MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	TTCCC	2	10	1695	1704	0 %	40 %	0 %	60 %	449306369
2	NC_020261	AGTTA	2	10	1826	1835	40 %	40 %	20 %	0 %	449306369
3	NC_020261	GGTCA	2	10	5494	5503	20 %	20 %	40 %	20 %	449306373
4	NC_020261	CGTAT	2	10	6836	6845	20 %	40 %	20 %	20 %	449306375
5	NC_020261	TCTGG	2	10	9782	9791	0 %	40 %	40 %	20 %	449306377
6	NC_020261	GCAGA	2	10	9889	9898	40 %	0 %	40 %	20 %	449306377
7	NC_020261	ATTCG	2	10	10197	10206	20 %	40 %	20 %	20 %	449306378
8	NC_020261	TCAGC	2	10	10419	10428	20 %	20 %	20 %	40 %	449306378
9	NC_020261	CGTTA	2	10	15292	15301	20 %	40 %	20 %	20 %	449306381
10	NC_020261	GAAAA	2	10	18120	18129	80 %	0 %	20 %	0 %	449306384
11	NC_020261	TTATC	2	10	19336	19345	20 %	60 %	0 %	20 %	449306384
12	NC_020261	GCAGT	2	10	27426	27435	20 %	20 %	40 %	20 %	449306390
13	NC_020261	CCGGA	2	10	27543	27552	20 %	0 %	40 %	40 %	449306390
14	NC_020261	GCAGC	2	10	28652	28661	20 %	0 %	40 %	40 %	449306391
15	NC_020261	GCCAG	2	10	29362	29371	20 %	0 %	40 %	40 %	449306391
16	NC_020261	AAAAG	2	10	30814	30823	80 %	0 %	20 %	0 %	449306394
17	NC_020261	CGAAA	2	10	32904	32913	60 %	0 %	20 %	20 %	449306397
18	NC_020261	TTCTT	2	10	34520	34529	0 %	80 %	0 %	20 %	449306399
19	NC_020261	TGGTG	2	10	36713	36722	0 %	40 %	60 %	0 %	449306401
20	NC_020261	ACCGG	2	10	47617	47626	20 %	0 %	40 %	40 %	449306415
21	NC_020261	TGTCA	2	10	49858	49867	20 %	40 %	20 %	20 %	449306417
22	NC_020261	CACGA	2	10	50680	50689	40 %	0 %	20 %	40 %	449306419

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.