MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw6 genomic sequence

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020268	TTC	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338639
2	NC_020268	ATG	2	6	74	79	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338639
3	NC_020268	TAG	2	6	144	149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338639
4	NC_020268	AGA	2	6	208	213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020268	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020268	TAA	2	6	374	379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338640
7	NC_020268	TAT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338640
8	NC_020268	TGA	2	6	449	454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338640
9	NC_020268	TGA	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338640
10	NC_020268	TAA	2	6	590	595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338640
11	NC_020268	TGA	2	6	650	655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338640
12	NC_020268	AGA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338640
13	NC_020268	AAT	2	6	754	759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338640
14	NC_020268	TTC	2	6	811	816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338641
15	NC_020268	TAA	2	6	883	888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338641
16	NC_020268	TGT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338641
17	NC_020268	ATA	2	6	1106	1111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338641
18	NC_020268	TCA	2	6	1190	1195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338641
19	NC_020268	ATT	2	6	1199	1204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338641
20	NC_020268	CTA	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338641
21	NC_020268	TTC	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338641
22	NC_020268	TTG	2	6	1392	1397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020268	AGG	2	6	1451	1456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020268	TAT	2	6	1464	1469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338642
25	NC_020268	TGA	2	6	1538	1543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338642
26	NC_020268	ATG	2	6	1706	1711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338642
27	NC_020268	GAA	2	6	1848	1853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338643
28	NC_020268	GAT	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338643
29	NC_020268	GAT	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338643
30	NC_020268	TGA	2	6	1997	2002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338643
31	NC_020268	GAA	2	6	2109	2114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338643
32	NC_020268	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338643
33	NC_020268	AGG	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020268	TTA	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338644
35	NC_020268	GAA	2	6	2315	2320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338644
36	NC_020268	AGA	2	6	2431	2436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338644
37	NC_020268	GTA	2	6	2442	2447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338644
38	NC_020268	TGA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338644
39	NC_020268	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338644
40	NC_020268	AAC	3	9	2625	2633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338644
41	NC_020268	AAT	2	6	2643	2648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338644
42	NC_020268	GAC	2	6	2698	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338645
43	NC_020268	TAT	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338645
44	NC_020268	ATA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338645
45	NC_020268	ATT	3	9	2739	2747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338645
46	NC_020268	GTT	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338645
47	NC_020268	ATT	2	6	2821	2826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338645
48	NC_020268	TTA	2	6	2844	2849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338645
49	NC_020268	ATA	2	6	2992	2997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338645
50	NC_020268	AAT	2	6	3062	3067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338645
51	NC_020268	GAT	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
52	NC_020268	AGT	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
53	NC_020268	TAT	2	6	3201	3206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338645
54	NC_020268	TGA	2	6	3506	3511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
55	NC_020268	ATA	2	6	3559	3564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338645
56	NC_020268	TGA	2	6	3596	3601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
57	NC_020268	AAT	2	6	3648	3653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338645
58	NC_020268	TGA	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
59	NC_020268	ATG	2	6	3702	3707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
60	NC_020268	TGA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
61	NC_020268	ACA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338645
62	NC_020268	TAG	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338645
63	NC_020268	GAA	2	6	4101	4106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020268	TTA	2	6	4299	4304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338646
65	NC_020268	ATT	2	6	4328	4333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338646
66	NC_020268	GTT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338646
67	NC_020268	ATT	2	6	4445	4450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338646
68	NC_020268	ATT	2	6	4532	4537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338646
69	NC_020268	GAA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020268	TGA	2	6	4951	4956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020268	ACA	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020268	TAA	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020268	GAA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020268	CAT	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020268	GAC	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020268	AGG	2	6	5180	5185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020268	ATT	2	6	5279	5284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338647
78	NC_020268	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338647
79	NC_020268	GTG	2	6	5360	5365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338647
80	NC_020268	TCA	2	6	5431	5436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338647
81	NC_020268	TTA	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338647
82	NC_020268	ATG	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338647
83	NC_020268	TAT	2	6	5645	5650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338647
84	NC_020268	GAA	2	6	5653	5658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338647
85	NC_020268	TTA	2	6	5660	5665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338647
86	NC_020268	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338647
87	NC_020268	GAT	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338647
88	NC_020268	ATT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338647
89	NC_020268	TAA	2	6	5784	5789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338647
90	NC_020268	GAA	2	6	5794	5799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338647
91	NC_020268	TAT	2	6	5802	5807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338647
92	NC_020268	ATA	3	9	5810	5818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338647
93	NC_020268	ATG	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338648

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.