MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020263	GCGG	2	8	395	402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020263	TGCC	2	8	467	474	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020263	GGCT	2	8	11315	11322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020263	ACGA	2	8	13303	13310	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020263	GGCT	2	8	19012	19019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020263	GGCT	2	8	26314	26321	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020263	ATTT	2	8	27523	27530	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020263	GTGA	2	8	29210	29217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020263	GGTT	2	8	32152	32159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020263	CATT	2	8	32365	32372	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020263	ATTC	2	8	32373	32380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020263	AAAT	2	8	37353	37360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020263	GGAA	2	8	39426	39433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020263	GCGT	2	8	42075	42082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020263	GTAT	2	8	43020	43027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020263	TGTT	2	8	43203	43210	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020263	CCCG	2	8	45040	45047	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_020263	CCTG	2	8	45152	45159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020263	GCTC	2	8	45405	45412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020263	TCAT	2	8	45440	45447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020263	CGCC	2	8	50999	51006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_020263	ATTC	2	8	52678	52685	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020263	CCCG	2	8	59839	59846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_020263	GTTT	2	8	60127	60134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020263	ATCT	2	8	60293	60300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020263	GGCA	2	8	61540	61547	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020263	GCCA	2	8	64990	64997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020263	GGCT	2	8	66275	66282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020263	TATG	2	8	66294	66301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020263	TGCC	2	8	66524	66531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020263	TAAA	2	8	66759	66766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020263	ATAC	2	8	76411	76418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020263	AAAC	2	8	79752	79759	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020263	TGGC	2	8	80209	80216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020263	CACG	2	8	80479	80486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020263	CGGG	2	8	80977	80984	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020263	TGAC	2	8	81174	81181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020263	ATAC	2	8	82399	82406	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020263	TCAT	2	8	85638	85645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020263	TCTG	2	8	85741	85748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020263	ATAA	2	8	85959	85966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020263	GCAG	2	8	87382	87389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020263	TAAA	2	8	87561	87568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020263	ATAC	2	8	103853	103860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020263	TGTT	2	8	106183	106190	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020263	GCTG	2	8	106864	106871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020263	AAAG	2	8	114581	114588	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020263	GCAG	2	8	114674	114681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020263	AACG	2	8	117012	117019	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020263	CGTT	2	8	117029	117036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020263	TAAC	2	8	117342	117349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020263	GTGA	2	8	117632	117639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020263	GATG	2	8	117896	117903	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020263	CTCG	2	8	117926	117933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.