MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	AGACC	2	10	306	315	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_020261	CATCG	2	10	612	621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_020261	TAAAT	2	10	5695	5704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020261	AATGA	2	10	5724	5733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020261	ACGCA	2	10	7652	7661	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_020261	GACAG	2	10	9678	9687	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020261	AATTT	2	10	20707	20716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020261	CATGC	2	10	20825	20834	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_020261	TGATA	2	10	21142	21151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020261	ACCCA	2	10	21664	21673	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_020261	GGAAA	2	10	24470	24479	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020261	TTTGT	2	10	29739	29748	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020261	TGATC	2	10	33572	33581	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020261	CAAAC	2	10	33726	33735	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_020261	CACGA	2	10	35232	35241	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020261	ATTGC	2	10	39567	39576	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020261	AGAAA	2	10	40328	40337	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020261	AAGAA	2	10	45624	45633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020261	ATGAG	2	10	48476	48485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.