MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020264	ATG	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
2	NC_020264	TCA	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338575
3	NC_020264	TAA	2	6	523	528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338575
4	NC_020264	TTC	2	6	544	549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338575
5	NC_020264	ATG	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
6	NC_020264	TAG	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
7	NC_020264	ATT	2	6	1058	1063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338576
8	NC_020264	TCT	3	9	1066	1074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338576
9	NC_020264	CAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338576
10	NC_020264	AGT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338576
11	NC_020264	TGA	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338577
12	NC_020264	ATG	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338577
13	NC_020264	TTC	2	6	2152	2157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338578
14	NC_020264	CTA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
15	NC_020264	TAT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
16	NC_020264	TAA	2	6	2346	2351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338578
17	NC_020264	TTA	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
18	NC_020264	CGT	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338578
19	NC_020264	TCT	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338578
20	NC_020264	ATT	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
21	NC_020264	CAT	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
22	NC_020264	CTA	2	6	2723	2728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
23	NC_020264	TCA	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
24	NC_020264	TAA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338579
25	NC_020264	TAT	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338579
26	NC_020264	ATC	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338580
27	NC_020264	TGT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338580
28	NC_020264	ATA	2	6	4629	4634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338581
29	NC_020264	TTC	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338582
30	NC_020264	ATC	2	6	6473	6478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338582
31	NC_020264	ATA	2	6	6743	6748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
32	NC_020264	ACA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338583
33	NC_020264	ATC	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338583
34	NC_020264	GAA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
35	NC_020264	TAA	2	6	6970	6975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
36	NC_020264	GAT	2	6	7073	7078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338583
37	NC_020264	GAA	2	6	7085	7090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
38	NC_020264	TAT	3	9	7114	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338583
39	NC_020264	CAA	2	6	7149	7154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338583
40	NC_020264	TAA	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
41	NC_020264	TGA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338583
42	NC_020264	TAA	2	6	7246	7251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
43	NC_020264	AAG	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
44	NC_020264	ATA	2	6	7335	7340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
45	NC_020264	ATC	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338583
46	NC_020264	AAG	2	6	7380	7385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
47	NC_020264	TAA	2	6	7678	7683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338584
48	NC_020264	CAT	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338584
49	NC_020264	GAA	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338584
50	NC_020264	AAT	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338584
51	NC_020264	TCA	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338584

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.