MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium yongonense 05-1390 plasmid pMyong1

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020275	CG	3	6	787	792	0 %	0 %	50 %	50 %	451770453
2	NC_020275	GC	3	6	869	874	0 %	0 %	50 %	50 %	451770453
3	NC_020275	CG	3	6	1131	1136	0 %	0 %	50 %	50 %	451770453
4	NC_020275	GA	3	6	1296	1301	50 %	0 %	50 %	0 %	451770453
5	NC_020275	TC	3	6	1396	1401	0 %	50 %	0 %	50 %	451770453
6	NC_020275	GC	3	6	2534	2539	0 %	0 %	50 %	50 %	451770454
7	NC_020275	GC	3	6	2592	2597	0 %	0 %	50 %	50 %	451770454
8	NC_020275	GC	3	6	3020	3025	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
9	NC_020275	GC	3	6	3539	3544	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
10	NC_020275	GC	3	6	3681	3686	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
11	NC_020275	GC	3	6	3761	3766	0 %	0 %	50 %	50 %	451770455
12	NC_020275	CA	3	6	3977	3982	50 %	0 %	0 %	50 %	451770455
13	NC_020275	GC	3	6	5804	5809	0 %	0 %	50 %	50 %	451770458
14	NC_020275	GT	3	6	5980	5985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020275	CG	3	6	6442	6447	0 %	0 %	50 %	50 %	451770460
16	NC_020275	CG	3	6	6530	6535	0 %	0 %	50 %	50 %	451770460
17	NC_020275	TG	3	6	8163	8168	0 %	50 %	50 %	0 %	451770462
18	NC_020275	CG	3	6	9211	9216	0 %	0 %	50 %	50 %	451770464
19	NC_020275	CG	3	6	9548	9553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020275	CG	4	8	9558	9565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020275	GC	3	6	9691	9696	0 %	0 %	50 %	50 %	451770465
22	NC_020275	CG	3	6	9923	9928	0 %	0 %	50 %	50 %	451770465
23	NC_020275	AC	3	6	9942	9947	50 %	0 %	0 %	50 %	451770465
24	NC_020275	CG	3	6	9988	9993	0 %	0 %	50 %	50 %	451770465
25	NC_020275	CG	3	6	10062	10067	0 %	0 %	50 %	50 %	451770465
26	NC_020275	CG	3	6	10187	10192	0 %	0 %	50 %	50 %	451770465
27	NC_020275	CG	3	6	10213	10218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020275	GT	4	8	10463	10470	0 %	50 %	50 %	0 %	451770466
29	NC_020275	GC	3	6	10547	10552	0 %	0 %	50 %	50 %	451770466
30	NC_020275	GC	3	6	10573	10578	0 %	0 %	50 %	50 %	451770466
31	NC_020275	CG	3	6	10721	10726	0 %	0 %	50 %	50 %	451770466
32	NC_020275	CG	3	6	11429	11434	0 %	0 %	50 %	50 %	451770467
33	NC_020275	GC	3	6	12230	12235	0 %	0 %	50 %	50 %	451770468
34	NC_020275	CG	3	6	12298	12303	0 %	0 %	50 %	50 %	451770468
35	NC_020275	GC	4	8	12584	12591	0 %	0 %	50 %	50 %	451770468
36	NC_020275	CG	3	6	13331	13336	0 %	0 %	50 %	50 %	451770468
37	NC_020275	GC	3	6	14444	14449	0 %	0 %	50 %	50 %	451770468
38	NC_020275	CG	3	6	14738	14743	0 %	0 %	50 %	50 %	451770468
39	NC_020275	CG	3	6	15276	15281	0 %	0 %	50 %	50 %	451770469
40	NC_020275	AC	3	6	15293	15298	50 %	0 %	0 %	50 %	451770469
41	NC_020275	CG	3	6	16327	16332	0 %	0 %	50 %	50 %	451770470
42	NC_020275	CG	3	6	16488	16493	0 %	0 %	50 %	50 %	451770470
43	NC_020275	TC	3	6	17298	17303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020275	CG	3	6	18313	18318	0 %	0 %	50 %	50 %	451770471
45	NC_020275	GC	3	6	19631	19636	0 %	0 %	50 %	50 %	451770472
46	NC_020275	AC	3	6	20803	20808	50 %	0 %	0 %	50 %	451770474
47	NC_020275	TC	3	6	21263	21268	0 %	50 %	0 %	50 %	451770475
48	NC_020275	TG	3	6	21326	21331	0 %	50 %	50 %	0 %	451770475
49	NC_020275	TG	3	6	21685	21690	0 %	50 %	50 %	0 %	451770475
50	NC_020275	CG	4	8	22835	22842	0 %	0 %	50 %	50 %	451770477
51	NC_020275	GC	3	6	23766	23771	0 %	0 %	50 %	50 %	451770477
52	NC_020275	GC	3	6	23841	23846	0 %	0 %	50 %	50 %	451770477
53	NC_020275	GC	3	6	24116	24121	0 %	0 %	50 %	50 %	451770477
54	NC_020275	GC	3	6	24326	24331	0 %	0 %	50 %	50 %	451770477
55	NC_020275	GC	4	8	24714	24721	0 %	0 %	50 %	50 %	451770478
56	NC_020275	GC	3	6	24970	24975	0 %	0 %	50 %	50 %	451770478
57	NC_020275	AC	4	8	25115	25122	50 %	0 %	0 %	50 %	451770478
58	NC_020275	GC	3	6	25353	25358	0 %	0 %	50 %	50 %	451770478
59	NC_020275	AC	3	6	26988	26993	50 %	0 %	0 %	50 %	451770480
60	NC_020275	GC	3	6	26995	27000	0 %	0 %	50 %	50 %	451770480
61	NC_020275	GC	3	6	27388	27393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020275	GA	3	6	27983	27988	50 %	0 %	50 %	0 %	451770481
63	NC_020275	CG	3	6	28728	28733	0 %	0 %	50 %	50 %	451770483
64	NC_020275	CG	4	8	29528	29535	0 %	0 %	50 %	50 %	451770484
65	NC_020275	GC	4	8	29772	29779	0 %	0 %	50 %	50 %	451770484
66	NC_020275	GC	3	6	29899	29904	0 %	0 %	50 %	50 %	451770484
67	NC_020275	CA	3	6	30145	30150	50 %	0 %	0 %	50 %	451770485
68	NC_020275	CG	3	6	30152	30157	0 %	0 %	50 %	50 %	451770485
69	NC_020275	GC	3	6	31064	31069	0 %	0 %	50 %	50 %	451770487
70	NC_020275	GC	3	6	31542	31547	0 %	0 %	50 %	50 %	451770488
71	NC_020275	CG	3	6	32189	32194	0 %	0 %	50 %	50 %	451770489
72	NC_020275	CA	3	6	32561	32566	50 %	0 %	0 %	50 %	451770490
73	NC_020275	CG	3	6	33199	33204	0 %	0 %	50 %	50 %	451770491
74	NC_020275	GC	3	6	33217	33222	0 %	0 %	50 %	50 %	451770491
75	NC_020275	CA	4	8	33241	33248	50 %	0 %	0 %	50 %	451770491
76	NC_020275	AG	3	6	33377	33382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020275	CG	3	6	33412	33417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020275	CG	3	6	34551	34556	0 %	0 %	50 %	50 %	451770493
79	NC_020275	GC	3	6	34994	34999	0 %	0 %	50 %	50 %	451770495
80	NC_020275	GT	3	6	35154	35159	0 %	50 %	50 %	0 %	451770495
81	NC_020275	GC	4	8	35718	35725	0 %	0 %	50 %	50 %	451770497
82	NC_020275	TG	3	6	36930	36935	0 %	50 %	50 %	0 %	451770498
83	NC_020275	GC	4	8	37231	37238	0 %	0 %	50 %	50 %	451770499
84	NC_020275	GT	3	6	37261	37266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020275	TG	3	6	37432	37437	0 %	50 %	50 %	0 %	451770500
86	NC_020275	CG	3	6	37522	37527	0 %	0 %	50 %	50 %	451770500
87	NC_020275	GC	3	6	38044	38049	0 %	0 %	50 %	50 %	451770501
88	NC_020275	GC	3	6	38180	38185	0 %	0 %	50 %	50 %	451770501
89	NC_020275	CG	3	6	38272	38277	0 %	0 %	50 %	50 %	451770501
90	NC_020275	GC	3	6	38910	38915	0 %	0 %	50 %	50 %	451770502
91	NC_020275	TG	3	6	39913	39918	0 %	50 %	50 %	0 %	451770502
92	NC_020275	CG	3	6	40473	40478	0 %	0 %	50 %	50 %	451770503
93	NC_020275	GC	3	6	41342	41347	0 %	0 %	50 %	50 %	451770505
94	NC_020275	AC	3	6	41773	41778	50 %	0 %	0 %	50 %	451770506
95	NC_020275	CA	3	6	41992	41997	50 %	0 %	0 %	50 %	451770506
96	NC_020275	TG	3	6	42186	42191	0 %	50 %	50 %	0 %	451770506
97	NC_020275	GC	3	6	42470	42475	0 %	0 %	50 %	50 %	451770506
98	NC_020275	TG	3	6	42916	42921	0 %	50 %	50 %	0 %	451770507
99	NC_020275	CT	3	6	44131	44136	0 %	50 %	0 %	50 %	451770509
100	NC_020275	CA	3	6	44189	44194	50 %	0 %	0 %	50 %	451770510
101	NC_020275	CG	3	6	44294	44299	0 %	0 %	50 %	50 %	451770510
102	NC_020275	AC	3	6	44410	44415	50 %	0 %	0 %	50 %	451770510
103	NC_020275	CG	3	6	44513	44518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020275	GC	3	6	44801	44806	0 %	0 %	50 %	50 %	451770511
105	NC_020275	CT	3	6	45024	45029	0 %	50 %	0 %	50 %	451770511
106	NC_020275	AC	3	6	46034	46039	50 %	0 %	0 %	50 %	451770511
107	NC_020275	GC	3	6	46634	46639	0 %	0 %	50 %	50 %	451770511
108	NC_020275	GC	3	6	47389	47394	0 %	0 %	50 %	50 %	451770511
109	NC_020275	GC	3	6	47575	47580	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
110	NC_020275	GC	3	6	48700	48705	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
111	NC_020275	CG	3	6	48706	48711	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
112	NC_020275	CG	3	6	48847	48852	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
113	NC_020275	CG	3	6	49032	49037	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
114	NC_020275	GC	3	6	49156	49161	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
115	NC_020275	CG	3	6	49483	49488	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
116	NC_020275	GC	3	6	49501	49506	0 %	0 %	50 %	50 %	451770512
117	NC_020275	CA	3	6	49609	49614	50 %	0 %	0 %	50 %	451770512
118	NC_020275	GA	3	6	49620	49625	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020275	GC	3	6	49742	49747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020275	CA	3	6	49890	49895	50 %	0 %	0 %	50 %	451770513
121	NC_020275	GT	3	6	50880	50885	0 %	50 %	50 %	0 %	451770514
122	NC_020275	CA	3	6	51781	51786	50 %	0 %	0 %	50 %	451770514
123	NC_020275	CG	3	6	52481	52486	0 %	0 %	50 %	50 %	451770515
124	NC_020275	GC	3	6	52528	52533	0 %	0 %	50 %	50 %	451770515
125	NC_020275	TG	3	6	53207	53212	0 %	50 %	50 %	0 %	451770515
126	NC_020275	AC	3	6	53603	53608	50 %	0 %	0 %	50 %	451770516
127	NC_020275	CG	3	6	53794	53799	0 %	0 %	50 %	50 %	451770516
128	NC_020275	CG	3	6	53864	53869	0 %	0 %	50 %	50 %	451770516
129	NC_020275	CG	3	6	53974	53979	0 %	0 %	50 %	50 %	451770516
130	NC_020275	GA	3	6	54454	54459	50 %	0 %	50 %	0 %	451770516
131	NC_020275	CG	3	6	54656	54661	0 %	0 %	50 %	50 %	451770516
132	NC_020275	GC	3	6	55878	55883	0 %	0 %	50 %	50 %	451770517
133	NC_020275	GC	3	6	56187	56192	0 %	0 %	50 %	50 %	451770517
134	NC_020275	GC	4	8	58593	58600	0 %	0 %	50 %	50 %	451770519
135	NC_020275	GC	3	6	58677	58682	0 %	0 %	50 %	50 %	451770519
136	NC_020275	GC	3	6	58881	58886	0 %	0 %	50 %	50 %	451770519
137	NC_020275	CG	3	6	58949	58954	0 %	0 %	50 %	50 %	451770519
138	NC_020275	GC	3	6	59057	59062	0 %	0 %	50 %	50 %	451770519
139	NC_020275	CG	3	6	60395	60400	0 %	0 %	50 %	50 %	451770522
140	NC_020275	GC	3	6	60805	60810	0 %	0 %	50 %	50 %	451770522
141	NC_020275	CG	3	6	61696	61701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020275	GC	3	6	62621	62626	0 %	0 %	50 %	50 %	451770524
143	NC_020275	GC	3	6	62699	62704	0 %	0 %	50 %	50 %	451770524
144	NC_020275	AC	3	6	63121	63126	50 %	0 %	0 %	50 %	451770524
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289	NC_020275	GT	3	6	122520	122525	0 %	50 %	50 %	0 %	451770593
290	NC_020275	GC	3	6	122589	122594	0 %	0 %	50 %	50 %	451770593
291	NC_020275	TC	3	6	122742	122747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
292	NC_020275	GT	3	6	122872	122877	0 %	50 %	50 %	0 %	451770594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.