MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong1

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020275	TGG	2	6	4	9	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020275	GCC	2	6	159	164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020275	ATC	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020275	TGC	2	6	360	365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020275	CTC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020275	GGA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020275	AAT	2	6	5744	5749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020275	GGT	2	6	5951	5956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020275	GAT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020275	GTG	2	6	6990	6995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020275	CCG	2	6	8686	8691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020275	GGC	2	6	8726	8731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020275	GTG	2	6	8772	8777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020275	CGT	2	6	8779	8784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020275	GCG	3	9	8787	8795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020275	CGG	2	6	8808	8813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020275	CAG	2	6	8816	8821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020275	GCC	2	6	8844	8849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_020275	CGT	2	6	8857	8862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020275	GCC	2	6	8883	8888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020275	GTC	2	6	8906	8911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020275	CGG	2	6	8956	8961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020275	GTT	2	6	8991	8996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020275	GCG	2	6	9469	9474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020275	CGC	2	6	9530	9535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020275	AAG	2	6	14901	14906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020275	TCG	2	6	15737	15742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020275	AGT	2	6	17333	17338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020275	CGG	2	6	17380	17385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020275	AAC	2	6	18570	18575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020275	CGT	2	6	18594	18599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020275	ACC	2	6	18623	18628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_020275	GAG	2	6	18639	18644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020275	CCG	2	6	18705	18710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_020275	TGG	2	6	20091	20096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020275	CAT	2	6	20303	20308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020275	ATG	2	6	21072	21077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020275	GGC	2	6	22172	22177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020275	CGA	2	6	22274	22279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020275	CTG	2	6	22723	22728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020275	TGG	2	6	22736	22741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020275	AGC	2	6	27317	27322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020275	TGG	2	6	27418	27423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020275	GGC	2	6	29125	29130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020275	CGC	2	6	31946	31951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020275	CGA	2	6	31956	31961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020275	CGT	2	6	31962	31967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020275	GGA	2	6	32636	32641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020275	ACC	2	6	33479	33484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020275	AAT	2	6	33501	33506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020275	TGA	2	6	34825	34830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020275	GCG	2	6	37268	37273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020275	CGA	2	6	38502	38507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020275	GCC	2	6	38534	38539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_020275	AGG	2	6	38582	38587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020275	AAC	2	6	41093	41098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020275	AGG	2	6	41166	41171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020275	CAG	2	6	41173	41178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020275	CCA	2	6	42703	42708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020275	CCG	2	6	55222	55227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_020275	AAC	2	6	55255	55260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020275	CGG	2	6	58355	58360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020275	GGC	2	6	59323	59328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020275	GCC	2	6	59341	59346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020275	CGT	2	6	59348	59353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020275	ATG	2	6	60121	60126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020275	TGA	2	6	61662	61667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020275	ACC	2	6	67469	67474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_020275	AGC	2	6	69619	69624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020275	TCG	2	6	69635	69640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020275	TGG	2	6	69945	69950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020275	AGC	2	6	73010	73015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020275	CGC	2	6	73081	73086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_020275	GTT	2	6	73088	73093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020275	CGT	2	6	73102	73107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020275	CGG	2	6	73140	73145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020275	CAG	2	6	73149	73154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020275	CTT	2	6	73248	73253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020275	CGC	2	6	73297	73302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_020275	GCG	2	6	73335	73340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020275	GCA	2	6	73361	73366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020275	CGC	2	6	73374	73379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_020275	CGG	2	6	73534	73539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020275	GGC	2	6	73577	73582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020275	TGA	2	6	73618	73623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020275	CCG	2	6	73933	73938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_020275	AGC	2	6	73962	73967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020275	CTG	2	6	73991	73996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020275	CAC	2	6	75124	75129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020275	CGG	2	6	76067	76072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020275	GCG	2	6	76110	76115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020275	TGG	2	6	76146	76151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020275	GCG	2	6	76463	76468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020275	CGA	2	6	77697	77702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020275	CGA	2	6	78390	78395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020275	GCC	2	6	78548	78553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_020275	GAA	2	6	78646	78651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020275	CGA	2	6	78653	78658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020275	AGG	2	6	79152	79157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020275	GCG	2	6	81022	81027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020275	CGC	2	6	81061	81066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_020275	TGC	2	6	82384	82389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020275	TCT	2	6	82413	82418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020275	TCG	2	6	82858	82863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020275	CCG	2	6	83076	83081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020275	TCG	2	6	84436	84441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020275	GTC	2	6	84499	84504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020275	GTG	2	6	84532	84537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020275	AAC	2	6	86944	86949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020275	CCG	2	6	88881	88886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020275	GCA	2	6	88987	88992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020275	CAC	2	6	89839	89844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_020275	GCG	2	6	89927	89932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020275	GTC	2	6	89943	89948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020275	ATC	2	6	89987	89992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020275	CGC	2	6	90357	90362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_020275	TCG	2	6	94501	94506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020275	GCG	2	6	94667	94672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020275	TAT	2	6	94900	94905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020275	AAC	2	6	94911	94916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020275	ACC	2	6	94924	94929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_020275	AGC	2	6	96709	96714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020275	CGA	2	6	97316	97321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020275	GCG	2	6	97613	97618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020275	CCT	2	6	97619	97624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_020275	ATG	2	6	97760	97765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020275	CGC	2	6	97780	97785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_020275	TTC	2	6	97811	97816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020275	GCG	2	6	97884	97889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020275	CTG	2	6	97890	97895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_020275	CGG	2	6	97958	97963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020275	TCC	2	6	97964	97969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_020275	CGG	2	6	98080	98085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020275	GGC	2	6	98131	98136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020275	GGC	2	6	100101	100106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020275	GGC	2	6	100163	100168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020275	CCG	2	6	100280	100285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_020275	GAG	2	6	100323	100328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020275	CTA	2	6	100484	100489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_020275	AGG	2	6	100496	100501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_020275	CAG	2	6	104350	104355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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155	NC_020275	TTC	2	6	106258	106263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_020275	CAG	2	6	106353	106358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_020275	CAC	2	6	106554	106559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_020275	CCA	2	6	107114	107119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_020275	CAC	2	6	107488	107493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_020275	CTT	2	6	107512	107517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_020275	TTC	2	6	107519	107524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_020275	CAG	2	6	107530	107535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_020275	GGC	3	9	107573	107581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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166	NC_020275	CAC	2	6	108571	108576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_020275	CAC	2	6	108924	108929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_020275	CAC	2	6	109939	109944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_020275	CAG	2	6	109982	109987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_020275	CCA	2	6	111416	111421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_020275	CAG	2	6	111542	111547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_020275	CAC	2	6	111764	111769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_020275	TTC	2	6	112253	112258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_020275	TCC	2	6	112347	112352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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182	NC_020275	TCA	2	6	113115	113120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_020275	CAC	2	6	113692	113697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_020275	CGC	2	6	113698	113703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_020275	CAC	2	6	113731	113736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_020275	CCG	2	6	113743	113748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_020275	CTC	2	6	113767	113772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_020275	ACC	2	6	122769	122774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.