MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong1

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020275	CTTA	2	8	184	191	25 %	50 %	0 %	25 %	451770452
2	NC_020275	CGAC	2	8	726	733	25 %	0 %	25 %	50 %	451770453
3	NC_020275	GGCG	3	12	994	1005	0 %	0 %	75 %	25 %	451770453
4	NC_020275	GGTC	2	8	1357	1364	0 %	25 %	50 %	25 %	451770453
5	NC_020275	CGCC	2	8	2096	2103	0 %	0 %	25 %	75 %	451770454
6	NC_020275	ACCC	2	8	2551	2558	25 %	0 %	0 %	75 %	451770454
7	NC_020275	GATC	2	8	2784	2791	25 %	25 %	25 %	25 %	451770454
8	NC_020275	GATC	2	8	3418	3425	25 %	25 %	25 %	25 %	451770455
9	NC_020275	CGAC	2	8	3442	3449	25 %	0 %	25 %	50 %	451770455
10	NC_020275	GCCC	2	8	3705	3712	0 %	0 %	25 %	75 %	451770455
11	NC_020275	GCTC	2	8	4140	4147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020275	CCGG	2	8	4310	4317	0 %	0 %	50 %	50 %	451770456
13	NC_020275	CCGA	2	8	4402	4409	25 %	0 %	25 %	50 %	451770456
14	NC_020275	CTGC	2	8	5339	5346	0 %	25 %	25 %	50 %	451770456
15	NC_020275	CTGC	2	8	5490	5497	0 %	25 %	25 %	50 %	451770456
16	NC_020275	TTCC	2	8	5539	5546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020275	GCGG	2	8	6266	6273	0 %	0 %	75 %	25 %	451770459
18	NC_020275	GCGG	2	8	6287	6294	0 %	0 %	75 %	25 %	451770459
19	NC_020275	GCCA	2	8	6707	6714	25 %	0 %	25 %	50 %	451770460
20	NC_020275	CGTT	2	8	6982	6989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020275	GACG	2	8	7095	7102	25 %	0 %	50 %	25 %	451770462
22	NC_020275	CGGG	2	8	7916	7923	0 %	0 %	75 %	25 %	451770462
23	NC_020275	GCGG	2	8	8149	8156	0 %	0 %	75 %	25 %	451770462
24	NC_020275	GGCG	2	8	8498	8505	0 %	0 %	75 %	25 %	451770463
25	NC_020275	TTGT	2	8	8640	8647	0 %	75 %	25 %	0 %	451770463
26	NC_020275	GGCC	2	8	8918	8925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020275	CCAC	2	8	9395	9402	25 %	0 %	0 %	75 %	451770464
28	NC_020275	CCGG	2	8	9410	9417	0 %	0 %	50 %	50 %	451770464
29	NC_020275	CCCG	2	8	9753	9760	0 %	0 %	25 %	75 %	451770465
30	NC_020275	GATC	2	8	11132	11139	25 %	25 %	25 %	25 %	451770467
31	NC_020275	TAGC	2	8	11773	11780	25 %	25 %	25 %	25 %	451770468
32	NC_020275	GCGG	2	8	12382	12389	0 %	0 %	75 %	25 %	451770468
33	NC_020275	GGTG	2	8	12420	12427	0 %	25 %	75 %	0 %	451770468
34	NC_020275	GTAG	2	8	12546	12553	25 %	25 %	50 %	0 %	451770468
35	NC_020275	GCTG	2	8	12699	12706	0 %	25 %	50 %	25 %	451770468
36	NC_020275	GGCA	2	8	13915	13922	25 %	0 %	50 %	25 %	451770468
37	NC_020275	ACCG	2	8	14120	14127	25 %	0 %	25 %	50 %	451770468
38	NC_020275	CCAC	2	8	14676	14683	25 %	0 %	0 %	75 %	451770468
39	NC_020275	GCCG	2	8	15665	15672	0 %	0 %	50 %	50 %	451770469
40	NC_020275	GGGC	2	8	16430	16437	0 %	0 %	75 %	25 %	451770470
41	NC_020275	GCAT	2	8	17125	17132	25 %	25 %	25 %	25 %	451770470
42	NC_020275	GCTG	2	8	17754	17761	0 %	25 %	50 %	25 %	451770471
43	NC_020275	CCGA	2	8	17991	17998	25 %	0 %	25 %	50 %	451770471
44	NC_020275	GCTG	2	8	18283	18290	0 %	25 %	50 %	25 %	451770471
45	NC_020275	TTCC	2	8	18682	18689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020275	TGGA	2	8	18694	18701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020275	ACTG	2	8	18780	18787	25 %	25 %	25 %	25 %	451770472
48	NC_020275	CGGC	2	8	19782	19789	0 %	0 %	50 %	50 %	451770472
49	NC_020275	GGAT	2	8	20902	20909	25 %	25 %	50 %	0 %	451770474
50	NC_020275	TCGC	2	8	21169	21176	0 %	25 %	25 %	50 %	451770475
51	NC_020275	CCGG	2	8	21247	21254	0 %	0 %	50 %	50 %	451770475
52	NC_020275	CGAC	2	8	21938	21945	25 %	0 %	25 %	50 %	451770475
53	NC_020275	AATT	2	8	22262	22269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020275	TGGG	2	8	22333	22340	0 %	25 %	75 %	0 %	451770476
55	NC_020275	AAGG	2	8	22362	22369	50 %	0 %	50 %	0 %	451770476
56	NC_020275	CGGC	2	8	22711	22718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020275	CGCT	2	8	23673	23680	0 %	25 %	25 %	50 %	451770477
58	NC_020275	GACC	2	8	24026	24033	25 %	0 %	25 %	50 %	451770477
59	NC_020275	TGTT	2	8	24824	24831	0 %	75 %	25 %	0 %	451770478
60	NC_020275	CGAC	2	8	25131	25138	25 %	0 %	25 %	50 %	451770478
61	NC_020275	ATCT	2	8	25740	25747	25 %	50 %	0 %	25 %	451770479
62	NC_020275	GTGG	2	8	25844	25851	0 %	25 %	75 %	0 %	451770479
63	NC_020275	GCCG	3	12	25866	25877	0 %	0 %	50 %	50 %	451770479
64	NC_020275	CAGC	2	8	26152	26159	25 %	0 %	25 %	50 %	451770479
65	NC_020275	CGAG	2	8	26620	26627	25 %	0 %	50 %	25 %	451770479
66	NC_020275	CCCG	2	8	26942	26949	0 %	0 %	25 %	75 %	451770480
67	NC_020275	CGGC	2	8	27491	27498	0 %	0 %	50 %	50 %	451770481
68	NC_020275	CGAT	2	8	28027	28034	25 %	25 %	25 %	25 %	451770481
69	NC_020275	CGTT	2	8	28066	28073	0 %	50 %	25 %	25 %	451770481
70	NC_020275	GGTG	2	8	28094	28101	0 %	25 %	75 %	0 %	451770481
71	NC_020275	GCGG	2	8	28625	28632	0 %	0 %	75 %	25 %	451770483
72	NC_020275	TTTG	2	8	28775	28782	0 %	75 %	25 %	0 %	451770483
73	NC_020275	CGAC	2	8	29286	29293	25 %	0 %	25 %	50 %	451770484
74	NC_020275	GAAG	2	8	29421	29428	50 %	0 %	50 %	0 %	451770484
75	NC_020275	GTCC	2	8	29508	29515	0 %	25 %	25 %	50 %	451770484
76	NC_020275	GCCG	2	8	29560	29567	0 %	0 %	50 %	50 %	451770484
77	NC_020275	GTGC	2	8	30022	30029	0 %	25 %	50 %	25 %	451770484
78	NC_020275	CCGG	2	8	30294	30301	0 %	0 %	50 %	50 %	451770485
79	NC_020275	CATC	2	8	30393	30400	25 %	25 %	0 %	50 %	451770486
80	NC_020275	GCCC	2	8	30459	30466	0 %	0 %	25 %	75 %	451770486
81	NC_020275	CGGC	2	8	31082	31089	0 %	0 %	50 %	50 %	451770487
82	NC_020275	GCGT	2	8	31326	31333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020275	GGTC	2	8	31646	31653	0 %	25 %	50 %	25 %	451770488
84	NC_020275	TCTG	2	8	31979	31986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020275	GGCC	2	8	32971	32978	0 %	0 %	50 %	50 %	451770491
86	NC_020275	CTTC	2	8	33368	33375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020275	ACCT	2	8	33528	33535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_020275	GCTG	2	8	33680	33687	0 %	25 %	50 %	25 %	451770492
89	NC_020275	TGGG	2	8	33775	33782	0 %	25 %	75 %	0 %	451770492
90	NC_020275	AGAT	2	8	34299	34306	50 %	25 %	25 %	0 %	451770493
91	NC_020275	TCGG	2	8	35009	35016	0 %	25 %	50 %	25 %	451770495
92	NC_020275	TGCG	2	8	35223	35230	0 %	25 %	50 %	25 %	451770495
93	NC_020275	TGGT	2	8	35419	35426	0 %	50 %	50 %	0 %	451770496
94	NC_020275	GATC	2	8	36139	36146	25 %	25 %	25 %	25 %	451770497
95	NC_020275	CGGC	2	8	36818	36825	0 %	0 %	50 %	50 %	451770498
96	NC_020275	CGCC	2	8	37207	37214	0 %	0 %	25 %	75 %	451770499
97	NC_020275	GCCG	2	8	37817	37824	0 %	0 %	50 %	50 %	451770501
98	NC_020275	CGGC	2	8	39226	39233	0 %	0 %	50 %	50 %	451770502
99	NC_020275	GCGG	2	8	39431	39438	0 %	0 %	75 %	25 %	451770502
100	NC_020275	GACC	2	8	39625	39632	25 %	0 %	25 %	50 %	451770502
101	NC_020275	ACCA	2	8	39795	39802	50 %	0 %	0 %	50 %	451770502
102	NC_020275	GCCC	2	8	39838	39845	0 %	0 %	25 %	75 %	451770502
103	NC_020275	ACAT	2	8	39987	39994	50 %	25 %	0 %	25 %	451770502
104	NC_020275	GGTG	2	8	40041	40048	0 %	25 %	75 %	0 %	451770503
105	NC_020275	CGGG	2	8	40116	40123	0 %	0 %	75 %	25 %	451770503
106	NC_020275	CAGC	2	8	40159	40166	25 %	0 %	25 %	50 %	451770503
107	NC_020275	GCCA	2	8	40268	40275	25 %	0 %	25 %	50 %	451770503
108	NC_020275	CGGT	2	8	40532	40539	0 %	25 %	50 %	25 %	451770503
109	NC_020275	CCGA	2	8	40767	40774	25 %	0 %	25 %	50 %	451770504
110	NC_020275	CACG	2	8	41573	41580	25 %	0 %	25 %	50 %	451770506
111	NC_020275	CTCC	2	8	41601	41608	0 %	25 %	0 %	75 %	451770506
112	NC_020275	GCGA	2	8	41677	41684	25 %	0 %	50 %	25 %	451770506
113	NC_020275	GCCG	2	8	42548	42555	0 %	0 %	50 %	50 %	451770506
114	NC_020275	GCTC	2	8	43578	43585	0 %	25 %	25 %	50 %	451770507
115	NC_020275	TCCG	2	8	44037	44044	0 %	25 %	25 %	50 %	451770509
116	NC_020275	CTGG	2	8	45158	45165	0 %	25 %	50 %	25 %	451770511
117	NC_020275	GCCG	2	8	45180	45187	0 %	0 %	50 %	50 %	451770511
118	NC_020275	CGGC	2	8	45544	45551	0 %	0 %	50 %	50 %	451770511
119	NC_020275	CCTG	2	8	46345	46352	0 %	25 %	25 %	50 %	451770511
120	NC_020275	CTGG	2	8	46571	46578	0 %	25 %	50 %	25 %	451770511
121	NC_020275	GCCA	2	8	46809	46816	25 %	0 %	25 %	50 %	451770511
122	NC_020275	CAGC	2	8	47569	47576	25 %	0 %	25 %	50 %	451770512
123	NC_020275	CCCG	2	8	47610	47617	0 %	0 %	25 %	75 %	451770512
124	NC_020275	GCTG	2	8	47850	47857	0 %	25 %	50 %	25 %	451770512
125	NC_020275	TGGC	2	8	47993	48000	0 %	25 %	50 %	25 %	451770512
126	NC_020275	CTGC	2	8	48067	48074	0 %	25 %	25 %	50 %	451770512
127	NC_020275	ACCC	2	8	48836	48843	25 %	0 %	0 %	75 %	451770512
128	NC_020275	CCGG	2	8	49385	49392	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
129	NC_020275	CCGG	2	8	49464	49471	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
130	NC_020275	GGTC	2	8	51124	51131	0 %	25 %	50 %	25 %	451770514
131	NC_020275	CGGG	2	8	51168	51175	0 %	0 %	75 %	25 %	451770514
132	NC_020275	TCGG	2	8	51513	51520	0 %	25 %	50 %	25 %	451770514
133	NC_020275	GGCC	2	8	51977	51984	0 %	0 %	50 %	50 %	451770515
134	NC_020275	CGCA	2	8	52311	52318	25 %	0 %	25 %	50 %	451770515
135	NC_020275	CAGC	2	8	52586	52593	25 %	0 %	25 %	50 %	451770515
136	NC_020275	GCCA	2	8	52897	52904	25 %	0 %	25 %	50 %	451770515
137	NC_020275	CCAG	2	8	52988	52995	25 %	0 %	25 %	50 %	451770515
138	NC_020275	CACC	2	8	53024	53031	25 %	0 %	0 %	75 %	451770515
139	NC_020275	GCCG	2	8	53517	53524	0 %	0 %	50 %	50 %	451770515
140	NC_020275	GCCG	2	8	54224	54231	0 %	0 %	50 %	50 %	451770516
141	NC_020275	ATCA	2	8	54296	54303	50 %	25 %	0 %	25 %	451770516
142	NC_020275	GTCG	2	8	54305	54312	0 %	25 %	50 %	25 %	451770516
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.