MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	ACTG	2	8	58	65	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020261	CAGC	2	8	280	287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020261	ATCA	2	8	948	955	50 %	25 %	0 %	25 %	449306368
4	NC_020261	AGCA	2	8	1595	1602	50 %	0 %	25 %	25 %	449306369
5	NC_020261	AACA	2	8	1769	1776	75 %	0 %	0 %	25 %	449306369
6	NC_020261	GCAA	2	8	1788	1795	50 %	0 %	25 %	25 %	449306369
7	NC_020261	GCAG	2	8	2137	2144	25 %	0 %	50 %	25 %	449306369
8	NC_020261	ATGG	2	8	2261	2268	25 %	25 %	50 %	0 %	449306369
9	NC_020261	TTTA	2	8	2874	2881	25 %	75 %	0 %	0 %	449306370
10	NC_020261	TTTA	2	8	2892	2899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020261	GTCA	2	8	3096	3103	25 %	25 %	25 %	25 %	449306371
12	NC_020261	CCTG	2	8	3332	3339	0 %	25 %	25 %	50 %	449306371
13	NC_020261	TAAT	2	8	3547	3554	50 %	50 %	0 %	0 %	449306371
14	NC_020261	AAAC	2	8	3774	3781	75 %	0 %	0 %	25 %	449306371
15	NC_020261	CGTC	2	8	4188	4195	0 %	25 %	25 %	50 %	449306372
16	NC_020261	CCAT	2	8	4446	4453	25 %	25 %	0 %	50 %	449306372
17	NC_020261	GGTT	2	8	5030	5037	0 %	50 %	50 %	0 %	449306373
18	NC_020261	CCAT	2	8	5309	5316	25 %	25 %	0 %	50 %	449306373
19	NC_020261	ATTG	2	8	5437	5444	25 %	50 %	25 %	0 %	449306373
20	NC_020261	GTCA	2	8	5992	5999	25 %	25 %	25 %	25 %	449306374
21	NC_020261	ATGA	2	8	6070	6077	50 %	25 %	25 %	0 %	449306374
22	NC_020261	TCAT	2	8	6099	6106	25 %	50 %	0 %	25 %	449306374
23	NC_020261	AAAG	2	8	6771	6778	75 %	0 %	25 %	0 %	449306375
24	NC_020261	ACGA	2	8	7334	7341	50 %	0 %	25 %	25 %	449306375
25	NC_020261	TTCA	2	8	7614	7621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020261	CAGA	2	8	8763	8770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020261	CAGG	2	8	9104	9111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020261	CCAT	2	8	9298	9305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020261	GCCA	2	8	9449	9456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020261	CCAG	2	8	9590	9597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020261	ATGC	2	8	10081	10088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020261	TTTC	2	8	10443	10450	0 %	75 %	0 %	25 %	449306378
33	NC_020261	TCAT	2	8	10469	10476	25 %	50 %	0 %	25 %	449306378
34	NC_020261	TTTG	2	8	10985	10992	0 %	75 %	25 %	0 %	449306379
35	NC_020261	CTGA	2	8	11330	11337	25 %	25 %	25 %	25 %	449306379
36	NC_020261	GCTG	2	8	11402	11409	0 %	25 %	50 %	25 %	449306379
37	NC_020261	CGCC	2	8	11703	11710	0 %	0 %	25 %	75 %	449306379
38	NC_020261	ACGG	2	8	11906	11913	25 %	0 %	50 %	25 %	449306379
39	NC_020261	TCCT	2	8	12452	12459	0 %	50 %	0 %	50 %	449306379
40	NC_020261	TCCC	2	8	12682	12689	0 %	25 %	0 %	75 %	449306379
41	NC_020261	ACGT	2	8	12785	12792	25 %	25 %	25 %	25 %	449306379
42	NC_020261	ACCG	2	8	13325	13332	25 %	0 %	25 %	50 %	449306379
43	NC_020261	GCAG	2	8	13500	13507	25 %	0 %	50 %	25 %	449306379
44	NC_020261	CACG	2	8	13618	13625	25 %	0 %	25 %	50 %	449306379
45	NC_020261	TTCA	2	8	14028	14035	25 %	50 %	0 %	25 %	449306380
46	NC_020261	CCAG	2	8	14581	14588	25 %	0 %	25 %	50 %	449306380
47	NC_020261	TCAT	2	8	15215	15222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020261	AATG	2	8	15238	15245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020261	CTGA	2	8	15931	15938	25 %	25 %	25 %	25 %	449306382
50	NC_020261	CAGC	2	8	15982	15989	25 %	0 %	25 %	50 %	449306382
51	NC_020261	GCTG	2	8	16519	16526	0 %	25 %	50 %	25 %	449306382
52	NC_020261	CTCA	2	8	16613	16620	25 %	25 %	0 %	50 %	449306382
53	NC_020261	TGTA	2	8	16717	16724	25 %	50 %	25 %	0 %	449306382
54	NC_020261	ATCG	2	8	18146	18153	25 %	25 %	25 %	25 %	449306384
55	NC_020261	CCTG	2	8	19012	19019	0 %	25 %	25 %	50 %	449306384
56	NC_020261	GATG	2	8	19959	19966	25 %	25 %	50 %	0 %	449306385
57	NC_020261	CTGC	2	8	20260	20267	0 %	25 %	25 %	50 %	449306386
58	NC_020261	ATAA	2	8	20561	20568	75 %	25 %	0 %	0 %	449306386
59	NC_020261	CTTT	2	8	20676	20683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020261	CATT	2	8	20906	20913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020261	GCAT	2	8	20967	20974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020261	AATT	2	8	21267	21274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020261	TCGT	2	8	21479	21486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020261	TGTA	2	8	21952	21959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020261	AAAG	2	8	22126	22133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020261	TCAG	2	8	22471	22478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020261	TTCC	2	8	23509	23516	0 %	50 %	0 %	50 %	449306387
68	NC_020261	TTAT	2	8	23587	23594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020261	TCAA	2	8	24024	24031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020261	GGAT	2	8	24067	24074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020261	TAAC	2	8	24435	24442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020261	CAAC	2	8	24834	24841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020261	TCAC	2	8	24918	24925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020261	TAAT	2	8	25536	25543	50 %	50 %	0 %	0 %	449306388
75	NC_020261	GGGA	2	8	26039	26046	25 %	0 %	75 %	0 %	449306389
76	NC_020261	GAAA	2	8	26460	26467	75 %	0 %	25 %	0 %	449306389
77	NC_020261	CTAC	2	8	26898	26905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_020261	TATG	2	8	27146	27153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020261	GACT	2	8	27354	27361	25 %	25 %	25 %	25 %	449306390
80	NC_020261	GACT	2	8	27779	27786	25 %	25 %	25 %	25 %	449306390
81	NC_020261	CACC	2	8	27844	27851	25 %	0 %	0 %	75 %	449306390
82	NC_020261	CCTG	2	8	28173	28180	0 %	25 %	25 %	50 %	449306390
83	NC_020261	TCAG	2	8	28595	28602	25 %	25 %	25 %	25 %	449306390
84	NC_020261	CGGG	2	8	28795	28802	0 %	0 %	75 %	25 %	449306391
85	NC_020261	CCAT	2	8	28898	28905	25 %	25 %	0 %	50 %	449306391
86	NC_020261	GCTG	2	8	29167	29174	0 %	25 %	50 %	25 %	449306391
87	NC_020261	GCCG	2	8	29585	29592	0 %	0 %	50 %	50 %	449306391
88	NC_020261	GCTG	2	8	29710	29717	0 %	25 %	50 %	25 %	449306391
89	NC_020261	TGGC	2	8	30463	30470	0 %	25 %	50 %	25 %	449306393
90	NC_020261	GCGG	2	8	30626	30633	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020261	AGCG	2	8	30830	30837	25 %	0 %	50 %	25 %	449306394
92	NC_020261	CTGG	2	8	31153	31160	0 %	25 %	50 %	25 %	449306394
93	NC_020261	GCAG	2	8	31272	31279	25 %	0 %	50 %	25 %	449306394
94	NC_020261	CCGG	2	8	31669	31676	0 %	0 %	50 %	50 %	449306395
95	NC_020261	ACCG	2	8	31819	31826	25 %	0 %	25 %	50 %	449306395
96	NC_020261	CTGG	2	8	32234	32241	0 %	25 %	50 %	25 %	449306396
97	NC_020261	GGCA	2	8	32690	32697	25 %	0 %	50 %	25 %	449306397
98	NC_020261	CTTT	2	8	33310	33317	0 %	75 %	0 %	25 %	449306397
99	NC_020261	TATT	2	8	33503	33510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020261	AAGA	2	8	33787	33794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020261	TCAT	2	8	33857	33864	25 %	50 %	0 %	25 %	449306398
102	NC_020261	AATT	2	8	34121	34128	50 %	50 %	0 %	0 %	449306399
103	NC_020261	AACC	2	8	35195	35202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_020261	CAGC	2	8	35244	35251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020261	AGAA	2	8	35574	35581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020261	CCCG	2	8	36061	36068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_020261	ATGT	2	8	36129	36136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020261	GCGG	2	8	36170	36177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020261	GATC	2	8	36208	36215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020261	GGAA	2	8	36349	36356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020261	TACC	2	8	37176	37183	25 %	25 %	0 %	50 %	449306402
112	NC_020261	GTAA	2	8	37268	37275	50 %	25 %	25 %	0 %	449306402
113	NC_020261	GGAA	2	8	37306	37313	50 %	0 %	50 %	0 %	449306402
114	NC_020261	GCCA	2	8	37625	37632	25 %	0 %	25 %	50 %	449306403
115	NC_020261	GGCG	2	8	38477	38484	0 %	0 %	75 %	25 %	449306404
116	NC_020261	AATG	2	8	38643	38650	50 %	25 %	25 %	0 %	449306404
117	NC_020261	GAAC	2	8	38765	38772	50 %	0 %	25 %	25 %	449306405
118	NC_020261	TCAC	2	8	38832	38839	25 %	25 %	0 %	50 %	449306405
119	NC_020261	TGCA	2	8	39021	39028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020261	TACA	2	8	39038	39045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020261	AACT	2	8	39100	39107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020261	ATTT	2	8	39187	39194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020261	GCAG	2	8	39663	39670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020261	TGGC	2	8	39811	39818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020261	TTTC	2	8	40043	40050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020261	CAAA	2	8	40237	40244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020261	AATT	2	8	40949	40956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020261	ATGT	2	8	41095	41102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020261	GGGA	2	8	41123	41130	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020261	CCAC	2	8	42071	42078	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
131	NC_020261	CGCC	2	8	42089	42096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_020261	CGTC	2	8	42199	42206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020261	CTGG	2	8	42871	42878	0 %	25 %	50 %	25 %	449306411
134	NC_020261	TGCT	2	8	43144	43151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020261	TAAG	2	8	43238	43245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020261	CAGC	2	8	43569	43576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020261	CTGC	2	8	44037	44044	0 %	25 %	25 %	50 %	449306413
138	NC_020261	GTCC	2	8	44281	44288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020261	CTGG	2	8	44302	44309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020261	TCCT	2	8	44577	44584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020261	CGAG	2	8	44849	44856	25 %	0 %	50 %	25 %	449306414
142	NC_020261	CGGC	2	8	45374	45381	0 %	0 %	50 %	50 %	449306414
143	NC_020261	TTAG	2	8	46474	46481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020261	CTGA	2	8	46938	46945	25 %	25 %	25 %	25 %	449306415
145	NC_020261	ACCG	2	8	47099	47106	25 %	0 %	25 %	50 %	449306415
146	NC_020261	ATTT	2	8	48597	48604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020261	CCGG	2	8	48838	48845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020261	CGTC	2	8	49154	49161	0 %	25 %	25 %	50 %	449306417
149	NC_020261	CGGC	2	8	49424	49431	0 %	0 %	50 %	50 %	449306417
150	NC_020261	CGTG	2	8	49508	49515	0 %	25 %	50 %	25 %	449306417
151	NC_020261	TCAG	2	8	50659	50666	25 %	25 %	25 %	25 %	449306419
152	NC_020261	TAGT	2	8	50745	50752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020261	ATCT	2	8	50760	50767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_020261	CATG	2	8	51286	51293	25 %	25 %	25 %	25 %	449306420
155	NC_020261	CAAT	2	8	51398	51405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_020261	ATGA	2	8	51658	51665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020261	CAAA	2	8	51744	51751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_020261	ATTC	2	8	51993	52000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.