MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020275	CTGGA	2	10	3279	3288	20 %	20 %	40 %	20 %	451770455
2	NC_020275	ACCGC	2	10	4536	4545	20 %	0 %	20 %	60 %	451770456
3	NC_020275	GCGCC	2	10	4743	4752	0 %	0 %	40 %	60 %	451770456
4	NC_020275	CCTGG	2	10	5907	5916	0 %	20 %	40 %	40 %	451770458
5	NC_020275	ACGCG	2	10	6947	6956	20 %	0 %	40 %	40 %	451770461
6	NC_020275	TTGCG	2	10	7053	7062	0 %	40 %	40 %	20 %	451770462
7	NC_020275	CCCAG	2	10	8926	8935	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_020275	CTGTG	2	10	9314	9323	0 %	40 %	40 %	20 %	451770464
9	NC_020275	TGGCG	2	10	11811	11820	0 %	20 %	60 %	20 %	451770468
10	NC_020275	TGGAT	2	10	12792	12801	20 %	40 %	40 %	0 %	451770468
11	NC_020275	CGCTA	2	10	14871	14880	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_020275	AGTCC	2	10	15355	15364	20 %	20 %	20 %	40 %	451770469
13	NC_020275	TCAGG	2	10	20141	20150	20 %	20 %	40 %	20 %	451770473
14	NC_020275	GAGGG	2	10	20347	20356	20 %	0 %	80 %	0 %	451770474
15	NC_020275	CGGTG	2	10	23564	23573	0 %	20 %	60 %	20 %	451770477
16	NC_020275	CGCGG	2	10	23792	23801	0 %	0 %	60 %	40 %	451770477
17	NC_020275	GTGTG	2	10	24922	24931	0 %	40 %	60 %	0 %	451770478
18	NC_020275	CACAG	2	10	25559	25568	40 %	0 %	20 %	40 %	451770479
19	NC_020275	TGCGC	2	10	25714	25723	0 %	20 %	40 %	40 %	451770479
20	NC_020275	GCCGG	2	10	26136	26145	0 %	0 %	60 %	40 %	451770479
21	NC_020275	GCGAC	2	10	27752	27761	20 %	0 %	40 %	40 %	451770481
22	NC_020275	GAAAT	2	10	28225	28234	60 %	20 %	20 %	0 %	451770481
23	NC_020275	GGCCG	2	10	30502	30511	0 %	0 %	60 %	40 %	451770486
24	NC_020275	ACCGC	2	10	31883	31892	20 %	0 %	20 %	60 %	451770488
25	NC_020275	ACGTC	2	10	32392	32401	20 %	20 %	20 %	40 %	451770489
26	NC_020275	CTGGC	2	10	33011	33020	0 %	20 %	40 %	40 %	451770491
27	NC_020275	CCAGC	2	10	35077	35086	20 %	0 %	20 %	60 %	451770495
28	NC_020275	CGCGC	2	10	37176	37185	0 %	0 %	40 %	60 %	451770499
29	NC_020275	GCCGC	2	10	38759	38768	0 %	0 %	40 %	60 %	451770502
30	NC_020275	CCCGG	2	10	40058	40067	0 %	0 %	40 %	60 %	451770503
31	NC_020275	CCAGC	2	10	40399	40408	20 %	0 %	20 %	60 %	451770503
32	NC_020275	GGCCT	2	10	42784	42793	0 %	20 %	40 %	40 %	451770507
33	NC_020275	GGCCC	2	10	42859	42868	0 %	0 %	40 %	60 %	451770507
34	NC_020275	TCCAG	2	10	45666	45675	20 %	20 %	20 %	40 %	451770511
35	NC_020275	CAAAC	2	10	46119	46128	60 %	0 %	0 %	40 %	451770511
36	NC_020275	ACCCA	2	10	46185	46194	40 %	0 %	0 %	60 %	451770511
37	NC_020275	CGTGC	2	10	47502	47511	0 %	20 %	40 %	40 %	451770511
38	NC_020275	CACCC	2	10	48436	48445	20 %	0 %	0 %	80 %	451770512
39	NC_020275	GTCAC	2	10	49323	49332	20 %	20 %	20 %	40 %	451770512
40	NC_020275	CGGCG	2	10	52646	52655	0 %	0 %	60 %	40 %	451770515
41	NC_020275	TCGAC	2	10	53171	53180	20 %	20 %	20 %	40 %	451770515
42	NC_020275	CGCCA	2	10	53350	53359	20 %	0 %	20 %	60 %	451770515
43	NC_020275	GCCCC	2	10	54973	54982	0 %	0 %	20 %	80 %	451770516
44	NC_020275	GCCCA	2	10	56275	56284	20 %	0 %	20 %	60 %	451770517
45	NC_020275	GCTCA	2	10	56397	56406	20 %	20 %	20 %	40 %	451770517
46	NC_020275	CCGAG	2	10	56605	56614	20 %	0 %	40 %	40 %	451770517
47	NC_020275	TCGGG	2	10	57835	57844	0 %	20 %	60 %	20 %	451770518
48	NC_020275	CCTGC	2	10	57847	57856	0 %	20 %	20 %	60 %	451770518
49	NC_020275	CCCGG	2	10	60450	60459	0 %	0 %	40 %	60 %	451770522
50	NC_020275	CCCGG	2	10	60989	60998	0 %	0 %	40 %	60 %	451770522
51	NC_020275	GCGAG	2	10	63055	63064	20 %	0 %	60 %	20 %	451770524
52	NC_020275	CCGGC	2	10	66024	66033	0 %	0 %	40 %	60 %	451770525
53	NC_020275	CACCG	2	10	66496	66505	20 %	0 %	20 %	60 %	451770525
54	NC_020275	CCGGC	2	10	66507	66516	0 %	0 %	40 %	60 %	451770525
55	NC_020275	ACAGC	2	10	67263	67272	40 %	0 %	20 %	40 %	451770525
56	NC_020275	CCGGC	2	10	67312	67321	0 %	0 %	40 %	60 %	451770525
57	NC_020275	GAAGC	2	10	67871	67880	40 %	0 %	40 %	20 %	451770526
58	NC_020275	CAACG	2	10	70362	70371	40 %	0 %	20 %	40 %	451770529
59	NC_020275	CAGCA	2	10	70734	70743	40 %	0 %	20 %	40 %	451770530
60	NC_020275	GTTCT	2	10	73493	73502	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020275	GGAAC	2	10	73518	73527	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020275	GGTCG	2	10	77492	77501	0 %	20 %	60 %	20 %	451770536
63	NC_020275	CCGCA	2	10	78341	78350	20 %	0 %	20 %	60 %	451770538
64	NC_020275	GCCGA	2	10	78353	78362	20 %	0 %	40 %	40 %	451770538
65	NC_020275	GCCCA	2	10	78947	78956	20 %	0 %	20 %	60 %	451770539
66	NC_020275	ACCCA	2	10	80260	80269	40 %	0 %	0 %	60 %	451770542
67	NC_020275	GCAGC	2	10	80636	80645	20 %	0 %	40 %	40 %	451770543
68	NC_020275	CGCGC	2	10	81290	81299	0 %	0 %	40 %	60 %	451770544
69	NC_020275	GGCCG	2	10	81714	81723	0 %	0 %	60 %	40 %	451770545
70	NC_020275	CGCGG	2	10	83182	83191	0 %	0 %	60 %	40 %	451770547
71	NC_020275	CGTGC	2	10	83318	83327	0 %	20 %	40 %	40 %	451770548
72	NC_020275	CACCT	2	10	83765	83774	20 %	20 %	0 %	60 %	451770548
73	NC_020275	CCTGG	2	10	84071	84080	0 %	20 %	40 %	40 %	451770548
74	NC_020275	GCGCC	2	10	84161	84170	0 %	0 %	40 %	60 %	451770548
75	NC_020275	CAGCG	2	10	84279	84288	20 %	0 %	40 %	40 %	451770548
76	NC_020275	CCGGC	2	10	85315	85324	0 %	0 %	40 %	60 %	451770550
77	NC_020275	CCGGC	2	10	86133	86142	0 %	0 %	40 %	60 %	451770550
78	NC_020275	ACCTG	2	10	86487	86496	20 %	20 %	20 %	40 %	451770550
79	NC_020275	ATCCG	2	10	87130	87139	20 %	20 %	20 %	40 %	451770552
80	NC_020275	CCCCT	2	10	87195	87204	0 %	20 %	0 %	80 %	451770552
81	NC_020275	TGCGG	2	10	89732	89741	0 %	20 %	60 %	20 %	451770554
82	NC_020275	AGCCG	2	10	91541	91550	20 %	0 %	40 %	40 %	451770556
83	NC_020275	CGCGG	2	10	94445	94454	0 %	0 %	60 %	40 %	451770560
84	NC_020275	AACGA	3	15	94524	94538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020275	CCCGA	2	10	94706	94715	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_020275	ATGCG	2	10	94739	94748	20 %	20 %	40 %	20 %	451770561
87	NC_020275	CCAGG	2	10	98836	98845	20 %	0 %	40 %	40 %	451770567
88	NC_020275	GTGCA	2	10	100544	100553	20 %	20 %	40 %	20 %	451770568
89	NC_020275	GGTGG	2	10	101217	101226	0 %	20 %	80 %	0 %	451770570
90	NC_020275	ACTGC	2	10	101265	101274	20 %	20 %	20 %	40 %	451770570
91	NC_020275	ACCCC	2	10	101345	101354	20 %	0 %	0 %	80 %	451770570
92	NC_020275	GCACA	2	10	101378	101387	40 %	0 %	20 %	40 %	451770570
93	NC_020275	GCGCA	2	10	102178	102187	20 %	0 %	40 %	40 %	451770570
94	NC_020275	CATCG	2	10	102894	102903	20 %	20 %	20 %	40 %	451770572
95	NC_020275	ACACC	2	10	103388	103397	40 %	0 %	0 %	60 %	451770573
96	NC_020275	GCCCG	2	10	109415	109424	0 %	0 %	40 %	60 %	451770584
97	NC_020275	CCGCC	2	10	109799	109808	0 %	0 %	20 %	80 %	451770584
98	NC_020275	CGGGC	2	10	110120	110129	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_020275	TGCGC	2	10	110716	110725	0 %	20 %	40 %	40 %	451770585
100	NC_020275	GTCGG	2	10	112552	112561	0 %	20 %	60 %	20 %	451770587
101	NC_020275	CGCGC	2	10	113593	113602	0 %	0 %	40 %	60 %	451770588
102	NC_020275	CCGCA	2	10	114412	114421	20 %	0 %	20 %	60 %	451770589
103	NC_020275	GCCAA	2	10	115146	115155	40 %	0 %	20 %	40 %	451770589
104	NC_020275	CGCAC	2	10	116570	116579	20 %	0 %	20 %	60 %	451770589
105	NC_020275	CCGCA	2	10	116894	116903	20 %	0 %	20 %	60 %	451770589
106	NC_020275	CGCTG	2	10	117330	117339	0 %	20 %	40 %	40 %	451770589
107	NC_020275	GCTCG	2	10	120925	120934	0 %	20 %	40 %	40 %	451770591
108	NC_020275	TCTGC	2	10	121158	121167	0 %	40 %	20 %	40 %	451770591
109	NC_020275	CGCGT	2	10	121244	121253	0 %	20 %	40 %	40 %	451770591
110	NC_020275	TGCCG	2	10	121429	121438	0 %	20 %	40 %	40 %	451770591

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.