MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020275	GCTC	2	8	4140	4147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020275	TTCC	2	8	5539	5546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020275	CGTT	2	8	6982	6989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020275	GGCC	2	8	8918	8925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020275	TTCC	2	8	18682	18689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020275	TGGA	2	8	18694	18701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020275	AATT	2	8	22262	22269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020275	CGGC	2	8	22711	22718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020275	GCGT	2	8	31326	31333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020275	TCTG	2	8	31979	31986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020275	CTTC	2	8	33368	33375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020275	ACCT	2	8	33528	33535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020275	TGGC	2	8	58267	58274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020275	CGGC	2	8	60082	60089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020275	TCCC	2	8	69979	69986	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_020275	CGGC	2	8	75209	75216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020275	TCGC	2	8	75228	75235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020275	GACG	2	8	75289	75296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020275	CTGT	2	8	76173	76180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020275	CGAA	2	8	79142	79149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020275	GCGT	2	8	82236	82243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020275	CCCG	2	8	82841	82848	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
23	NC_020275	TCGG	2	8	86968	86975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020275	GGTT	2	8	89849	89856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020275	ACCG	2	8	89876	89883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020275	GCGG	2	8	90437	90444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020275	CCCG	2	8	96695	96702	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_020275	GCCC	2	8	97270	97277	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_020275	TGTT	2	8	97926	97933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020275	CGCT	2	8	98031	98038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020275	TCGC	2	8	98039	98046	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020275	GCCG	2	8	98092	98099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020275	CGCT	2	8	100004	100011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020275	GAAC	2	8	100237	100244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020275	TCGG	2	8	100377	100384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020275	GCGG	2	8	103496	103503	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020275	CCAC	2	8	103518	103525	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_020275	CCGG	2	8	104292	104299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020275	GCGG	2	8	105589	105596	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020275	CCAC	2	8	105611	105618	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_020275	CGGG	2	8	110089	110096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020275	TTTG	2	8	111530	111537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020275	CCGG	2	8	111562	111569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020275	CCGC	2	8	111589	111596	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_020275	TTGC	2	8	112270	112277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020275	GCCC	2	8	112375	112382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_020275	AACG	2	8	113842	113849	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020275	CGGT	2	8	120158	120165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.