MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw5 genomic sequence

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020267	TAA	2	6	91	96	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338616
2	NC_020267	ATT	2	6	124	129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338616
3	NC_020267	GCA	2	6	131	136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338616
4	NC_020267	CGT	2	6	161	166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338616
5	NC_020267	ATA	2	6	174	179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338616
6	NC_020267	AAT	2	6	186	191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338616
7	NC_020267	ATA	2	6	254	259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020267	TAA	2	6	288	293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338617
9	NC_020267	TTA	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338617
10	NC_020267	AGA	2	6	455	460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338617
11	NC_020267	AGT	2	6	478	483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338617
12	NC_020267	TTA	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338618
13	NC_020267	CTA	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338618
14	NC_020267	TCA	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338618
15	NC_020267	GAA	2	6	814	819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338618
16	NC_020267	TAT	2	6	836	841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338618
17	NC_020267	TGA	2	6	853	858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338618
18	NC_020267	TTA	2	6	975	980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338618
19	NC_020267	TTA	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338618
20	NC_020267	ATT	2	6	1016	1021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338618
21	NC_020267	TAA	2	6	1114	1119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338618
22	NC_020267	ATC	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338618
23	NC_020267	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338618
24	NC_020267	CTT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338619
25	NC_020267	TAG	2	6	1470	1475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338619
26	NC_020267	AAC	2	6	1522	1527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338619
27	NC_020267	ACA	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338619
28	NC_020267	TAT	3	9	1734	1742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338619
29	NC_020267	TAT	2	6	1754	1759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338619
30	NC_020267	TTA	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338619
31	NC_020267	AAG	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338620
32	NC_020267	TAG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338620
33	NC_020267	GCC	2	6	2097	2102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449338620
34	NC_020267	AAG	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338620
35	NC_020267	CTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338620
36	NC_020267	AGC	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338620
37	NC_020267	TAT	2	6	2264	2269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020267	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338621
39	NC_020267	ACG	2	6	2304	2309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338621
40	NC_020267	TAC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338621
41	NC_020267	TAA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338621
42	NC_020267	AGA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338621
43	NC_020267	ACC	2	6	2499	2504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338621
44	NC_020267	AGT	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338621
45	NC_020267	AAT	3	9	2543	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338621
46	NC_020267	CCA	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338621
47	NC_020267	GAT	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338621
48	NC_020267	ACC	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338621
49	NC_020267	TAG	2	6	2641	2646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338621
50	NC_020267	AAT	3	9	2690	2698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338621
51	NC_020267	TTA	2	6	2725	2730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338621
52	NC_020267	TAC	2	6	2755	2760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338621
53	NC_020267	TGG	2	6	2915	2920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338621
54	NC_020267	TAA	3	9	2921	2929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338621
55	NC_020267	CCT	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449338621
56	NC_020267	TTG	2	6	3019	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338621
57	NC_020267	AAT	2	6	3050	3055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338622
58	NC_020267	TTC	2	6	3097	3102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338622
59	NC_020267	CTA	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338622
60	NC_020267	ATA	2	6	3140	3145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338622
61	NC_020267	TCC	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449338622
62	NC_020267	ATC	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338622
63	NC_020267	TAT	2	6	3282	3287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338622
64	NC_020267	TAA	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020267	CAT	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020267	AGG	2	6	3422	3427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020267	GAA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338623
68	NC_020267	TTA	2	6	3562	3567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338623
69	NC_020267	AAC	3	9	3722	3730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338623
70	NC_020267	AGA	2	6	3759	3764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338623
71	NC_020267	GTT	2	6	3880	3885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338623
72	NC_020267	TAT	2	6	3984	3989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338623
73	NC_020267	AGA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338623
74	NC_020267	AAC	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338623
75	NC_020267	GCG	2	6	4058	4063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449338623
76	NC_020267	GCA	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338623
77	NC_020267	ATT	2	6	4090	4095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338623
78	NC_020267	ATG	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338623
79	NC_020267	AGA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338623
80	NC_020267	GAT	2	6	4426	4431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338623
81	NC_020267	ATT	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338624
82	NC_020267	TGA	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338624
83	NC_020267	TGA	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338624
84	NC_020267	GTG	2	6	4946	4951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338624
85	NC_020267	ATC	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338624
86	NC_020267	CAC	3	9	5240	5248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338624
87	NC_020267	AGG	2	6	5360	5365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338624
88	NC_020267	TGG	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338624
89	NC_020267	TCA	2	6	5420	5425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338624
90	NC_020267	GAT	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338624
91	NC_020267	AAT	2	6	5644	5649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338624
92	NC_020267	ATT	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338624
93	NC_020267	GAA	2	6	5861	5866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020267	AGT	2	6	5875	5880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020267	TAT	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020267	TAA	2	6	5964	5969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020267	ATG	2	6	6073	6078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020267	TTG	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338625
99	NC_020267	ATT	2	6	6179	6184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338625
100	NC_020267	CAT	2	6	6271	6276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338625
101	NC_020267	ACT	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338625
102	NC_020267	TAA	2	6	6320	6325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338625
103	NC_020267	AGC	2	6	6383	6388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020267	TCT	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020267	TTC	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338626
106	NC_020267	GCA	2	6	6748	6753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338626
107	NC_020267	ATT	2	6	6775	6780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338626
108	NC_020267	AAT	2	6	6868	6873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338626
109	NC_020267	CAA	2	6	6893	6898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338626
110	NC_020267	ATC	2	6	6903	6908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338626
111	NC_020267	TTG	2	6	6948	6953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338626
112	NC_020267	CAT	2	6	6959	6964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338626
113	NC_020267	ATA	2	6	7012	7017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338626
114	NC_020267	TTC	3	9	7122	7130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338626
115	NC_020267	TGC	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338626
116	NC_020267	ATT	2	6	7225	7230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338626
117	NC_020267	GAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338626
118	NC_020267	CAC	2	6	7352	7357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338626
119	NC_020267	TAC	2	6	7397	7402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338626
120	NC_020267	GAT	2	6	7508	7513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338626
121	NC_020267	TCT	2	6	7541	7546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338626
122	NC_020267	TAA	3	9	7632	7640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020267	TTC	2	6	7679	7684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020267	TAT	2	6	7708	7713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020267	CTA	2	6	7784	7789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020267	GAA	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020267	CAT	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020267	TAA	2	6	7993	7998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020267	TCT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020267	CTA	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338627
131	NC_020267	TCA	2	6	8184	8189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338627
132	NC_020267	TAT	2	6	8266	8271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338627
133	NC_020267	TGA	2	6	8283	8288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338627
134	NC_020267	GTG	2	6	8313	8318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338627
135	NC_020267	ATC	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338627
136	NC_020267	TTA	2	6	8405	8410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338627
137	NC_020267	TTA	2	6	8417	8422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338627
138	NC_020267	AAT	2	6	8490	8495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338627
139	NC_020267	ATC	2	6	8564	8569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338627
140	NC_020267	TAT	2	6	8904	8909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338628
141	NC_020267	ACC	2	6	8950	8955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338628
142	NC_020267	AAT	2	6	9030	9035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338628
143	NC_020267	TTA	2	6	9065	9070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338628
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145	NC_020267	CTT	2	6	9239	9244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_020267	TCT	2	6	9245	9250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020267	ATA	2	6	9251	9256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_020267	GTT	2	6	9351	9356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338629
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175	NC_020267	AAT	2	6	10629	10634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020267	TAA	2	6	10675	10680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020267	AAC	2	6	10765	10770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338631
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248	NC_020267	AGT	2	6	14769	14774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338633
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253	NC_020267	TAA	2	6	15210	15215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338635
254	NC_020267	ATA	2	6	15257	15262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338635
255	NC_020267	ATT	3	9	15313	15321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338635
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257	NC_020267	TAA	2	6	15444	15449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338635
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.