MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-1

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020263	A	6	6	163	168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020263	A	6	6	563	568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020263	C	6	6	1304	1309	0 %	0 %	0 %	100 %	449306430
4	NC_020263	A	6	6	2416	2421	100 %	0 %	0 %	0 %	449306431
5	NC_020263	C	6	6	3019	3024	0 %	0 %	0 %	100 %	449306432
6	NC_020263	G	6	6	3038	3043	0 %	0 %	100 %	0 %	449306432
7	NC_020263	A	6	6	3187	3192	100 %	0 %	0 %	0 %	449306432
8	NC_020263	A	6	6	4336	4341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020263	T	7	7	5252	5258	0 %	100 %	0 %	0 %	449306434
10	NC_020263	T	6	6	5788	5793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020263	T	6	6	5852	5857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020263	A	6	6	6916	6921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020263	T	7	7	6937	6943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020263	T	7	7	8782	8788	0 %	100 %	0 %	0 %	449306438
15	NC_020263	A	6	6	9459	9464	100 %	0 %	0 %	0 %	449306440
16	NC_020263	T	6	6	9497	9502	0 %	100 %	0 %	0 %	449306440
17	NC_020263	A	6	6	10221	10226	100 %	0 %	0 %	0 %	449306440
18	NC_020263	T	7	7	14571	14577	0 %	100 %	0 %	0 %	449306445
19	NC_020263	G	6	6	15947	15952	0 %	0 %	100 %	0 %	449306445
20	NC_020263	A	6	6	18156	18161	100 %	0 %	0 %	0 %	449306447
21	NC_020263	T	6	6	18684	18689	0 %	100 %	0 %	0 %	449306448
22	NC_020263	T	6	6	20795	20800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020263	T	6	6	21082	21087	0 %	100 %	0 %	0 %	449306451
24	NC_020263	A	6	6	21788	21793	100 %	0 %	0 %	0 %	449306451
25	NC_020263	A	6	6	22758	22763	100 %	0 %	0 %	0 %	449306452
26	NC_020263	T	7	7	23427	23433	0 %	100 %	0 %	0 %	449306453
27	NC_020263	T	6	6	25281	25286	0 %	100 %	0 %	0 %	449306456
28	NC_020263	A	6	6	26288	26293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020263	T	6	6	26671	26676	0 %	100 %	0 %	0 %	449306459
30	NC_020263	T	6	6	27232	27237	0 %	100 %	0 %	0 %	449306460
31	NC_020263	T	7	7	27471	27477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020263	T	6	6	28382	28387	0 %	100 %	0 %	0 %	449306461
33	NC_020263	A	7	7	28971	28977	100 %	0 %	0 %	0 %	449306461
34	NC_020263	T	6	6	29067	29072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020263	A	7	7	29699	29705	100 %	0 %	0 %	0 %	449306462
36	NC_020263	T	6	6	30122	30127	0 %	100 %	0 %	0 %	449306463
37	NC_020263	T	6	6	31684	31689	0 %	100 %	0 %	0 %	449306463
38	NC_020263	T	6	6	32126	32131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020263	T	6	6	32217	32222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020263	T	6	6	36011	36016	0 %	100 %	0 %	0 %	449306470
41	NC_020263	A	6	6	37365	37370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020263	T	7	7	39410	39416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020263	A	6	6	39487	39492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020263	T	6	6	42782	42787	0 %	100 %	0 %	0 %	449306476
45	NC_020263	T	6	6	42885	42890	0 %	100 %	0 %	0 %	449306476
46	NC_020263	A	6	6	43277	43282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020263	T	6	6	44309	44314	0 %	100 %	0 %	0 %	449306478
48	NC_020263	A	6	6	44630	44635	100 %	0 %	0 %	0 %	449306478
49	NC_020263	T	6	6	45102	45107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020263	T	7	7	45323	45329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020263	T	8	8	45557	45564	0 %	100 %	0 %	0 %	449306479
52	NC_020263	T	7	7	46248	46254	0 %	100 %	0 %	0 %	449306479
53	NC_020263	T	6	6	46444	46449	0 %	100 %	0 %	0 %	449306479
54	NC_020263	G	6	6	46474	46479	0 %	0 %	100 %	0 %	449306479
55	NC_020263	A	6	6	47810	47815	100 %	0 %	0 %	0 %	449306481
56	NC_020263	T	6	6	48035	48040	0 %	100 %	0 %	0 %	449306481
57	NC_020263	A	6	6	48163	48168	100 %	0 %	0 %	0 %	449306481
58	NC_020263	T	6	6	50002	50007	0 %	100 %	0 %	0 %	449306483
59	NC_020263	A	6	6	50846	50851	100 %	0 %	0 %	0 %	449306484
60	NC_020263	A	6	6	51035	51040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020263	T	6	6	52653	52658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020263	T	6	6	52720	52725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020263	T	8	8	52776	52783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020263	T	7	7	52886	52892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020263	A	6	6	53161	53166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020263	A	7	7	53242	53248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020263	A	8	8	53256	53263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020263	A	6	6	53702	53707	100 %	0 %	0 %	0 %	449306486
69	NC_020263	T	6	6	56763	56768	0 %	100 %	0 %	0 %	449306490
70	NC_020263	T	6	6	59708	59713	0 %	100 %	0 %	0 %	449306492
71	NC_020263	T	6	6	60081	60086	0 %	100 %	0 %	0 %	449306493
72	NC_020263	T	7	7	60610	60616	0 %	100 %	0 %	0 %	449306494
73	NC_020263	A	6	6	60673	60678	100 %	0 %	0 %	0 %	449306494
74	NC_020263	A	6	6	60717	60722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020263	T	6	6	66704	66709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020263	A	6	6	66843	66848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020263	A	7	7	67229	67235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020263	A	6	6	68440	68445	100 %	0 %	0 %	0 %	449306502
79	NC_020263	A	7	7	70221	70227	100 %	0 %	0 %	0 %	449306504
80	NC_020263	A	6	6	71761	71766	100 %	0 %	0 %	0 %	449306505
81	NC_020263	G	6	6	74677	74682	0 %	0 %	100 %	0 %	449306505
82	NC_020263	T	6	6	75408	75413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020263	A	7	7	76046	76052	100 %	0 %	0 %	0 %	449306508
84	NC_020263	T	6	6	76136	76141	0 %	100 %	0 %	0 %	449306508
85	NC_020263	T	6	6	76277	76282	0 %	100 %	0 %	0 %	449306508
86	NC_020263	A	6	6	76561	76566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020263	T	6	6	76572	76577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020263	T	7	7	78440	78446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020263	T	6	6	79344	79349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020263	T	6	6	79725	79730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020263	T	6	6	80085	80090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020263	A	6	6	80304	80309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020263	A	6	6	82459	82464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020263	T	6	6	83788	83793	0 %	100 %	0 %	0 %	449306513
95	NC_020263	A	6	6	84129	84134	100 %	0 %	0 %	0 %	449306513
96	NC_020263	T	6	6	84308	84313	0 %	100 %	0 %	0 %	449306513
97	NC_020263	A	9	9	84630	84638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020263	T	6	6	85028	85033	0 %	100 %	0 %	0 %	449306514
99	NC_020263	T	6	6	86049	86054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020263	A	6	6	86111	86116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020263	A	6	6	88192	88197	100 %	0 %	0 %	0 %	449306516
102	NC_020263	T	7	7	90296	90302	0 %	100 %	0 %	0 %	449306516
103	NC_020263	A	6	6	90423	90428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020263	T	8	8	90829	90836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020263	T	6	6	91968	91973	0 %	100 %	0 %	0 %	449306517
106	NC_020263	A	6	6	92312	92317	100 %	0 %	0 %	0 %	449306518
107	NC_020263	G	6	6	94157	94162	0 %	0 %	100 %	0 %	449306519
108	NC_020263	A	7	7	95414	95420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020263	A	6	6	99501	99506	100 %	0 %	0 %	0 %	449306521
110	NC_020263	T	6	6	99809	99814	0 %	100 %	0 %	0 %	449306521
111	NC_020263	T	6	6	103764	103769	0 %	100 %	0 %	0 %	449306524
112	NC_020263	G	6	6	112027	112032	0 %	0 %	100 %	0 %	449306531
113	NC_020263	A	6	6	112413	112418	100 %	0 %	0 %	0 %	449306531
114	NC_020263	T	6	6	114195	114200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020263	A	6	6	114227	114232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020263	T	6	6	115496	115501	0 %	100 %	0 %	0 %	449306533

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.