MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45 plasmid pBA45-1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020273	TTC	3	9	262	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
2	NC_020273	CTT	2	6	312	317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
3	NC_020273	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
4	NC_020273	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348613
5	NC_020273	GAA	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
6	NC_020273	GTG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348613
7	NC_020273	GAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
8	NC_020273	CAG	2	6	1399	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348614
9	NC_020273	CTT	2	6	1563	1568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
10	NC_020273	TTC	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
11	NC_020273	GCT	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
12	NC_020273	CCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
13	NC_020273	CCT	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348614
14	NC_020273	GTC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
15	NC_020273	TTC	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
16	NC_020273	GCC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
17	NC_020273	TGC	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
18	NC_020273	CTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
19	NC_020273	CTG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
20	NC_020273	CTT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
21	NC_020273	ATC	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348614
22	NC_020273	ACA	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348614
23	NC_020273	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348614
24	NC_020273	CGC	2	6	2317	2322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
25	NC_020273	GCT	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
26	NC_020273	ATT	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
27	NC_020273	ATC	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348615
28	NC_020273	TTA	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
29	NC_020273	TAA	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
30	NC_020273	GGT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348615
31	NC_020273	TTC	2	6	3227	3232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
32	NC_020273	CTC	2	6	3315	3320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348615
33	NC_020273	AAT	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
34	NC_020273	AAG	2	6	3439	3444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348615
35	NC_020273	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
36	NC_020273	TCA	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
37	NC_020273	CTA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
38	NC_020273	CGC	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348616
39	NC_020273	AGT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348616
40	NC_020273	AGG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451348616
41	NC_020273	ATT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348616
42	NC_020273	CAA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348617
43	NC_020273	GAT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348617
44	NC_020273	TAA	3	9	4480	4488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
45	NC_020273	AAT	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
46	NC_020273	CTT	2	6	4523	4528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348617
47	NC_020273	TAA	2	6	4539	4544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
48	NC_020273	TCT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
49	NC_020273	CGC	2	6	4842	4847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348618
50	NC_020273	ACC	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451348618
51	NC_020273	CAT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
52	NC_020273	ATT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348618
53	NC_020273	CAT	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
54	NC_020273	CGA	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348618
55	NC_020273	AAT	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
56	NC_020273	AAC	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348618
57	NC_020273	GAT	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348618
58	NC_020273	TCT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
59	NC_020273	CAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
60	NC_020273	AAT	2	6	5443	5448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
61	NC_020273	CTA	2	6	6229	6234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348619
62	NC_020273	CTC	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348620
63	NC_020273	CTT	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
64	NC_020273	CAA	2	6	6761	6766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348620
65	NC_020273	TAA	2	6	6876	6881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
66	NC_020273	CTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
67	NC_020273	ATC	2	6	7085	7090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
68	NC_020273	CTT	2	6	7148	7153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
69	NC_020273	ATA	2	6	7178	7183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
70	NC_020273	TCA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
71	NC_020273	CAG	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348620
72	NC_020273	AGA	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348620
73	NC_020273	CAT	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
74	NC_020273	ATA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
75	NC_020273	TAA	2	6	7508	7513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.