MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020263	CTGGT	2	10	3220	3229	0 %	40 %	40 %	20 %	449306432
2	NC_020263	TTCGC	2	10	4819	4828	0 %	40 %	20 %	40 %	449306434
3	NC_020263	TGGCG	2	10	4838	4847	0 %	20 %	60 %	20 %	449306434
4	NC_020263	CAAAA	2	10	6861	6870	80 %	0 %	0 %	20 %	449306435
5	NC_020263	TTTAC	2	10	8223	8232	20 %	60 %	0 %	20 %	449306437
6	NC_020263	ACGGC	2	10	8739	8748	20 %	0 %	40 %	40 %	449306438
7	NC_020263	TCAGT	2	10	12441	12450	20 %	40 %	20 %	20 %	449306443
8	NC_020263	GGCAG	2	10	13992	14001	20 %	0 %	60 %	20 %	449306444
9	NC_020263	GGCGA	2	10	14500	14509	20 %	0 %	60 %	20 %	449306444
10	NC_020263	CTGGC	2	10	14676	14685	0 %	20 %	40 %	40 %	449306445
11	NC_020263	CGTGA	2	10	16591	16600	20 %	20 %	40 %	20 %	449306445
12	NC_020263	TGCGC	2	10	18212	18221	0 %	20 %	40 %	40 %	449306447
13	NC_020263	GTGGG	2	10	20073	20082	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020263	GCGCC	2	10	24553	24562	0 %	0 %	40 %	60 %	449306455
15	NC_020263	GGCTG	2	10	25087	25096	0 %	20 %	60 %	20 %	449306455
16	NC_020263	GCCGC	2	10	26044	26053	0 %	0 %	40 %	60 %	449306457
17	NC_020263	CGTCG	2	10	28020	28029	0 %	20 %	40 %	40 %	449306461
18	NC_020263	GCCTG	2	10	28961	28970	0 %	20 %	40 %	40 %	449306461
19	NC_020263	TGCTC	2	10	31549	31558	0 %	40 %	20 %	40 %	449306463
20	NC_020263	ACGGC	2	10	33899	33908	20 %	0 %	40 %	40 %	449306467
21	NC_020263	ACAAA	2	10	37233	37242	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020263	TGGCG	2	10	38390	38399	0 %	20 %	60 %	20 %	449306471
23	NC_020263	GAATG	2	10	38890	38899	40 %	20 %	40 %	0 %	449306472
24	NC_020263	CGCAC	2	10	39767	39776	20 %	0 %	20 %	60 %	449306473
25	NC_020263	GCGCA	2	10	43636	43645	20 %	0 %	40 %	40 %	449306477
26	NC_020263	CTTTT	2	10	45531	45540	0 %	80 %	0 %	20 %	449306479
27	NC_020263	GCGCT	2	10	46486	46495	0 %	20 %	40 %	40 %	449306479
28	NC_020263	CGAGG	2	10	48108	48117	20 %	0 %	60 %	20 %	449306481
29	NC_020263	GCGCC	2	10	48320	48329	0 %	0 %	40 %	60 %	449306481
30	NC_020263	CAGCG	2	10	49391	49400	20 %	0 %	40 %	40 %	449306483
31	NC_020263	GGACG	2	10	50949	50958	20 %	0 %	60 %	20 %	449306484
32	NC_020263	ACGGT	2	10	52066	52075	20 %	20 %	40 %	20 %	449306485
33	NC_020263	GTATT	2	10	52468	52477	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020263	GGACA	2	10	55508	55517	40 %	0 %	40 %	20 %	449306487
35	NC_020263	CGGTG	2	10	57163	57172	0 %	20 %	60 %	20 %	449306490
36	NC_020263	CGGGC	2	10	57927	57936	0 %	0 %	60 %	40 %	449306491
37	NC_020263	GCGAG	2	10	58418	58427	20 %	0 %	60 %	20 %	449306491
38	NC_020263	AAAAC	2	10	61845	61854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020263	TGACG	2	10	63962	63971	20 %	20 %	40 %	20 %	449306499
40	NC_020263	GGTTT	2	10	65438	65447	0 %	60 %	40 %	0 %	449306500
41	NC_020263	GCCCG	2	10	66066	66075	0 %	0 %	40 %	60 %	449306500
42	NC_020263	CGGCG	2	10	68781	68790	0 %	0 %	60 %	40 %	449306503
43	NC_020263	GCTCT	2	10	73173	73182	0 %	40 %	20 %	40 %	449306505
44	NC_020263	CATGG	2	10	73308	73317	20 %	20 %	40 %	20 %	449306505
45	NC_020263	TGCGG	2	10	74349	74358	0 %	20 %	60 %	20 %	449306505
46	NC_020263	CCGGT	2	10	74706	74715	0 %	20 %	40 %	40 %	449306505
47	NC_020263	TGCGT	2	10	75290	75299	0 %	40 %	40 %	20 %	449306506
48	NC_020263	AGAGA	2	10	75813	75822	60 %	0 %	40 %	0 %	449306507
49	NC_020263	TTCCA	2	10	76016	76025	20 %	40 %	0 %	40 %	449306507
50	NC_020263	CGGCG	2	10	76662	76671	0 %	0 %	60 %	40 %	449306509
51	NC_020263	CGCGC	2	10	76678	76687	0 %	0 %	40 %	60 %	449306509
52	NC_020263	CGCGC	2	10	77782	77791	0 %	0 %	40 %	60 %	449306509
53	NC_020263	CCTGA	2	10	78017	78026	20 %	20 %	20 %	40 %	449306509
54	NC_020263	CGACC	2	10	79379	79388	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_020263	GGTCA	2	10	79878	79887	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020263	CCCGC	2	10	81803	81812	0 %	0 %	20 %	80 %	449306511
57	NC_020263	CCTGC	2	10	84064	84073	0 %	20 %	20 %	60 %	449306513
58	NC_020263	TTCTC	2	10	84457	84466	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_020263	ATTTT	2	10	85590	85599	20 %	80 %	0 %	0 %	449306514
60	NC_020263	CAGAG	2	10	86753	86762	40 %	0 %	40 %	20 %	449306515
61	NC_020263	GCGCG	2	10	87823	87832	0 %	0 %	60 %	40 %	449306516
62	NC_020263	CCTGC	2	10	90025	90034	0 %	20 %	20 %	60 %	449306516
63	NC_020263	GTAAA	2	10	90705	90714	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020263	GCCCT	2	10	94446	94455	0 %	20 %	20 %	60 %	449306519
65	NC_020263	GTCTC	2	10	94972	94981	0 %	40 %	20 %	40 %	449306519
66	NC_020263	GCTTC	2	10	98312	98321	0 %	40 %	20 %	40 %	449306521
67	NC_020263	CCGGC	2	10	99323	99332	0 %	0 %	40 %	60 %	449306521
68	NC_020263	CCCTC	2	10	100429	100438	0 %	20 %	0 %	80 %	449306522
69	NC_020263	CCGCG	2	10	102195	102204	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_020263	GCCCG	2	10	102721	102730	0 %	0 %	40 %	60 %	449306523
71	NC_020263	CCTGC	2	10	103426	103435	0 %	20 %	20 %	60 %	449306523
72	NC_020263	CGCAG	2	10	104772	104781	20 %	0 %	40 %	40 %	449306525
73	NC_020263	TGCGC	2	10	106352	106361	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_020263	CGCGC	2	10	106721	106730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_020263	CGCTG	2	10	106735	106744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_020263	CGCGC	2	10	108417	108426	0 %	0 %	40 %	60 %	449306528
77	NC_020263	GGCCG	2	10	108447	108456	0 %	0 %	60 %	40 %	449306528
78	NC_020263	GGCGC	2	10	108647	108656	0 %	0 %	60 %	40 %	449306528
79	NC_020263	CTCGC	2	10	109767	109776	0 %	20 %	20 %	60 %	449306529
80	NC_020263	TTACC	2	10	110564	110573	20 %	40 %	0 %	40 %	449306529
81	NC_020263	CACGT	2	10	111039	111048	20 %	20 %	20 %	40 %	449306530
82	NC_020263	CTCAG	2	10	111777	111786	20 %	20 %	20 %	40 %	449306530
83	NC_020263	TGCCG	2	10	113342	113351	0 %	20 %	40 %	40 %	449306531
84	NC_020263	TTCTG	2	10	114148	114157	0 %	60 %	20 %	20 %	449306531
85	NC_020263	CCACA	2	10	114165	114174	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
86	NC_020263	TGCGG	2	10	114565	114574	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020263	AAAAT	2	10	116114	116123	80 %	20 %	0 %	0 %	449306534
88	NC_020263	CAGGA	2	10	117691	117700	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.