MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw4 genomic sequence

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020266	ATGT	2	8	53	60	25 %	50 %	25 %	0 %	449338591
2	NC_020266	TTAA	2	8	625	632	50 %	50 %	0 %	0 %	449338592
3	NC_020266	TTTA	2	8	714	721	25 %	75 %	0 %	0 %	449338592
4	NC_020266	TGCT	2	8	1496	1503	0 %	50 %	25 %	25 %	449338593
5	NC_020266	AAAG	2	8	2069	2076	75 %	0 %	25 %	0 %	449338593
6	NC_020266	CATT	2	8	2212	2219	25 %	50 %	0 %	25 %	449338593
7	NC_020266	TTAA	2	8	2251	2258	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
8	NC_020266	AATT	2	8	2291	2298	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
9	NC_020266	AAAG	2	8	2503	2510	75 %	0 %	25 %	0 %	449338593
10	NC_020266	ATTT	2	8	2545	2552	25 %	75 %	0 %	0 %	449338593
11	NC_020266	TGGA	2	8	2791	2798	25 %	25 %	50 %	0 %	449338593
12	NC_020266	ATTT	2	8	3311	3318	25 %	75 %	0 %	0 %	449338594
13	NC_020266	TCTT	2	8	3627	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020266	TGTT	2	8	3800	3807	0 %	75 %	25 %	0 %	449338595
15	NC_020266	AATT	2	8	4082	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	449338595
16	NC_020266	TACT	2	8	4339	4346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020266	AACG	2	8	4503	4510	50 %	0 %	25 %	25 %	449338596
18	NC_020266	ATCA	2	8	4906	4913	50 %	25 %	0 %	25 %	449338596
19	NC_020266	AAGT	2	8	5772	5779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020266	ACAG	2	8	6736	6743	50 %	0 %	25 %	25 %	449338597
21	NC_020266	TGGA	2	8	7481	7488	25 %	25 %	50 %	0 %	449338599
22	NC_020266	TTCC	2	8	8023	8030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020266	CATT	2	8	8153	8160	25 %	50 %	0 %	25 %	449338600
24	NC_020266	TAAT	2	8	8949	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	449338601
25	NC_020266	CATT	2	8	9311	9318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020266	ACTA	2	8	9397	9404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020266	CTTT	2	8	9447	9454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020266	TTTG	2	8	9727	9734	0 %	75 %	25 %	0 %	449338602
29	NC_020266	ACTT	2	8	9751	9758	25 %	50 %	0 %	25 %	449338602
30	NC_020266	CATC	2	8	9778	9785	25 %	25 %	0 %	50 %	449338602
31	NC_020266	CTTT	2	8	9913	9920	0 %	75 %	0 %	25 %	449338602
32	NC_020266	CTTG	2	8	9997	10004	0 %	50 %	25 %	25 %	449338602
33	NC_020266	TTAA	2	8	10545	10552	50 %	50 %	0 %	0 %	449338602
34	NC_020266	ACCA	2	8	10580	10587	50 %	0 %	0 %	50 %	449338602
35	NC_020266	GCAA	2	8	10625	10632	50 %	0 %	25 %	25 %	449338602
36	NC_020266	TGCT	2	8	10882	10889	0 %	50 %	25 %	25 %	449338602
37	NC_020266	GAAC	2	8	11142	11149	50 %	0 %	25 %	25 %	449338602
38	NC_020266	TCCA	2	8	11356	11363	25 %	25 %	0 %	50 %	449338602
39	NC_020266	CTGT	2	8	11950	11957	0 %	50 %	25 %	25 %	449338602
40	NC_020266	ATTT	2	8	12006	12013	25 %	75 %	0 %	0 %	449338602
41	NC_020266	ACTA	2	8	12146	12153	50 %	25 %	0 %	25 %	449338603
42	NC_020266	TTTA	2	8	12185	12192	25 %	75 %	0 %	0 %	449338603
43	NC_020266	AATA	2	8	12529	12536	75 %	25 %	0 %	0 %	449338604
44	NC_020266	TTTA	2	8	12856	12863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020266	ATTT	2	8	12871	12878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020266	ATTT	2	8	13127	13134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020266	TGAA	2	8	13415	13422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020266	CAAA	2	8	14732	14739	75 %	0 %	0 %	25 %	449338607
49	NC_020266	TCTT	2	8	15009	15016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020266	TATT	2	8	15101	15108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020266	TGCT	2	8	15587	15594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020266	TTTG	2	8	15790	15797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020266	ACTT	2	8	15864	15871	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020266	TCAA	2	8	16204	16211	50 %	25 %	0 %	25 %	449338609
55	NC_020266	TAAA	2	8	16225	16232	75 %	25 %	0 %	0 %	449338609
56	NC_020266	ATGA	2	8	16479	16486	50 %	25 %	25 %	0 %	449338609
57	NC_020266	TACA	2	8	16487	16494	50 %	25 %	0 %	25 %	449338609
58	NC_020266	TAAT	2	8	17221	17228	50 %	50 %	0 %	0 %	449338610
59	NC_020266	CATT	2	8	17295	17302	25 %	50 %	0 %	25 %	449338610
60	NC_020266	GAAT	2	8	17536	17543	50 %	25 %	25 %	0 %	449338611
61	NC_020266	ATCT	2	8	17617	17624	25 %	50 %	0 %	25 %	449338611
62	NC_020266	TGAA	2	8	17820	17827	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020266	ATTA	2	8	17983	17990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020266	AGAA	2	8	18252	18259	75 %	0 %	25 %	0 %	449338612
65	NC_020266	AAGA	2	8	18372	18379	75 %	0 %	25 %	0 %	449338612
66	NC_020266	TATC	2	8	18493	18500	25 %	50 %	0 %	25 %	449338612
67	NC_020266	TTAT	2	8	19024	19031	25 %	75 %	0 %	0 %	449338613
68	NC_020266	ACAT	2	8	19054	19061	50 %	25 %	0 %	25 %	449338613
69	NC_020266	AAGA	2	8	19288	19295	75 %	0 %	25 %	0 %	449338613
70	NC_020266	ACAT	2	8	19549	19556	50 %	25 %	0 %	25 %	449338614
71	NC_020266	AAGA	2	8	19783	19790	75 %	0 %	25 %	0 %	449338614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.