MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45

Total Repeats: 3030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020272	CACAG	2	10	1451	1460	40 %	0 %	20 %	40 %	451344763
2	NC_020272	AGAAA	2	10	1927	1936	80 %	0 %	20 %	0 %	451344764
3	NC_020272	CAAAC	2	10	2607	2616	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_020272	GTGAT	2	10	3460	3469	20 %	40 %	40 %	0 %	451344765
5	NC_020272	TGGAA	2	10	6084	6093	40 %	20 %	40 %	0 %	451344767
6	NC_020272	CTGAA	2	10	8877	8886	40 %	20 %	20 %	20 %	451344770
7	NC_020272	TGTCA	2	10	10242	10251	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020272	TATTG	2	10	11166	11175	20 %	60 %	20 %	0 %	451344773
9	NC_020272	AGAGG	2	10	12391	12400	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020272	AGCGC	2	10	12830	12839	20 %	0 %	40 %	40 %	451344775
11	NC_020272	TCGTC	2	10	13975	13984	0 %	40 %	20 %	40 %	451344775
12	NC_020272	AATGG	2	10	14361	14370	40 %	20 %	40 %	0 %	451344775
13	NC_020272	CCGTT	2	10	15074	15083	0 %	40 %	20 %	40 %	451344776
14	NC_020272	TATAA	2	10	15672	15681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020272	CGGAG	2	10	15851	15860	20 %	0 %	60 %	20 %	451344777
16	NC_020272	ACTTC	2	10	16691	16700	20 %	40 %	0 %	40 %	451344779
17	NC_020272	GCTTT	2	10	17732	17741	0 %	60 %	20 %	20 %	451344781
18	NC_020272	GGAAG	2	10	19882	19891	40 %	0 %	60 %	0 %	451344783
19	NC_020272	CCGAT	2	10	21507	21516	20 %	20 %	20 %	40 %	451344785
20	NC_020272	AAGGA	2	10	21956	21965	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020272	TTTAC	2	10	24981	24990	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020272	AGTTT	2	10	24999	25008	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020272	ACTAG	2	10	25025	25034	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020272	AAAGT	2	10	25688	25697	60 %	20 %	20 %	0 %	451344789
25	NC_020272	AAAAT	2	10	26803	26812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020272	ATAAA	2	10	26865	26874	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020272	AAATG	2	10	28918	28927	60 %	20 %	20 %	0 %	451344792
28	NC_020272	TATAT	2	10	30227	30236	40 %	60 %	0 %	0 %	451344793
29	NC_020272	GAGAA	2	10	30626	30635	60 %	0 %	40 %	0 %	451344793
30	NC_020272	ACTTT	2	10	32405	32414	20 %	60 %	0 %	20 %	451344794
31	NC_020272	ATGGA	2	10	32530	32539	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020272	GAAAA	2	10	35548	35557	80 %	0 %	20 %	0 %	451344798
33	NC_020272	ATTTA	2	10	36289	36298	40 %	60 %	0 %	0 %	451344799
34	NC_020272	ACCAA	2	10	36310	36319	60 %	0 %	0 %	40 %	451344799
35	NC_020272	ATTTT	2	10	37678	37687	20 %	80 %	0 %	0 %	451344801
36	NC_020272	AAAGA	2	10	39160	39169	80 %	0 %	20 %	0 %	451344803
37	NC_020272	TGAAG	2	10	39301	39310	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020272	GAGAG	2	10	39313	39322	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020272	AGTTC	2	10	41011	41020	20 %	40 %	20 %	20 %	451344805
40	NC_020272	TGTAG	2	10	41169	41178	20 %	40 %	40 %	0 %	451344805
41	NC_020272	GCTTT	2	10	42761	42770	0 %	60 %	20 %	20 %	451344808
42	NC_020272	TTTTG	2	10	43666	43675	0 %	80 %	20 %	0 %	451344808
43	NC_020272	GTGTT	2	10	43727	43736	0 %	60 %	40 %	0 %	451344808
44	NC_020272	CTGTC	2	10	46611	46620	0 %	40 %	20 %	40 %	451344810
45	NC_020272	CATGC	2	10	49039	49048	20 %	20 %	20 %	40 %	451344813
46	NC_020272	CTTTG	2	10	49703	49712	0 %	60 %	20 %	20 %	451344815
47	NC_020272	TGTGC	2	10	49919	49928	0 %	40 %	40 %	20 %	451344815
48	NC_020272	AGAAA	2	10	50736	50745	80 %	0 %	20 %	0 %	451344816
49	NC_020272	ACAGA	2	10	51045	51054	60 %	0 %	20 %	20 %	451344816
50	NC_020272	GCGCA	2	10	53042	53051	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_020272	ATATT	2	10	53096	53105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020272	AGAAA	2	10	53407	53416	80 %	0 %	20 %	0 %	451344818
53	NC_020272	GCATG	2	10	54962	54971	20 %	20 %	40 %	20 %	451344820
54	NC_020272	GAAAA	2	10	55184	55193	80 %	0 %	20 %	0 %	451344820
55	NC_020272	CGGCT	2	10	55505	55514	0 %	20 %	40 %	40 %	451344820
56	NC_020272	ATCGA	2	10	55716	55725	40 %	20 %	20 %	20 %	451344820
57	NC_020272	TATCG	2	10	55873	55882	20 %	40 %	20 %	20 %	451344821
58	NC_020272	AAAGC	2	10	56108	56117	60 %	0 %	20 %	20 %	451344821
59	NC_020272	TCTCA	2	10	56893	56902	20 %	40 %	0 %	40 %	451344821
60	NC_020272	ATTCA	2	10	57659	57668	40 %	40 %	0 %	20 %	451344822
61	NC_020272	GGTTT	2	10	57697	57706	0 %	60 %	40 %	0 %	451344822
62	NC_020272	GAAGA	2	10	58920	58929	60 %	0 %	40 %	0 %	451344823
63	NC_020272	AAGGA	2	10	60545	60554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020272	TTCCG	2	10	60847	60856	0 %	40 %	20 %	40 %	451344828
65	NC_020272	TACTT	2	10	64515	64524	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020272	TATAG	2	10	64525	64534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020272	ATGAA	2	10	64918	64927	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020272	TTTAA	2	10	65014	65023	40 %	60 %	0 %	0 %	451344832
69	NC_020272	TTCTC	2	10	65787	65796	0 %	60 %	0 %	40 %	451344833
70	NC_020272	GCCGA	2	10	70070	70079	20 %	0 %	40 %	40 %	451344836
71	NC_020272	AGCTT	2	10	72143	72152	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020272	TCAAT	2	10	72599	72608	40 %	40 %	0 %	20 %	451344840
73	NC_020272	TGAAA	2	10	73416	73425	60 %	20 %	20 %	0 %	451344840
74	NC_020272	GCTGA	2	10	73462	73471	20 %	20 %	40 %	20 %	451344840
75	NC_020272	AACGG	2	10	73663	73672	40 %	0 %	40 %	20 %	451344840
76	NC_020272	TGAGC	2	10	76187	76196	20 %	20 %	40 %	20 %	451344842
77	NC_020272	GGCCG	2	10	77756	77765	0 %	0 %	60 %	40 %	451344844
78	NC_020272	ACGGG	2	10	79660	79669	20 %	0 %	60 %	20 %	451344845
79	NC_020272	CGCGC	2	10	79917	79926	0 %	0 %	40 %	60 %	451344845
80	NC_020272	TTCAT	2	10	80060	80069	20 %	60 %	0 %	20 %	451344846
81	NC_020272	ATCGA	2	10	80422	80431	40 %	20 %	20 %	20 %	451344846
82	NC_020272	TTTTC	2	10	80660	80669	0 %	80 %	0 %	20 %	451344846
83	NC_020272	CTGTT	2	10	81037	81046	0 %	60 %	20 %	20 %	451344846
84	NC_020272	AAAAC	2	10	86527	86536	80 %	0 %	0 %	20 %	451344851
85	NC_020272	TAATT	2	10	86880	86889	40 %	60 %	0 %	0 %	451344852
86	NC_020272	GAGAA	2	10	92165	92174	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020272	GGCGA	2	10	94679	94688	20 %	0 %	60 %	20 %	451344863
88	NC_020272	TTTGT	2	10	96108	96117	0 %	80 %	20 %	0 %	451344863
89	NC_020272	GTTTG	2	10	96191	96200	0 %	60 %	40 %	0 %	451344863
90	NC_020272	GTATT	2	10	96475	96484	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020272	AATTG	2	10	96510	96519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020272	CAGCT	2	10	98337	98346	20 %	20 %	20 %	40 %	451344866
93	NC_020272	TTAAT	2	10	98494	98503	40 %	60 %	0 %	0 %	451344867
94	NC_020272	AGAGA	2	10	100213	100222	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020272	ATCAA	2	10	102044	102053	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020272	TGAAT	2	10	102197	102206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020272	ATCCA	2	10	102544	102553	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_020272	AAGGA	2	10	103076	103085	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020272	TAATT	2	10	103161	103170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020272	CAAAA	2	10	103838	103847	80 %	0 %	0 %	20 %	451344869
101	NC_020272	TTTGG	2	10	103852	103861	0 %	60 %	40 %	0 %	451344869
102	NC_020272	CTTTT	2	10	103984	103993	0 %	80 %	0 %	20 %	451344869
103	NC_020272	AGATC	2	10	105698	105707	40 %	20 %	20 %	20 %	451344870
104	NC_020272	ACACC	2	10	107738	107747	40 %	0 %	0 %	60 %	451344872
105	NC_020272	TTTAT	2	10	108245	108254	20 %	80 %	0 %	0 %	451344872
106	NC_020272	AGTTG	2	10	108444	108453	20 %	40 %	40 %	0 %	451344872
107	NC_020272	GAAAA	2	10	108938	108947	80 %	0 %	20 %	0 %	451344873
108	NC_020272	AAGGA	2	10	109900	109909	60 %	0 %	40 %	0 %	451344874
109	NC_020272	TCTTT	2	10	110646	110655	0 %	80 %	0 %	20 %	451344875
110	NC_020272	TAAAA	2	10	112352	112361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020272	ATTTT	2	10	113382	113391	20 %	80 %	0 %	0 %	451344876
112	NC_020272	CAAAA	2	10	113594	113603	80 %	0 %	0 %	20 %	451344876
113	NC_020272	TTCAG	2	10	114482	114491	20 %	40 %	20 %	20 %	451344877
114	NC_020272	GATAT	2	10	117325	117334	40 %	40 %	20 %	0 %	451344880
115	NC_020272	TGTTT	2	10	119506	119515	0 %	80 %	20 %	0 %	451344883
116	NC_020272	TGTGG	2	10	119816	119825	0 %	40 %	60 %	0 %	451344883
117	NC_020272	GCTCC	2	10	120659	120668	0 %	20 %	20 %	60 %	451344884
118	NC_020272	TAAGG	2	10	122256	122265	40 %	20 %	40 %	0 %	451344885
119	NC_020272	ATGTG	2	10	122643	122652	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020272	GATTT	2	10	123261	123270	20 %	60 %	20 %	0 %	451344886
121	NC_020272	GACAT	2	10	124102	124111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020272	CCATT	2	10	124446	124455	20 %	40 %	0 %	40 %	451344887
123	NC_020272	TATTT	2	10	125360	125369	20 %	80 %	0 %	0 %	451344888
124	NC_020272	GCTGA	2	10	125930	125939	20 %	20 %	40 %	20 %	451344888
125	NC_020272	GAATT	2	10	126060	126069	40 %	40 %	20 %	0 %	451344888
126	NC_020272	CGGCC	2	10	127454	127463	0 %	0 %	40 %	60 %	451344890
127	NC_020272	TCTTA	2	10	128182	128191	20 %	60 %	0 %	20 %	451344891
128	NC_020272	GCGAT	2	10	128553	128562	20 %	20 %	40 %	20 %	451344892
129	NC_020272	CTTCT	2	10	129659	129668	0 %	60 %	0 %	40 %	451344892
130	NC_020272	TTCGG	2	10	134914	134923	0 %	40 %	40 %	20 %	451344896
131	NC_020272	GCATG	2	10	134936	134945	20 %	20 %	40 %	20 %	451344896
132	NC_020272	GACGA	2	10	136268	136277	40 %	0 %	40 %	20 %	451344897
133	NC_020272	CTGAT	2	10	138368	138377	20 %	40 %	20 %	20 %	451344899
134	NC_020272	GGATC	2	10	140019	140028	20 %	20 %	40 %	20 %	451344900
135	NC_020272	GATCA	2	10	145135	145144	40 %	20 %	20 %	20 %	451344905
136	NC_020272	TTAAT	2	10	146544	146553	40 %	60 %	0 %	0 %	451344907
137	NC_020272	AAAGC	2	10	149259	149268	60 %	0 %	20 %	20 %	451344909
138	NC_020272	CTTTC	2	10	149720	149729	0 %	60 %	0 %	40 %	451344909
139	NC_020272	GAAAG	2	10	150177	150186	60 %	0 %	40 %	0 %	451344910
140	NC_020272	GAGCT	2	10	154142	154151	20 %	20 %	40 %	20 %	451344917
141	NC_020272	TGATA	2	10	154706	154715	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020272	GAAAG	2	10	155609	155618	60 %	0 %	40 %	0 %	451344918
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150	NC_020272	CGTGA	2	10	161238	161247	20 %	20 %	40 %	20 %	451344923
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152	NC_020272	GGAAT	2	10	164765	164774	40 %	20 %	40 %	0 %	451344926
153	NC_020272	AAGAA	2	10	166747	166756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_020272	TAGTC	2	10	192198	192207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_020272	CCATT	2	10	285985	285994	20 %	40 %	0 %	40 %	451345055
254	NC_020272	GTTCA	2	10	287242	287251	20 %	40 %	20 %	20 %	451345056
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257	NC_020272	GTTCC	2	10	287981	287990	0 %	40 %	20 %	40 %	451345056
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262	NC_020272	ATTGT	2	10	301086	301095	20 %	60 %	20 %	0 %	451345069
263	NC_020272	GCTGC	2	10	301108	301117	0 %	20 %	40 %	40 %	451345069
264	NC_020272	TCTTA	2	10	301859	301868	20 %	60 %	0 %	20 %	451345069
265	NC_020272	AAAGC	2	10	302347	302356	60 %	0 %	20 %	20 %	451345070
266	NC_020272	TTCAT	2	10	303246	303255	20 %	60 %	0 %	20 %	451345070
267	NC_020272	CGAAA	2	10	303499	303508	60 %	0 %	20 %	20 %	451345071
268	NC_020272	TATGA	2	10	306005	306014	40 %	40 %	20 %	0 %	451345073
269	NC_020272	CGATT	2	10	307175	307184	20 %	40 %	20 %	20 %	451345075
270	NC_020272	CCGCG	2	10	307454	307463	0 %	0 %	40 %	60 %	451345075
271	NC_020272	AAATT	2	10	307894	307903	60 %	40 %	0 %	0 %	451345075
272	NC_020272	TTCTT	2	10	309285	309294	0 %	80 %	0 %	20 %	451345076
273	NC_020272	TCCTT	2	10	310739	310748	0 %	60 %	0 %	40 %	451345077
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277	NC_020272	AATTA	2	10	312583	312592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020272	CTGCA	2	10	313117	313126	20 %	20 %	20 %	40 %	451345080
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283	NC_020272	GTGAT	2	10	319025	319034	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020272	CACCG	2	10	321846	321855	20 %	0 %	20 %	60 %	451345091
285	NC_020272	ATTAT	2	10	322219	322228	40 %	60 %	0 %	0 %	451345091
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287	NC_020272	AAATC	2	10	322678	322687	60 %	20 %	0 %	20 %	451345091
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329	NC_020272	AGCGG	2	10	372455	372464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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374	NC_020272	TCGAT	2	10	436826	436835	20 %	40 %	20 %	20 %	451345223
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381	NC_020272	AATAT	2	10	442404	442413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_020272	AACAA	2	10	442575	442584	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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