	2	6	672	677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
11	NC_020276	CGC	2	6	734	739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
12	NC_020276	GCC	2	6	753	758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
13	NC_020276	CAG	2	6	763	768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770597
14	NC_020276	CGC	3	9	770	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770597
15	NC_020276	TCA	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770597
16	NC_020276	CAC	2	6	920	925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770598
17	NC_020276	GCA	2	6	958	963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
18	NC_020276	GCT	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770598
19	NC_020276	CGC	2	6	1118	1123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
20	NC_020276	CTG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770598
21	NC_020276	GTG	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770598
22	NC_020276	CGA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
23	NC_020276	AGC	2	6	1294	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
24	NC_020276	GCC	2	6	1306	1311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
25	NC_020276	CGC	2	6	1325	1330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
26	NC_020276	CAG	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770598
27	NC_020276	CGC	2	6	1397	1402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
28	NC_020276	CTC	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451770598
29	NC_020276	ACC	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770598
30	NC_020276	TCA	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770598
31	NC_020276	CGC	2	6	1524	1529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770598
32	NC_020276	GAC	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770599
33	NC_020276	TGC	2	6	1730	1735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770599
34	NC_020276	GCC	2	6	1750	1755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
35	NC_020276	CGC	2	6	1791	1796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
36	NC_020276	CGA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770599
37	NC_020276	ACC	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
38	NC_020276	TGA	2	6	1926	1931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770599
39	NC_020276	GTG	2	6	1959	1964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770599
40	NC_020276	GAA	2	6	2022	2027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770599
41	NC_020276	CCA	2	6	2118	2123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
42	NC_020276	CAA	2	6	2130	2135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770599
43	NC_020276	ATC	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770599
44	NC_020276	GGT	2	6	2275	2280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770599
45	NC_020276	CGC	2	6	2391	2396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
46	NC_020276	CAT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770599
47	NC_020276	CCG	2	6	2502	2507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
48	NC_020276	GCG	2	6	2508	2513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770599
49	NC_020276	GCC	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
50	NC_020276	CCA	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
51	NC_020276	ACC	2	6	2566	2571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
52	NC_020276	CCA	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770599
53	NC_020276	GCC	2	6	2747	2752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
54	NC_020276	GGT	2	6	2804	2809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770599
55	NC_020276	CGC	2	6	2937	2942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
56	NC_020276	CGC	3	9	3022	3030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770599
57	NC_020276	CAG	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770599
58	NC_020276	CTG	2	6	3092	3097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770599
59	NC_020276	TGC	2	6	3183	3188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770600
60	NC_020276	TCC	2	6	3201	3206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451770600
61	NC_020276	CGG	2	6	3581	3586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770601
62	NC_020276	CGC	2	6	3595	3600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
63	NC_020276	CGC	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
64	NC_020276	CTG	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770601
65	NC_020276	CCG	2	6	3759	3764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
66	NC_020276	CCA	3	9	3765	3773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770601
67	NC_020276	CGA	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770601
68	NC_020276	GCC	2	6	3800	3805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
69	NC_020276	GCG	3	9	3904	3912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770601
70	NC_020276	TCG	3	9	3936	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770601
71	NC_020276	CGC	2	6	4025	4030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
72	NC_020276	CCG	2	6	4035	4040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
73	NC_020276	GGC	2	6	4052	4057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770601
74	NC_020276	CCG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
75	NC_020276	GAA	2	6	4100	4105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770601
76	NC_020276	TGA	2	6	4150	4155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451770601
77	NC_020276	GCC	2	6	4160	4165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
78	NC_020276	ACG	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770601
79	NC_020276	GAC	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770601
80	NC_020276	CGC	2	6	4232	4237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770601
81	NC_020276	CCA	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770601
82	NC_020276	ACA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451770602
83	NC_020276	CAC	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770602
84	NC_020276	CGT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770602
85	NC_020276	GCC	2	6	4494	4499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770602
86	NC_020276	GAC	2	6	4586	4591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770602
87	NC_020276	TCG	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770603
88	NC_020276	AGC	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770603
89	NC_020276	TCG	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770603
90	NC_020276	CGG	2	6	4754	4759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
91	NC_020276	TTC	2	6	4772	4777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451770603
92	NC_020276	CAG	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770603
93	NC_020276	GCG	2	6	4805	4810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
94	NC_020276	ACC	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770603
95	NC_020276	TCG	2	6	4886	4891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770603
96	NC_020276	CGG	2	6	4959	4964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
97	NC_020276	CCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770603
98	NC_020276	GCC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770603
99	NC_020276	CGG	2	6	5056	5061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
100	NC_020276	GAA	2	6	5158	5163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451770603
101	NC_020276	CAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770603
102	NC_020276	GCG	3	9	5260	5268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770603
103	NC_020276	CGG	2	6	5428	5433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770604
104	NC_020276	CGG	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770604
105	NC_020276	CGC	3	9	5474	5482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
106	NC_020276	GTT	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451770604
107	NC_020276	GCT	2	6	5642	5647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770604
108	NC_020276	GTC	2	6	5650	5655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770604
109	NC_020276	TGC	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770604
110	NC_020276	CGG	2	6	5839	5844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770604
111	NC_020276	GAC	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770604
112	NC_020276	CAC	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770604
113	NC_020276	CCG	2	6	5961	5966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
114	NC_020276	GAC	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770604
115	NC_020276	CGG	2	6	6032	6037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770604
116	NC_020276	TGG	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451770604
117	NC_020276	CGC	2	6	6089	6094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
118	NC_020276	GCC	2	6	6101	6106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
119	NC_020276	CCA	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770604
120	NC_020276	CGT	2	6	6266	6271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770604
121	NC_020276	CGC	2	6	6302	6307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
122	NC_020276	CAC	2	6	6373	6378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770604
123	NC_020276	ACC	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770604
124	NC_020276	CCG	2	6	6390	6395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
125	NC_020276	ACC	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451770604
126	NC_020276	GCA	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770604
127	NC_020276	ATC	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451770604
128	NC_020276	CCG	2	6	6456	6461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
129	NC_020276	GCC	2	6	6489	6494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
130	NC_020276	GGC	2	6	6498	6503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451770604
131	NC_020276	GCA	2	6	6504	6509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770604
132	NC_020276	CGC	2	6	6545	6550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
133	NC_020276	CGC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
134	NC_020276	CGA	2	6	6635	6640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770604
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136	NC_020276	CGC	2	6	6694	6699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770604
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.