MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw4 genomic sequence

Total Repeats: 203

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020266	TCA	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338591
2	NC_020266	TAA	2	6	139	144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338591
3	NC_020266	TTC	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338591
4	NC_020266	ATG	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338591
5	NC_020266	TAG	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338591
6	NC_020266	CAT	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338592
7	NC_020266	TAT	2	6	647	652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338592
8	NC_020266	AGC	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338592
9	NC_020266	GTT	2	6	839	844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338592
10	NC_020266	CCA	2	6	859	864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338592
11	NC_020266	TAT	2	6	893	898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338592
12	NC_020266	ATC	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338592
13	NC_020266	TTA	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338592
14	NC_020266	TAA	2	6	1382	1387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
15	NC_020266	GTA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338593
16	NC_020266	TAA	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
17	NC_020266	AAT	2	6	1558	1563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
18	NC_020266	ACC	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338593
19	NC_020266	ATA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
20	NC_020266	TTA	2	6	1709	1714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
21	NC_020266	TTA	2	6	1741	1746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
22	NC_020266	TCT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338593
23	NC_020266	TAA	2	6	2118	2123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
24	NC_020266	TAT	2	6	2160	2165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
25	NC_020266	AGA	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338593
26	NC_020266	AAG	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338593
27	NC_020266	GAA	2	6	2472	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338593
28	NC_020266	CAT	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338593
29	NC_020266	ATG	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338593
30	NC_020266	TCT	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338593
31	NC_020266	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
32	NC_020266	TAA	2	6	2976	2981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
33	NC_020266	GGT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338593
34	NC_020266	TAT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
35	NC_020266	AAG	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
36	NC_020266	TCA	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338594
37	NC_020266	AGA	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
38	NC_020266	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338594
39	NC_020266	GAA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
40	NC_020266	GAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
41	NC_020266	TCT	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338595
42	NC_020266	TGC	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338595
43	NC_020266	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338595
44	NC_020266	TCA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338595
45	NC_020266	AAT	2	6	4034	4039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338595
46	NC_020266	AAT	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338595
47	NC_020266	GAG	2	6	4597	4602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338596
48	NC_020266	CAT	3	9	4731	4739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
49	NC_020266	TCA	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
50	NC_020266	CTT	2	6	4887	4892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338596
51	NC_020266	ATT	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338596
52	NC_020266	TTC	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338596
53	NC_020266	TAA	2	6	5002	5007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338596
54	NC_020266	ATT	2	6	5074	5079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338596
55	NC_020266	CAA	2	6	5130	5135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338596
56	NC_020266	TCA	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
57	NC_020266	TCC	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449338596
58	NC_020266	CAT	2	6	5284	5289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
59	NC_020266	AAT	2	6	5302	5307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338596
60	NC_020266	ATG	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338596
61	NC_020266	TGA	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338596
62	NC_020266	TAT	3	9	5941	5949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338597
63	NC_020266	CGG	2	6	5977	5982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449338597
64	NC_020266	TTA	2	6	5985	5990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338597
65	NC_020266	ACT	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338597
66	NC_020266	AGC	2	6	6133	6138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338597
67	NC_020266	ATT	2	6	6242	6247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338597
68	NC_020266	TAG	2	6	6252	6257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338597
69	NC_020266	TTA	2	6	6260	6265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338597
70	NC_020266	TTG	2	6	6273	6278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338597
71	NC_020266	AGA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338597
72	NC_020266	GCG	2	6	6330	6335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449338597
73	NC_020266	AGC	2	6	6385	6390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338597
74	NC_020266	TTA	2	6	6396	6401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338597
75	NC_020266	AGC	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338597
76	NC_020266	TAT	2	6	6541	6546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338597
77	NC_020266	GAT	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338597
78	NC_020266	TAA	2	6	6751	6756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338597
79	NC_020266	TCA	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338597
80	NC_020266	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338597
81	NC_020266	AGA	2	6	6790	6795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338597
82	NC_020266	GAT	2	6	6800	6805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338597
83	NC_020266	TCT	2	6	6886	6891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338598
84	NC_020266	AGT	2	6	7460	7465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338599
85	NC_020266	TCA	2	6	7512	7517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338599
86	NC_020266	CTT	3	9	7591	7599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338599
87	NC_020266	ATC	2	6	7658	7663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338599
88	NC_020266	CAA	2	6	7756	7761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338599
89	NC_020266	TAC	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338599
90	NC_020266	TTG	2	6	7811	7816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338599
91	NC_020266	TCT	2	6	7819	7824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338599
92	NC_020266	ATG	2	6	7866	7871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338599
93	NC_020266	TGT	2	6	7890	7895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338599
94	NC_020266	ATG	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338599
95	NC_020266	CTT	2	6	8229	8234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338600
96	NC_020266	TTC	2	6	8512	8517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338600
97	NC_020266	TCC	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449338600
98	NC_020266	GCA	2	6	8958	8963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338601
99	NC_020266	TAA	2	6	9644	9649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338602
100	NC_020266	CCA	2	6	9654	9659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338602
101	NC_020266	TAG	2	6	9745	9750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338602
102	NC_020266	CAT	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338602
103	NC_020266	TCT	2	6	9957	9962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338602
104	NC_020266	TTC	2	6	10340	10345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338602
105	NC_020266	GTT	2	6	10521	10526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338602
106	NC_020266	ACC	2	6	10538	10543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338602
107	NC_020266	ATA	2	6	10752	10757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338602
108	NC_020266	ATT	2	6	10812	10817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338602
109	NC_020266	TCA	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338602
110	NC_020266	ATC	2	6	11024	11029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338602
111	NC_020266	TCA	2	6	11040	11045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338602
112	NC_020266	CTT	2	6	11059	11064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338602
113	NC_020266	ATA	2	6	11201	11206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338602
114	NC_020266	AAT	2	6	11325	11330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338602
115	NC_020266	TAA	2	6	11396	11401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338602
116	NC_020266	TCA	2	6	11419	11424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338602
117	NC_020266	CAT	2	6	11456	11461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338602
118	NC_020266	CTG	2	6	11500	11505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338602
119	NC_020266	TCT	2	6	11589	11594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338602
120	NC_020266	TTG	2	6	11725	11730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338602
121	NC_020266	CTT	2	6	11833	11838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338602
122	NC_020266	TTG	2	6	11935	11940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338602
123	NC_020266	ATG	2	6	11962	11967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338602
124	NC_020266	GCT	2	6	12066	12071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338603
125	NC_020266	TCA	2	6	12099	12104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338603
126	NC_020266	TGA	2	6	12290	12295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338604
127	NC_020266	TAC	2	6	12445	12450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338604
128	NC_020266	TTA	2	6	12459	12464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338604
129	NC_020266	GTT	2	6	12491	12496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338604
130	NC_020266	CTT	2	6	12547	12552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338604
131	NC_020266	AAC	2	6	12680	12685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338604
132	NC_020266	CTA	2	6	13572	13577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338605
133	NC_020266	TGG	2	6	13628	13633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338605
134	NC_020266	CAA	2	6	13670	13675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338605
135	NC_020266	GAA	2	6	13709	13714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338605
136	NC_020266	CAA	2	6	13754	13759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338605
137	NC_020266	TAA	2	6	13817	13822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338605
138	NC_020266	TTA	2	6	13899	13904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338606
139	NC_020266	GAA	2	6	13942	13947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338606
140	NC_020266	CTG	2	6	14003	14008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338606
141	NC_020266	ATA	2	6	14029	14034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338606
142	NC_020266	TAC	2	6	14144	14149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338606
143	NC_020266	TGT	2	6	14225	14230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338606
144	NC_020266	TCA	2	6	14236	14241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338606
145	NC_020266	TTC	2	6	14351	14356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338606
146	NC_020266	CGT	2	6	14381	14386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338606
147	NC_020266	TAA	2	6	14532	14537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338606
148	NC_020266	TAA	2	6	14577	14582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338606
149	NC_020266	CAA	2	6	14593	14598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338606
150	NC_020266	CAG	2	6	14636	14641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338606
151	NC_020266	TTC	2	6	14799	14804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338607
152	NC_020266	TCA	2	6	14812	14817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338607
153	NC_020266	CTT	2	6	14831	14836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338607
154	NC_020266	ATC	2	6	14871	14876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338607
155	NC_020266	TGT	2	6	14878	14883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338607
156	NC_020266	TCA	2	6	14899	14904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338607
157	NC_020266	TGT	2	6	14908	14913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338607
158	NC_020266	TTC	2	6	14931	14936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338607
159	NC_020266	ATT	2	6	15193	15198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338608
160	NC_020266	CTT	3	9	15207	15215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338608
161	NC_020266	ATC	2	6	15232	15237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338608
162	NC_020266	TAC	2	6	15268	15273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338608
163	NC_020266	ATT	2	6	15346	15351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338608
164	NC_020266	ATG	2	6	16018	16023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338609
165	NC_020266	AAT	2	6	16074	16079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338609
166	NC_020266	TAG	2	6	16148	16153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338609
167	NC_020266	TAA	2	6	16235	16240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338609
168	NC_020266	CAA	2	6	16293	16298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338609
169	NC_020266	CAT	2	6	16392	16397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338609
170	NC_020266	AAT	2	6	16461	16466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338609
171	NC_020266	AAT	2	6	16509	16514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338609
172	NC_020266	ATC	2	6	16531	16536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338609
173	NC_020266	TAA	2	6	16550	16555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338609
174	NC_020266	GAA	2	6	16581	16586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338609
175	NC_020266	CAA	2	6	16593	16598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338609
176	NC_020266	ATT	2	6	16641	16646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338609
177	NC_020266	TAA	2	6	16679	16684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338609
178	NC_020266	AGA	2	6	16709	16714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338609
179	NC_020266	TGC	2	6	16759	16764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338609
180	NC_020266	GAA	2	6	16830	16835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338609
181	NC_020266	ACA	2	6	16871	16876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338609
182	NC_020266	CAA	2	6	17250	17255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338610
183	NC_020266	TCT	2	6	17279	17284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338610
184	NC_020266	GAT	2	6	17580	17585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338611
185	NC_020266	CTT	2	6	17711	17716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338611
186	NC_020266	ATC	2	6	18028	18033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338612
187	NC_020266	AAG	2	6	18144	18149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338612
188	NC_020266	ATG	2	6	18216	18221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338612
189	NC_020266	TGA	2	6	18267	18272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338612
190	NC_020266	ATG	2	6	18287	18292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338612
191	NC_020266	ATT	2	6	18313	18318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338612
192	NC_020266	GAC	2	6	18444	18449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338612
193	NC_020266	TAT	2	6	18453	18458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338612
194	NC_020266	AAG	2	6	18552	18557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338612
195	NC_020266	GAT	2	6	18602	18607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338612
196	NC_020266	TAA	2	6	18614	18619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338612
197	NC_020266	CTA	2	6	18820	18825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338613
198	NC_020266	GTG	2	6	18876	18881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338613
199	NC_020266	TCA	2	6	18889	18894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338613
200	NC_020266	GAA	2	6	18949	18954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338613
201	NC_020266	TTA	2	6	18970	18975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338613
202	NC_020266	TGA	2	6	18988	18993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338613
203	NC_020266	CAT	2	6	19420	19425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338613

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.