MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45 plasmid pBA45-1

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020273	CCA	2	6	24	29	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020273	TCC	2	6	172	177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_020273	TTC	3	9	262	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
4	NC_020273	CTT	2	6	312	317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
5	NC_020273	TAC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020273	CTC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020273	AAC	2	6	605	610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020273	ATA	2	6	617	622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020273	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
10	NC_020273	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348613
11	NC_020273	GAA	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
12	NC_020273	GTG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348613
13	NC_020273	GAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
14	NC_020273	TGC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020273	CAG	2	6	1399	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348614
16	NC_020273	CTT	2	6	1563	1568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
17	NC_020273	TTC	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
18	NC_020273	GCT	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
19	NC_020273	CCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
20	NC_020273	CCT	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348614
21	NC_020273	GTC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
22	NC_020273	TTC	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
23	NC_020273	GCC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
24	NC_020273	TGC	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
25	NC_020273	CTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
26	NC_020273	CTG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
27	NC_020273	CTT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
28	NC_020273	ATC	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348614
29	NC_020273	ACA	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348614
30	NC_020273	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348614
31	NC_020273	CGC	2	6	2317	2322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
32	NC_020273	GCT	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
33	NC_020273	TAC	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020273	ATT	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
35	NC_020273	ATC	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348615
36	NC_020273	TTA	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
37	NC_020273	TAA	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
38	NC_020273	GGT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348615
39	NC_020273	TTC	2	6	3227	3232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
40	NC_020273	CTC	2	6	3315	3320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348615
41	NC_020273	AAT	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
42	NC_020273	AAG	2	6	3439	3444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348615
43	NC_020273	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
44	NC_020273	TCC	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_020273	TCA	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
46	NC_020273	CTA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
47	NC_020273	CGC	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348616
48	NC_020273	AGT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348616
49	NC_020273	AGG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451348616
50	NC_020273	ATT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348616
51	NC_020273	ATA	2	6	4063	4068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020273	CAA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348617
53	NC_020273	GAT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348617
54	NC_020273	TAA	3	9	4480	4488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
55	NC_020273	AAT	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
56	NC_020273	CTT	2	6	4523	4528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348617
57	NC_020273	TAA	2	6	4539	4544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
58	NC_020273	TAT	2	6	4608	4613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020273	TCT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
60	NC_020273	CGC	2	6	4842	4847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348618
61	NC_020273	ACC	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451348618
62	NC_020273	CAT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
63	NC_020273	ATT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348618
64	NC_020273	CAT	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
65	NC_020273	CGA	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348618
66	NC_020273	AAT	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
67	NC_020273	AAC	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348618
68	NC_020273	GAT	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348618
69	NC_020273	TCT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
70	NC_020273	CAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
71	NC_020273	AAT	2	6	5443	5448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
72	NC_020273	TAT	2	6	5801	5806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020273	ATA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020273	TAA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020273	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020273	TTG	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020273	ATT	2	6	6079	6084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020273	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020273	CTA	2	6	6229	6234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348619
80	NC_020273	CCG	2	6	6488	6493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_020273	CAG	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020273	CTC	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348620
83	NC_020273	CTT	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
84	NC_020273	CAA	2	6	6761	6766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348620
85	NC_020273	TAA	2	6	6876	6881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
86	NC_020273	CTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
87	NC_020273	ATC	2	6	7085	7090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
88	NC_020273	CTT	2	6	7148	7153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
89	NC_020273	ATA	2	6	7178	7183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
90	NC_020273	TCA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
91	NC_020273	CAG	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348620
92	NC_020273	AGA	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348620
93	NC_020273	CAT	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
94	NC_020273	ATA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
95	NC_020273	TAA	2	6	7508	7513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
96	NC_020273	TTG	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020273	ATA	2	6	7754	7759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020273	TAC	2	6	7781	7786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020273	ACA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020273	TAC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020273	AGG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.