MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-1

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020263	GCGG	2	8	395	402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020263	TGCC	2	8	467	474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020263	TCGC	2	8	1319	1326	0 %	25 %	25 %	50 %	449306430
4	NC_020263	GCGT	2	8	2063	2070	0 %	25 %	50 %	25 %	449306431
5	NC_020263	CTGG	2	8	2607	2614	0 %	25 %	50 %	25 %	449306432
6	NC_020263	TCGC	2	8	3072	3079	0 %	25 %	25 %	50 %	449306432
7	NC_020263	TTAA	2	8	3445	3452	50 %	50 %	0 %	0 %	449306432
8	NC_020263	CACG	2	8	3700	3707	25 %	0 %	25 %	50 %	449306433
9	NC_020263	CAGC	2	8	3998	4005	25 %	0 %	25 %	50 %	449306433
10	NC_020263	TGCG	2	8	4447	4454	0 %	25 %	50 %	25 %	449306434
11	NC_020263	CCTG	2	8	4463	4470	0 %	25 %	25 %	50 %	449306434
12	NC_020263	TCAG	2	8	6148	6155	25 %	25 %	25 %	25 %	449306435
13	NC_020263	GACC	2	8	6314	6321	25 %	0 %	25 %	50 %	449306435
14	NC_020263	ATCA	2	8	7262	7269	50 %	25 %	0 %	25 %	449306436
15	NC_020263	GACG	2	8	7633	7640	25 %	0 %	50 %	25 %	449306436
16	NC_020263	GACC	2	8	10903	10910	25 %	0 %	25 %	50 %	449306441
17	NC_020263	GGCT	2	8	11315	11322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020263	CTGC	2	8	11956	11963	0 %	25 %	25 %	50 %	449306442
19	NC_020263	GCCA	2	8	12084	12091	25 %	0 %	25 %	50 %	449306442
20	NC_020263	TCGC	2	8	12142	12149	0 %	25 %	25 %	50 %	449306443
21	NC_020263	GCCC	2	8	12424	12431	0 %	0 %	25 %	75 %	449306443
22	NC_020263	TCCG	2	8	12687	12694	0 %	25 %	25 %	50 %	449306443
23	NC_020263	TCGC	2	8	12769	12776	0 %	25 %	25 %	50 %	449306443
24	NC_020263	GGCA	2	8	12870	12877	25 %	0 %	50 %	25 %	449306443
25	NC_020263	GGCG	2	8	12988	12995	0 %	0 %	75 %	25 %	449306443
26	NC_020263	CGCC	2	8	13122	13129	0 %	0 %	25 %	75 %	449306443
27	NC_020263	GCCA	2	8	13258	13265	25 %	0 %	25 %	50 %	449306443
28	NC_020263	ACGA	2	8	13303	13310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020263	TCTT	2	8	13432	13439	0 %	75 %	0 %	25 %	449306444
30	NC_020263	GACC	2	8	13509	13516	25 %	0 %	25 %	50 %	449306444
31	NC_020263	TTGC	2	8	13696	13703	0 %	50 %	25 %	25 %	449306444
32	NC_020263	CTCA	2	8	14121	14128	25 %	25 %	0 %	50 %	449306444
33	NC_020263	GGCG	2	8	14457	14464	0 %	0 %	75 %	25 %	449306444
34	NC_020263	TGAC	2	8	14693	14700	25 %	25 %	25 %	25 %	449306445
35	NC_020263	GTGA	2	8	15136	15143	25 %	25 %	50 %	0 %	449306445
36	NC_020263	GGCA	2	8	15660	15667	25 %	0 %	50 %	25 %	449306445
37	NC_020263	GGCG	2	8	15768	15775	0 %	0 %	75 %	25 %	449306445
38	NC_020263	GGTT	2	8	15867	15874	0 %	50 %	50 %	0 %	449306445
39	NC_020263	GCTG	2	8	16028	16035	0 %	25 %	50 %	25 %	449306445
40	NC_020263	ATCG	2	8	16276	16283	25 %	25 %	25 %	25 %	449306445
41	NC_020263	GGCG	2	8	17040	17047	0 %	0 %	75 %	25 %	449306445
42	NC_020263	TGAT	2	8	17807	17814	25 %	50 %	25 %	0 %	449306446
43	NC_020263	GTCG	2	8	18042	18049	0 %	25 %	50 %	25 %	449306447
44	NC_020263	AAAG	2	8	18810	18817	75 %	0 %	25 %	0 %	449306448
45	NC_020263	CGTG	2	8	18872	18879	0 %	25 %	50 %	25 %	449306448
46	NC_020263	GGCT	2	8	19012	19019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020263	TGCC	2	8	19848	19855	0 %	25 %	25 %	50 %	449306449
48	NC_020263	AGAA	2	8	19925	19932	75 %	0 %	25 %	0 %	449306449
49	NC_020263	TGAA	2	8	20315	20322	50 %	25 %	25 %	0 %	449306450
50	NC_020263	GCCC	2	8	20346	20353	0 %	0 %	25 %	75 %	449306450
51	NC_020263	CAGC	2	8	21472	21479	25 %	0 %	25 %	50 %	449306451
52	NC_020263	GGTG	2	8	21868	21875	0 %	25 %	75 %	0 %	449306451
53	NC_020263	TCCT	2	8	22016	22023	0 %	50 %	0 %	50 %	449306451
54	NC_020263	TCGC	2	8	22100	22107	0 %	25 %	25 %	50 %	449306451
55	NC_020263	CGGT	2	8	23049	23056	0 %	25 %	50 %	25 %	449306452
56	NC_020263	TATG	2	8	24516	24523	25 %	50 %	25 %	0 %	449306455
57	NC_020263	GCAC	2	8	24859	24866	25 %	0 %	25 %	50 %	449306455
58	NC_020263	TGGC	2	8	25509	25516	0 %	25 %	50 %	25 %	449306457
59	NC_020263	GCGG	2	8	25551	25558	0 %	0 %	75 %	25 %	449306457
60	NC_020263	GCCA	2	8	25842	25849	25 %	0 %	25 %	50 %	449306457
61	NC_020263	TCCA	2	8	25883	25890	25 %	25 %	0 %	50 %	449306457
62	NC_020263	GGCT	2	8	26314	26321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020263	GTCG	2	8	26481	26488	0 %	25 %	50 %	25 %	449306458
64	NC_020263	ATTT	2	8	27523	27530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020263	CTAT	2	8	27951	27958	25 %	50 %	0 %	25 %	449306461
66	NC_020263	GTCA	2	8	28261	28268	25 %	25 %	25 %	25 %	449306461
67	NC_020263	CCAG	2	8	28729	28736	25 %	0 %	25 %	50 %	449306461
68	NC_020263	GTGA	2	8	29210	29217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020263	CGGC	2	8	29510	29517	0 %	0 %	50 %	50 %	449306462
70	NC_020263	GATG	2	8	29647	29654	25 %	25 %	50 %	0 %	449306462
71	NC_020263	CGCC	2	8	29749	29756	0 %	0 %	25 %	75 %	449306462
72	NC_020263	CAGC	2	8	30079	30086	25 %	0 %	25 %	50 %	449306463
73	NC_020263	CGCC	2	8	30175	30182	0 %	0 %	25 %	75 %	449306463
74	NC_020263	CGCC	2	8	30523	30530	0 %	0 %	25 %	75 %	449306463
75	NC_020263	GGTT	2	8	32152	32159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020263	CATT	2	8	32365	32372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020263	ATTC	2	8	32373	32380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020263	CGCT	2	8	32654	32661	0 %	25 %	25 %	50 %	449306464
79	NC_020263	TGGA	2	8	32726	32733	25 %	25 %	50 %	0 %	449306464
80	NC_020263	GATG	2	8	34239	34246	25 %	25 %	50 %	0 %	449306468
81	NC_020263	GGCG	2	8	34506	34513	0 %	0 %	75 %	25 %	449306468
82	NC_020263	GGCT	2	8	34738	34745	0 %	25 %	50 %	25 %	449306468
83	NC_020263	ACGA	2	8	35838	35845	50 %	0 %	25 %	25 %	449306470
84	NC_020263	ATCA	2	8	36602	36609	50 %	25 %	0 %	25 %	449306470
85	NC_020263	GGCG	2	8	36896	36903	0 %	0 %	75 %	25 %	449306470
86	NC_020263	AAAT	2	8	37353	37360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020263	CCCG	2	8	37486	37493	0 %	0 %	25 %	75 %	449306471
88	NC_020263	CGCT	2	8	37576	37583	0 %	25 %	25 %	50 %	449306471
89	NC_020263	TATC	2	8	38513	38520	25 %	50 %	0 %	25 %	449306471
90	NC_020263	GGAA	2	8	39426	39433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020263	TTTC	2	8	39805	39812	0 %	75 %	0 %	25 %	449306473
92	NC_020263	TGCG	2	8	41125	41132	0 %	25 %	50 %	25 %	449306475
93	NC_020263	CTGT	2	8	41813	41820	0 %	50 %	25 %	25 %	449306475
94	NC_020263	GCGT	2	8	42075	42082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020263	GTAT	2	8	43020	43027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020263	TGTT	2	8	43203	43210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020263	TTCT	2	8	43618	43625	0 %	75 %	0 %	25 %	449306477
98	NC_020263	TCTG	2	8	43791	43798	0 %	50 %	25 %	25 %	449306477
99	NC_020263	CAGA	2	8	43884	43891	50 %	0 %	25 %	25 %	449306477
100	NC_020263	ATAC	2	8	44106	44113	50 %	25 %	0 %	25 %	449306478
101	NC_020263	TGAA	2	8	44128	44135	50 %	25 %	25 %	0 %	449306478
102	NC_020263	GGCG	2	8	44241	44248	0 %	0 %	75 %	25 %	449306478
103	NC_020263	CAGA	3	12	44587	44598	50 %	0 %	25 %	25 %	449306478
104	NC_020263	CACT	2	8	44896	44903	25 %	25 %	0 %	50 %	449306478
105	NC_020263	CCCG	2	8	45040	45047	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_020263	CCTG	2	8	45152	45159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020263	GCTC	2	8	45405	45412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020263	TCAT	2	8	45440	45447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020263	TTTC	2	8	46620	46627	0 %	75 %	0 %	25 %	449306479
110	NC_020263	GCGT	2	8	46863	46870	0 %	25 %	50 %	25 %	449306479
111	NC_020263	GACG	2	8	47013	47020	25 %	0 %	50 %	25 %	449306480
112	NC_020263	ATTA	2	8	47060	47067	50 %	50 %	0 %	0 %	449306480
113	NC_020263	TGCC	2	8	47447	47454	0 %	25 %	25 %	50 %	449306481
114	NC_020263	CGAG	2	8	48155	48162	25 %	0 %	50 %	25 %	449306481
115	NC_020263	CCCG	2	8	50243	50250	0 %	0 %	25 %	75 %	449306484
116	NC_020263	ATAC	2	8	50302	50309	50 %	25 %	0 %	25 %	449306484
117	NC_020263	GCCA	2	8	50422	50429	25 %	0 %	25 %	50 %	449306484
118	NC_020263	CGGG	2	8	50591	50598	0 %	0 %	75 %	25 %	449306484
119	NC_020263	GGCA	2	8	50882	50889	25 %	0 %	50 %	25 %	449306484
120	NC_020263	CAGC	2	8	50927	50934	25 %	0 %	25 %	50 %	449306484
121	NC_020263	CGCC	2	8	50999	51006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_020263	GCTT	2	8	51389	51396	0 %	50 %	25 %	25 %	449306485
123	NC_020263	CGGT	2	8	51397	51404	0 %	25 %	50 %	25 %	449306485
124	NC_020263	GGCG	2	8	51479	51486	0 %	0 %	75 %	25 %	449306485
125	NC_020263	GCGG	2	8	51722	51729	0 %	0 %	75 %	25 %	449306485
126	NC_020263	CTGG	2	8	51851	51858	0 %	25 %	50 %	25 %	449306485
127	NC_020263	CGAA	2	8	51992	51999	50 %	0 %	25 %	25 %	449306485
128	NC_020263	CAGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	50 %	25 %	449306485
129	NC_020263	ATTC	2	8	52678	52685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020263	CAGC	2	8	53757	53764	25 %	0 %	25 %	50 %	449306486
131	NC_020263	GTGC	2	8	54564	54571	0 %	25 %	50 %	25 %	449306486
132	NC_020263	GGCG	2	8	54588	54595	0 %	0 %	75 %	25 %	449306486
133	NC_020263	TGAC	2	8	54971	54978	25 %	25 %	25 %	25 %	449306486
134	NC_020263	TGCC	2	8	55466	55473	0 %	25 %	25 %	50 %	449306487
135	NC_020263	GCTG	2	8	55699	55706	0 %	25 %	50 %	25 %	449306488
136	NC_020263	CGCT	2	8	56083	56090	0 %	25 %	25 %	50 %	449306489
137	NC_020263	AAAG	2	8	56504	56511	75 %	0 %	25 %	0 %	449306489
138	NC_020263	TTAC	2	8	56539	56546	25 %	50 %	0 %	25 %	449306490
139	NC_020263	GTTT	2	8	56724	56731	0 %	75 %	25 %	0 %	449306490
140	NC_020263	CCGG	2	8	57005	57012	0 %	0 %	50 %	50 %	449306490
141	NC_020263	CATA	2	8	57066	57073	50 %	25 %	0 %	25 %	449306490
142	NC_020263	TGTC	2	8	57289	57296	0 %	50 %	25 %	25 %	449306491
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279	NC_020263	CGTT	2	8	117029	117036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
280	NC_020263	TAAC	2	8	117342	117349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
281	NC_020263	GTGA	2	8	117632	117639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020263	GATG	2	8	117896	117903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_020263	CTCG	2	8	117926	117933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.