MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020275	CCCACG	2	12	492	503	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770453
2	NC_020275	TTGGTC	2	12	5189	5200	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451770456
3	NC_020275	CGCTGC	2	12	5816	5827	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451770458
4	NC_020275	CGTCGA	2	12	7698	7709	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451770462
5	NC_020275	TCGGCA	2	12	11455	11466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451770467
6	NC_020275	CACCGT	2	12	11589	11600	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451770467
7	NC_020275	GAACGC	2	12	13837	13848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770468
8	NC_020275	GCTGAT	2	12	16226	16237	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451770470
9	NC_020275	CCCGGC	2	12	16288	16299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770470
10	NC_020275	CTGGCG	2	12	20877	20888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	451770474
11	NC_020275	ACCGCG	2	12	24198	24209	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451770477
12	NC_020275	ACCGGC	2	12	25576	25587	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451770479
13	NC_020275	GCGGCA	2	12	26433	26444	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	451770479
14	NC_020275	TGTGCG	2	12	28421	28432	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	451770483
15	NC_020275	TCGTTG	2	12	30860	30871	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451770487
16	NC_020275	CGATGG	2	12	37011	37022	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451770499
17	NC_020275	TTGCCG	2	12	39519	39530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451770502
18	NC_020275	CGGCCC	2	12	41720	41731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770506
19	NC_020275	CACCGC	2	12	42933	42944	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770507
20	NC_020275	CGGCGC	2	12	43215	43226	0 %	0 %	50 %	50 %	451770507
21	NC_020275	CCGGCG	2	12	43313	43324	0 %	0 %	50 %	50 %	451770507
22	NC_020275	CCCGCA	2	12	45142	45153	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770511
23	NC_020275	CGCAAC	2	12	46332	46343	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451770511
24	NC_020275	TGCCCG	2	12	46849	46860	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451770511
25	NC_020275	CAAGCC	2	12	47909	47920	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451770512
26	NC_020275	GTCGAC	2	12	49568	49579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451770512
27	NC_020275	GACGTC	2	12	50198	50209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451770514
28	NC_020275	GCCGGC	2	12	54528	54539	0 %	0 %	50 %	50 %	451770516
29	NC_020275	GGAGGC	2	12	54690	54701	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	451770516
30	NC_020275	AACGCC	2	12	56294	56305	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451770517
31	NC_020275	CACTGA	2	12	56646	56657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451770517
32	NC_020275	GCACCC	2	12	57594	57605	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770518
33	NC_020275	CATCGA	2	12	61103	61114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451770522
34	NC_020275	CCGGCG	2	12	61491	61502	0 %	0 %	50 %	50 %	451770523
35	NC_020275	GCCCCG	2	12	62281	62292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770524
36	NC_020275	GTCACC	2	12	66923	66934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451770525
37	NC_020275	CCGCGC	2	12	67421	67432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770525
38	NC_020275	CGCATC	2	12	68089	68100	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451770526
39	NC_020275	GCCTGC	2	12	68341	68352	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451770526
40	NC_020275	GGCACC	2	12	68416	68427	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451770526
41	NC_020275	CCCGAC	2	12	71562	71573	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770530
42	NC_020275	CATCCG	2	12	73032	73043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020275	CAGCGG	2	12	75691	75702	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	451770533
44	NC_020275	CCGACG	2	12	79071	79082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451770539
45	NC_020275	CGGCGA	2	12	79505	79516	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	451770540
46	NC_020275	GCCGAC	2	12	83472	83483	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451770548
47	NC_020275	GCGGCC	2	12	85107	85118	0 %	0 %	50 %	50 %	451770550
48	NC_020275	CACCCC	2	12	85177	85188	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	451770550
49	NC_020275	GACCCG	2	12	90574	90585	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	451770555
50	NC_020275	TCGACT	2	12	90698	90709	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451770555
51	NC_020275	CGCGCC	2	12	91764	91775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451770556
52	NC_020275	ACGCTC	2	12	93721	93732	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	451770560
53	NC_020275	CTCGGC	2	12	93901	93912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	451770560
54	NC_020275	TGGAGC	2	12	95026	95037	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451770562
55	NC_020275	CGCGGC	2	12	95467	95478	0 %	0 %	50 %	50 %	451770562
56	NC_020275	CCGTGG	2	12	95551	95562	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	451770563
57	NC_020275	CCAAGC	2	12	97123	97134	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451770565
58	NC_020275	AAGCCG	2	12	100797	100808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770569
59	NC_020275	GGCCCG	2	12	102418	102429	0 %	0 %	50 %	50 %	451770571
60	NC_020275	CCAGCA	2	12	106641	106652	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451770579
61	NC_020275	ACCCGC	2	12	115957	115968	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770589
62	NC_020275	AAGCCG	2	12	116229	116240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451770589
63	NC_020275	CCCCGA	2	12	119512	119523	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	451770589

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.