MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020263	GCCGCA	2	12	4123	4134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	449306433
2	NC_020263	ATGCAT	2	12	5175	5186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449306434
3	NC_020263	GTAGCG	2	12	5757	5768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020263	CTGGCG	2	12	7096	7107	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020263	GTTATC	2	12	12160	12171	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449306443
6	NC_020263	GTGCTG	2	12	12373	12384	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	449306443
7	NC_020263	CAGACG	2	12	16216	16227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306445
8	NC_020263	AGCCTG	2	12	17947	17958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020263	GTGTGG	2	12	18818	18829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306448
10	NC_020263	TGGCAG	2	12	19991	20002	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449306449
11	NC_020263	TGCTGA	2	12	21795	21806	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449306451
12	NC_020263	TGGCGC	2	12	22351	22362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	449306452
13	NC_020263	CCAGAT	2	12	24221	24232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	449306454
14	NC_020263	GCGTGC	2	12	32026	32037	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020263	GGCGCA	2	12	38564	38575	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	449306471
16	NC_020263	CGATGG	2	12	41498	41509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449306475
17	NC_020263	GCGCTG	2	12	41791	41802	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	449306475
18	NC_020263	GCGAAA	2	12	44706	44717	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449306478
19	NC_020263	ACCAGC	2	12	47971	47982	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	449306481
20	NC_020263	AACCAG	2	12	48621	48632	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	449306481
21	NC_020263	GTAAAG	2	12	49641	49652	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	449306483
22	NC_020263	AAGCTG	2	12	50216	50227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449306484
23	NC_020263	GAGCTG	2	12	54928	54939	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449306486
24	NC_020263	TGCCGA	2	12	63311	63322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449306498
25	NC_020263	TCGGCA	2	12	68636	68647	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449306503
26	NC_020263	GCACCA	2	12	68684	68695	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	449306503
27	NC_020263	CGGCTT	2	12	72277	72288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306505
28	NC_020263	CCCGCT	2	12	73386	73397	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	449306505
29	NC_020263	GCCATT	2	12	78864	78875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	449306510
30	NC_020263	AGCCAC	2	12	82252	82263	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020263	CTGGCG	2	12	83930	83941	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	449306513
32	NC_020263	CAGCGC	2	12	86913	86924	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	449306515
33	NC_020263	ATTGTC	2	12	87412	87423	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020263	CAGCGC	2	12	90071	90082	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	449306516
35	NC_020263	GCGCCT	2	12	92345	92356	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020263	TGACGC	2	12	93019	93030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	449306519
37	NC_020263	CACCGT	2	12	93053	93064	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	449306519
38	NC_020263	TGCCGG	2	12	96588	96599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	449306520
39	NC_020263	TCTCCC	2	12	97544	97555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020263	CAGCCC	2	12	99891	99902	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	449306521
41	NC_020263	CAGCGA	2	12	103408	103419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306523
42	NC_020263	ACGGTT	2	12	107957	107968	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	449306528
43	NC_020263	CGCAGG	2	12	108149	108160	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	449306528
44	NC_020263	GTGGCA	2	12	109544	109555	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449306529
45	NC_020263	GCTGGA	2	12	111652	111663	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	449306530
46	NC_020263	CATTAA	2	12	113651	113662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449306531
47	NC_020263	GATCGA	2	12	116403	116414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449306534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.