MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	ACTG	2	8	58	65	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020261	CAGC	2	8	280	287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020261	TTTA	2	8	2892	2899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020261	TTCA	2	8	7614	7621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020261	CAGA	2	8	8763	8770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020261	CAGG	2	8	9104	9111	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020261	CCAT	2	8	9298	9305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020261	GCCA	2	8	9449	9456	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020261	CCAG	2	8	9590	9597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020261	ATGC	2	8	10081	10088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020261	TCAT	2	8	15215	15222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020261	AATG	2	8	15238	15245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020261	CTTT	2	8	20676	20683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020261	CATT	2	8	20906	20913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020261	GCAT	2	8	20967	20974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_020261	AATT	2	8	21267	21274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020261	TCGT	2	8	21479	21486	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020261	TGTA	2	8	21952	21959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020261	AAAG	2	8	22126	22133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020261	TCAG	2	8	22471	22478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020261	TTAT	2	8	23587	23594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020261	TCAA	2	8	24024	24031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020261	GGAT	2	8	24067	24074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020261	TAAC	2	8	24435	24442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020261	CAAC	2	8	24834	24841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020261	TCAC	2	8	24918	24925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020261	CTAC	2	8	26898	26905	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020261	TATG	2	8	27146	27153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020261	GCGG	2	8	30626	30633	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020261	TATT	2	8	33503	33510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020261	AAGA	2	8	33787	33794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020261	AACC	2	8	35195	35202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020261	CAGC	2	8	35244	35251	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020261	AGAA	2	8	35574	35581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020261	CCCG	2	8	36061	36068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_020261	ATGT	2	8	36129	36136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020261	GCGG	2	8	36170	36177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020261	GATC	2	8	36208	36215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020261	GGAA	2	8	36349	36356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020261	TGCA	2	8	39021	39028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020261	TACA	2	8	39038	39045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020261	AACT	2	8	39100	39107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020261	ATTT	2	8	39187	39194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020261	GCAG	2	8	39663	39670	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020261	TGGC	2	8	39811	39818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020261	TTTC	2	8	40043	40050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020261	CAAA	2	8	40237	40244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020261	AATT	2	8	40949	40956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020261	ATGT	2	8	41095	41102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020261	GGGA	2	8	41123	41130	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020261	CCAC	2	8	42071	42078	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_020261	CGCC	2	8	42089	42096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_020261	CGTC	2	8	42199	42206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020261	TGCT	2	8	43144	43151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020261	TAAG	2	8	43238	43245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020261	CAGC	2	8	43569	43576	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020261	GTCC	2	8	44281	44288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020261	CTGG	2	8	44302	44309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020261	TCCT	2	8	44577	44584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020261	TTAG	2	8	46474	46481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020261	ATTT	2	8	48597	48604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020261	CCGG	2	8	48838	48845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020261	TAGT	2	8	50745	50752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020261	ATCT	2	8	50760	50767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020261	CAAT	2	8	51398	51405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020261	ATGA	2	8	51658	51665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020261	CAAA	2	8	51744	51751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020261	ATTC	2	8	51993	52000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.