MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw1 genomic sequence

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020274	TTA	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045534
2	NC_020274	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
3	NC_020274	CGT	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	462045535
4	NC_020274	TTA	2	6	1076	1081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
5	NC_020274	TCT	2	6	1214	1219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045535
6	NC_020274	TAA	2	6	1226	1231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
7	NC_020274	TTG	2	6	1244	1249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	462045535
8	NC_020274	TAA	2	6	1267	1272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
9	NC_020274	TAA	2	6	1281	1286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
10	NC_020274	TTC	2	6	1342	1347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045535
11	NC_020274	ATT	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
12	NC_020274	ATT	2	6	1414	1419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
13	NC_020274	ATC	2	6	1447	1452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045535
14	NC_020274	TTA	2	6	1676	1681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
15	NC_020274	TTA	2	6	1685	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
16	NC_020274	ATC	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045535
17	NC_020274	ATT	2	6	1834	1839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045535
18	NC_020274	AAT	2	6	1925	1930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
19	NC_020274	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045535
20	NC_020274	GAA	2	6	2399	2404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
21	NC_020274	TAA	2	6	2431	2436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
22	NC_020274	ATA	2	6	2472	2477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
23	NC_020274	ATG	2	6	2493	2498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045536
24	NC_020274	ATA	2	6	2592	2597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
25	NC_020274	ATG	2	6	2616	2621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045536
26	NC_020274	AAT	2	6	2626	2631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
27	NC_020274	ACT	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045536
28	NC_020274	CAA	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	462045536
29	NC_020274	TAA	2	6	2779	2784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
30	NC_020274	AGA	3	9	2812	2820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
31	NC_020274	ATT	2	6	2832	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045536
32	NC_020274	CGA	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045536
33	NC_020274	ATA	2	6	2856	2861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
34	NC_020274	AAG	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
35	NC_020274	GAA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
36	NC_020274	ACA	2	6	2920	2925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	462045536
37	NC_020274	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
38	NC_020274	AAG	2	6	3012	3017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
39	NC_020274	GAA	2	6	3029	3034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045536
40	NC_020274	ATA	2	6	3054	3059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045536
41	NC_020274	AGG	2	6	3060	3065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045536
42	NC_020274	ACC	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	462045536
43	NC_020274	TTC	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045536
44	NC_020274	TAA	2	6	3286	3291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045537
45	NC_020274	ATT	2	6	3493	3498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045537
46	NC_020274	TGC	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	462045537
47	NC_020274	TCA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045537
48	NC_020274	TAA	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045537
49	NC_020274	TTC	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045537
50	NC_020274	ATG	2	6	3798	3803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045537
51	NC_020274	ATG	2	6	3940	3945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045538
52	NC_020274	TAA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045538
53	NC_020274	TCA	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045538
54	NC_020274	TAA	2	6	4390	4395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045538
55	NC_020274	TTC	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	462045538
56	NC_020274	ATG	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045538
57	NC_020274	TAG	2	6	4540	4545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045538
58	NC_020274	GAT	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045539
59	NC_020274	TGG	2	6	4769	4774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	462045539
60	NC_020274	ATG	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045539
61	NC_020274	AGA	2	6	4919	4924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045539
62	NC_020274	TGG	2	6	5003	5008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	462045539
63	NC_020274	ACG	2	6	5015	5020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045539
64	NC_020274	CTA	2	6	5413	5418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045540
65	NC_020274	ATA	2	6	5441	5446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045540
66	NC_020274	GAC	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045540
67	NC_020274	ATA	2	6	5708	5713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045540
68	NC_020274	TAA	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045540
69	NC_020274	ACA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	462045540
70	NC_020274	TCA	2	6	5781	5786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045540
71	NC_020274	AAC	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	462045540
72	NC_020274	TCA	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045540
73	NC_020274	TTA	2	6	5923	5928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045540
74	NC_020274	AAG	2	6	5979	5984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045540
75	NC_020274	ATT	2	6	5989	5994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045540
76	NC_020274	TAT	2	6	6050	6055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045540
77	NC_020274	TAG	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045540
78	NC_020274	TAT	3	9	6152	6160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045540
79	NC_020274	AGG	2	6	6443	6448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045540
80	NC_020274	ATT	2	6	6549	6554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045541
81	NC_020274	TTA	2	6	6655	6660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045541
82	NC_020274	GTC	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	462045541
83	NC_020274	AAT	2	6	7008	7013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045541
84	NC_020274	TAA	2	6	7017	7022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045541
85	NC_020274	CAG	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045541
86	NC_020274	CAG	2	6	7336	7341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	462045542
87	NC_020274	ATA	2	6	7481	7486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045543
88	NC_020274	TTA	2	6	7487	7492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045543
89	NC_020274	GGT	2	6	7546	7551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	462045543
90	NC_020274	GAT	2	6	7660	7665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045543
91	NC_020274	TTG	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	462045543
92	NC_020274	GGC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	462045543
93	NC_020274	AAT	2	6	7791	7796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045543
94	NC_020274	GAG	2	6	7874	7879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045543
95	NC_020274	TAA	2	6	8112	8117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045543
96	NC_020274	GAG	2	6	8311	8316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045543
97	NC_020274	ATG	2	6	8340	8345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045543
98	NC_020274	ATA	2	6	8346	8351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045544
99	NC_020274	GTA	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045544
100	NC_020274	AGA	2	6	8614	8619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045544
101	NC_020274	TAA	2	6	8697	8702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045544
102	NC_020274	TGG	2	6	8728	8733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	462045544
103	NC_020274	TAT	2	6	8792	8797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045544
104	NC_020274	ATT	3	9	8835	8843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045544
105	NC_020274	GAA	2	6	8873	8878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045544
106	NC_020274	TAA	2	6	8943	8948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045544
107	NC_020274	GCC	2	6	8968	8973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	462045544
108	NC_020274	ATG	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045544
109	NC_020274	ATG	2	6	9023	9028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045544
110	NC_020274	TAA	2	6	9056	9061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045544
111	NC_020274	ATG	2	6	9109	9114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045545
112	NC_020274	ATG	2	6	9263	9268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045545
113	NC_020274	ATA	2	6	9292	9297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045545
114	NC_020274	ATG	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045545
115	NC_020274	GGA	2	6	9312	9317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045545
116	NC_020274	ATT	2	6	9324	9329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045545
117	NC_020274	GAA	2	6	9337	9342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045545
118	NC_020274	TGA	2	6	9369	9374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045545
119	NC_020274	TAA	2	6	9443	9448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	462045545
120	NC_020274	ATG	2	6	9539	9544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045545
121	NC_020274	TGC	2	6	9547	9552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	462045545
122	NC_020274	TTA	2	6	9581	9586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045545
123	NC_020274	GCT	2	6	9651	9656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	462045545
124	NC_020274	ATT	2	6	9810	9815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	462045545
125	NC_020274	AGA	2	6	9978	9983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	462045545
126	NC_020274	GAG	2	6	10170	10175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	462045546
127	NC_020274	TAC	2	6	10224	10229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	462045546
128	NC_020274	AAC	2	6	10497	10502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	462045546
129	NC_020274	TGG	2	6	10731	10736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	462045547
130	NC_020274	ACC	2	6	10787	10792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	462045547
131	NC_020274	ATG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045547
132	NC_020274	ATG	2	6	10817	10822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045547
133	NC_020274	ATG	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045547
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148	NC_020274	TAG	2	6	13069	13074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	462045549

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.