MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020272	TCTGTT	2	12	21927	21938	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020272	TGAAAA	2	12	28114	28125	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020272	CTTGAT	2	12	74001	74012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020272	AGAACT	2	12	93406	93417	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020272	CAGGAA	2	12	101180	101191	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020272	GAAAAG	2	12	101829	101840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020272	TCATTT	2	12	228212	228223	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020272	CATCTG	2	12	229259	229270	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020272	TTGAAT	2	12	242574	242585	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020272	TTATAT	2	12	251051	251062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020272	AAATAA	2	12	257848	257859	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020272	TGTAAA	2	12	304731	304742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020272	ACAAAA	2	12	397746	397757	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020272	GGGAAT	2	12	430822	430833	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020272	TTCATC	2	12	460068	460079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020272	ATAAGA	2	12	529988	529999	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020272	GTAATA	2	12	538855	538866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020272	ATGAAA	2	12	559897	559908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020272	TAACTA	2	12	611035	611046	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020272	ATGAAA	2	12	616192	616203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020272	TCCCTT	2	12	662219	662230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020272	TGTTTT	2	12	701938	701949	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020272	ATCATT	2	12	751444	751455	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020272	CATTTA	2	12	789360	789371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020272	TAAATA	2	12	792550	792561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020272	TCTTAT	2	12	828518	828529	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020272	TGATAA	2	12	871054	871065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020272	GTATTT	2	12	928173	928184	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020272	TAGCAA	2	12	964011	964022	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020272	TCTTAA	2	12	972663	972674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020272	GAAACT	2	12	1050910	1050921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020272	ATGATA	2	12	1066648	1066659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020272	GATAAG	2	12	1075761	1075772	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020272	TTTTCC	2	12	1122501	1122512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020272	CTTAAA	2	12	1138203	1138214	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020272	AAAGAG	2	12	1165008	1165019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020272	TAAAAA	2	12	1167976	1167987	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020272	GCTGCC	2	12	1181466	1181477	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020272	AGAGGG	2	12	1211806	1211817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020272	TGATTC	2	12	1231095	1231106	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020272	AAAATC	2	12	1297953	1297964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020272	GGAGAA	2	12	1381884	1381895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020272	TGCTTC	2	12	1405682	1405693	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020272	AAAGTC	2	12	1427528	1427539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020272	TTAGAA	2	12	1453649	1453660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020272	TTTTCA	2	12	1503532	1503543	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020272	AGATTG	2	12	1512034	1512045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020272	TCTTTT	2	12	1522267	1522278	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020272	TATAAA	2	12	1556151	1556162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020272	ATGACG	2	12	1560246	1560257	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020272	ATGAAA	2	12	1574883	1574894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020272	TTTTTA	2	12	1575390	1575401	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020272	TACAAT	2	12	1705360	1705371	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020272	TTATTT	2	12	1799693	1799704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020272	GGAAGG	2	12	1859008	1859019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020272	GAAAAA	2	12	1890789	1890800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020272	TTATTC	2	12	1902539	1902550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020272	TCTCTT	2	12	1929329	1929340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020272	TAGAGT	2	12	2037923	2037934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020272	TAAATA	2	12	2073714	2073725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020272	AACAAA	2	12	2234146	2234157	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020272	ACCATA	2	12	2253661	2253672	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020272	ACCGGA	2	12	2308399	2308410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020272	TTTTTG	2	12	2417974	2417985	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020272	AGTTTG	2	12	2430728	2430739	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020272	AATGAT	2	12	2542961	2542972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020272	TTTTCT	2	12	2543995	2544006	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020272	AATGAT	2	12	2546202	2546213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020272	CAATTA	2	12	2559652	2559663	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020272	AATTTC	2	12	2561479	2561490	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020272	TCTTTT	2	12	2580279	2580290	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020272	AGTCCG	2	12	2580407	2580418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020272	GTTAAC	2	12	2723428	2723439	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020272	CCATAC	2	12	2737751	2737762	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020272	CTTTTC	2	12	2762984	2762995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020272	GCTTCG	2	12	2788118	2788129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020272	TATAAG	2	12	2795347	2795358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020272	GCCGCA	2	12	2809985	2809996	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_020272	CGTCAC	2	12	2872884	2872895	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020272	CTTTTC	2	12	2917071	2917082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020272	AAAAAG	2	12	2925205	2925216	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020272	TCATTA	2	12	2931327	2931338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020272	GAGCAT	2	12	2941930	2941941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020272	AAGTGA	2	12	3079876	3079887	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020272	CATCTT	2	12	3081275	3081286	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020272	CAGCAC	2	12	3083105	3083116	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020272	CTTTTT	2	12	3095681	3095692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020272	CAAATC	2	12	3146809	3146820	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020272	AAAAAG	2	12	3147322	3147333	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020272	GAAAAA	2	12	3154642	3154653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020272	TTCTTT	2	12	3202538	3202549	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020272	TTTTGT	2	12	3214080	3214091	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020272	AACGTA	2	12	3220955	3220966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020272	ATTTTT	2	12	3234640	3234651	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020272	TCATTT	2	12	3247254	3247265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020272	GAGAAA	2	12	3269637	3269648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020272	AGAAAG	2	12	3289586	3289597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020272	AGCCGG	2	12	3300031	3300042	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020272	CTTTTG	2	12	3300064	3300075	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_020272	ACAAAA	2	12	3300332	3300343	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020272	GATTGA	2	12	3301830	3301841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020272	AGCTAT	2	12	3318887	3318898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020272	TATTAA	2	12	3332095	3332106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020272	ATTGAA	2	12	3363742	3363753	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020272	TTCACA	2	12	3388500	3388511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020272	ATTGAT	2	12	3435245	3435256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020272	TTTAGA	2	12	3435257	3435268	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020272	TTTATC	2	12	3448860	3448871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020272	TTTTCT	2	12	3486147	3486158	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_020272	GAAAAA	2	12	3514362	3514373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020272	ATTATC	2	12	3546677	3546688	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020272	TGATAT	2	12	3597877	3597888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020272	ATCAAT	2	12	3606974	3606985	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_020272	TTTATC	2	12	3608381	3608392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020272	ATTCTC	2	12	3657102	3657113	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020272	GGCTGC	2	12	3658968	3658979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020272	ACTTTG	2	12	3700068	3700079	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_020272	ACCTCC	2	12	3819230	3819241	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_020272	TTGACT	2	12	3826474	3826485	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020272	CTCTAT	2	12	3826541	3826552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_020272	ATATGA	2	12	3863074	3863085	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020272	CAAAAA	2	12	3892319	3892330	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020272	ATTCAA	2	12	3911424	3911435	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.