MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw4 genomic sequence

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020266	AT	3	6	257	262	50 %	50 %	0 %	0 %	449338591
2	NC_020266	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
3	NC_020266	AT	3	6	1899	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
4	NC_020266	AT	3	6	1956	1961	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
5	NC_020266	AT	3	6	2201	2206	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
6	NC_020266	TA	3	6	3270	3275	50 %	50 %	0 %	0 %	449338594
7	NC_020266	TA	3	6	3661	3666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020266	AT	3	6	3739	3744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020266	TA	3	6	3775	3780	50 %	50 %	0 %	0 %	449338595
10	NC_020266	TC	3	6	4380	4385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020266	TG	3	6	5054	5059	0 %	50 %	50 %	0 %	449338596
12	NC_020266	TA	3	6	5541	5546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020266	AT	3	6	5586	5591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020266	AT	3	6	5594	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020266	AT	3	6	5604	5609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020266	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020266	CA	3	6	5900	5905	50 %	0 %	0 %	50 %	449338597
18	NC_020266	TC	3	6	7146	7151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020266	AT	3	6	7169	7174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020266	TA	4	8	7252	7259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020266	TA	3	6	8530	8535	50 %	50 %	0 %	0 %	449338600
22	NC_020266	GC	3	6	8919	8924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020266	TC	3	6	9040	9045	0 %	50 %	0 %	50 %	449338601
24	NC_020266	AT	3	6	10192	10197	50 %	50 %	0 %	0 %	449338602
25	NC_020266	TA	3	6	13086	13091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020266	AT	3	6	13956	13961	50 %	50 %	0 %	0 %	449338606
27	NC_020266	CT	3	6	14791	14796	0 %	50 %	0 %	50 %	449338607
28	NC_020266	CT	3	6	15055	15060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020266	TA	3	6	15137	15142	50 %	50 %	0 %	0 %	449338608
30	NC_020266	TA	3	6	15153	15158	50 %	50 %	0 %	0 %	449338608
31	NC_020266	TA	3	6	15428	15433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020266	TA	3	6	15451	15456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020266	TA	3	6	15528	15533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020266	TA	3	6	15563	15568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020266	TA	3	6	15686	15691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020266	AT	4	8	15728	15735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020266	TA	3	6	15800	15805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020266	TA	4	8	15822	15829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020266	AT	3	6	16099	16104	50 %	50 %	0 %	0 %	449338609
40	NC_020266	TA	3	6	16243	16248	50 %	50 %	0 %	0 %	449338609
41	NC_020266	TA	3	6	16446	16451	50 %	50 %	0 %	0 %	449338609
42	NC_020266	GT	3	6	16651	16656	0 %	50 %	50 %	0 %	449338609
43	NC_020266	GT	3	6	16735	16740	0 %	50 %	50 %	0 %	449338609
44	NC_020266	TA	3	6	17393	17398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020266	AT	3	6	17883	17888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020266	TA	3	6	18435	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	449338612
47	NC_020266	AT	3	6	18852	18857	50 %	50 %	0 %	0 %	449338613
48	NC_020266	TA	3	6	19359	19364	50 %	50 %	0 %	0 %	449338613
49	NC_020266	TA	3	6	19854	19859	50 %	50 %	0 %	0 %	449338614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.