MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw4 genomic sequence

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020266	ATGT	2	8	53	60	25 %	50 %	25 %	0 %	449338591
2	NC_020266	TTAA	2	8	625	632	50 %	50 %	0 %	0 %	449338592
3	NC_020266	TTTA	2	8	714	721	25 %	75 %	0 %	0 %	449338592
4	NC_020266	TGCT	2	8	1496	1503	0 %	50 %	25 %	25 %	449338593
5	NC_020266	AAAG	2	8	2069	2076	75 %	0 %	25 %	0 %	449338593
6	NC_020266	CATT	2	8	2212	2219	25 %	50 %	0 %	25 %	449338593
7	NC_020266	TTAA	2	8	2251	2258	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
8	NC_020266	AATT	2	8	2291	2298	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
9	NC_020266	AAAG	2	8	2503	2510	75 %	0 %	25 %	0 %	449338593
10	NC_020266	ATTT	2	8	2545	2552	25 %	75 %	0 %	0 %	449338593
11	NC_020266	TGGA	2	8	2791	2798	25 %	25 %	50 %	0 %	449338593
12	NC_020266	ATTT	2	8	3311	3318	25 %	75 %	0 %	0 %	449338594
13	NC_020266	TGTT	2	8	3800	3807	0 %	75 %	25 %	0 %	449338595
14	NC_020266	AATT	2	8	4082	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	449338595
15	NC_020266	AACG	2	8	4503	4510	50 %	0 %	25 %	25 %	449338596
16	NC_020266	ATCA	2	8	4906	4913	50 %	25 %	0 %	25 %	449338596
17	NC_020266	ACAG	2	8	6736	6743	50 %	0 %	25 %	25 %	449338597
18	NC_020266	TGGA	2	8	7481	7488	25 %	25 %	50 %	0 %	449338599
19	NC_020266	CATT	2	8	8153	8160	25 %	50 %	0 %	25 %	449338600
20	NC_020266	TAAT	2	8	8949	8956	50 %	50 %	0 %	0 %	449338601
21	NC_020266	TTTG	2	8	9727	9734	0 %	75 %	25 %	0 %	449338602
22	NC_020266	ACTT	2	8	9751	9758	25 %	50 %	0 %	25 %	449338602
23	NC_020266	CATC	2	8	9778	9785	25 %	25 %	0 %	50 %	449338602
24	NC_020266	CTTT	2	8	9913	9920	0 %	75 %	0 %	25 %	449338602
25	NC_020266	CTTG	2	8	9997	10004	0 %	50 %	25 %	25 %	449338602
26	NC_020266	TTAA	2	8	10545	10552	50 %	50 %	0 %	0 %	449338602
27	NC_020266	ACCA	2	8	10580	10587	50 %	0 %	0 %	50 %	449338602
28	NC_020266	GCAA	2	8	10625	10632	50 %	0 %	25 %	25 %	449338602
29	NC_020266	TGCT	2	8	10882	10889	0 %	50 %	25 %	25 %	449338602
30	NC_020266	GAAC	2	8	11142	11149	50 %	0 %	25 %	25 %	449338602
31	NC_020266	TCCA	2	8	11356	11363	25 %	25 %	0 %	50 %	449338602
32	NC_020266	CTGT	2	8	11950	11957	0 %	50 %	25 %	25 %	449338602
33	NC_020266	ATTT	2	8	12006	12013	25 %	75 %	0 %	0 %	449338602
34	NC_020266	ACTA	2	8	12146	12153	50 %	25 %	0 %	25 %	449338603
35	NC_020266	TTTA	2	8	12185	12192	25 %	75 %	0 %	0 %	449338603
36	NC_020266	AATA	2	8	12529	12536	75 %	25 %	0 %	0 %	449338604
37	NC_020266	CAAA	2	8	14732	14739	75 %	0 %	0 %	25 %	449338607
38	NC_020266	TCAA	2	8	16204	16211	50 %	25 %	0 %	25 %	449338609
39	NC_020266	TAAA	2	8	16225	16232	75 %	25 %	0 %	0 %	449338609
40	NC_020266	ATGA	2	8	16479	16486	50 %	25 %	25 %	0 %	449338609
41	NC_020266	TACA	2	8	16487	16494	50 %	25 %	0 %	25 %	449338609
42	NC_020266	TAAT	2	8	17221	17228	50 %	50 %	0 %	0 %	449338610
43	NC_020266	CATT	2	8	17295	17302	25 %	50 %	0 %	25 %	449338610
44	NC_020266	GAAT	2	8	17536	17543	50 %	25 %	25 %	0 %	449338611
45	NC_020266	ATCT	2	8	17617	17624	25 %	50 %	0 %	25 %	449338611
46	NC_020266	AGAA	2	8	18252	18259	75 %	0 %	25 %	0 %	449338612
47	NC_020266	AAGA	2	8	18372	18379	75 %	0 %	25 %	0 %	449338612
48	NC_020266	TATC	2	8	18493	18500	25 %	50 %	0 %	25 %	449338612
49	NC_020266	TTAT	2	8	19024	19031	25 %	75 %	0 %	0 %	449338613
50	NC_020266	ACAT	2	8	19054	19061	50 %	25 %	0 %	25 %	449338613
51	NC_020266	AAGA	2	8	19288	19295	75 %	0 %	25 %	0 %	449338613
52	NC_020266	ACAT	2	8	19549	19556	50 %	25 %	0 %	25 %	449338614
53	NC_020266	AAGA	2	8	19783	19790	75 %	0 %	25 %	0 %	449338614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.