MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	ATCA	2	8	948	955	50 %	25 %	0 %	25 %	449306368
2	NC_020261	AGCA	2	8	1595	1602	50 %	0 %	25 %	25 %	449306369
3	NC_020261	AACA	2	8	1769	1776	75 %	0 %	0 %	25 %	449306369
4	NC_020261	GCAA	2	8	1788	1795	50 %	0 %	25 %	25 %	449306369
5	NC_020261	GCAG	2	8	2137	2144	25 %	0 %	50 %	25 %	449306369
6	NC_020261	ATGG	2	8	2261	2268	25 %	25 %	50 %	0 %	449306369
7	NC_020261	TTTA	2	8	2874	2881	25 %	75 %	0 %	0 %	449306370
8	NC_020261	GTCA	2	8	3096	3103	25 %	25 %	25 %	25 %	449306371
9	NC_020261	CCTG	2	8	3332	3339	0 %	25 %	25 %	50 %	449306371
10	NC_020261	TAAT	2	8	3547	3554	50 %	50 %	0 %	0 %	449306371
11	NC_020261	AAAC	2	8	3774	3781	75 %	0 %	0 %	25 %	449306371
12	NC_020261	CGTC	2	8	4188	4195	0 %	25 %	25 %	50 %	449306372
13	NC_020261	CCAT	2	8	4446	4453	25 %	25 %	0 %	50 %	449306372
14	NC_020261	GGTT	2	8	5030	5037	0 %	50 %	50 %	0 %	449306373
15	NC_020261	CCAT	2	8	5309	5316	25 %	25 %	0 %	50 %	449306373
16	NC_020261	ATTG	2	8	5437	5444	25 %	50 %	25 %	0 %	449306373
17	NC_020261	GTCA	2	8	5992	5999	25 %	25 %	25 %	25 %	449306374
18	NC_020261	ATGA	2	8	6070	6077	50 %	25 %	25 %	0 %	449306374
19	NC_020261	TCAT	2	8	6099	6106	25 %	50 %	0 %	25 %	449306374
20	NC_020261	AAAG	2	8	6771	6778	75 %	0 %	25 %	0 %	449306375
21	NC_020261	ACGA	2	8	7334	7341	50 %	0 %	25 %	25 %	449306375
22	NC_020261	TTTC	2	8	10443	10450	0 %	75 %	0 %	25 %	449306378
23	NC_020261	TCAT	2	8	10469	10476	25 %	50 %	0 %	25 %	449306378
24	NC_020261	TTTG	2	8	10985	10992	0 %	75 %	25 %	0 %	449306379
25	NC_020261	CTGA	2	8	11330	11337	25 %	25 %	25 %	25 %	449306379
26	NC_020261	GCTG	2	8	11402	11409	0 %	25 %	50 %	25 %	449306379
27	NC_020261	CGCC	2	8	11703	11710	0 %	0 %	25 %	75 %	449306379
28	NC_020261	ACGG	2	8	11906	11913	25 %	0 %	50 %	25 %	449306379
29	NC_020261	TCCT	2	8	12452	12459	0 %	50 %	0 %	50 %	449306379
30	NC_020261	TCCC	2	8	12682	12689	0 %	25 %	0 %	75 %	449306379
31	NC_020261	ACGT	2	8	12785	12792	25 %	25 %	25 %	25 %	449306379
32	NC_020261	ACCG	2	8	13325	13332	25 %	0 %	25 %	50 %	449306379
33	NC_020261	GCAG	2	8	13500	13507	25 %	0 %	50 %	25 %	449306379
34	NC_020261	CACG	2	8	13618	13625	25 %	0 %	25 %	50 %	449306379
35	NC_020261	TTCA	2	8	14028	14035	25 %	50 %	0 %	25 %	449306380
36	NC_020261	CCAG	2	8	14581	14588	25 %	0 %	25 %	50 %	449306380
37	NC_020261	CTGA	2	8	15931	15938	25 %	25 %	25 %	25 %	449306382
38	NC_020261	CAGC	2	8	15982	15989	25 %	0 %	25 %	50 %	449306382
39	NC_020261	GCTG	2	8	16519	16526	0 %	25 %	50 %	25 %	449306382
40	NC_020261	CTCA	2	8	16613	16620	25 %	25 %	0 %	50 %	449306382
41	NC_020261	TGTA	2	8	16717	16724	25 %	50 %	25 %	0 %	449306382
42	NC_020261	ATCG	2	8	18146	18153	25 %	25 %	25 %	25 %	449306384
43	NC_020261	CCTG	2	8	19012	19019	0 %	25 %	25 %	50 %	449306384
44	NC_020261	GATG	2	8	19959	19966	25 %	25 %	50 %	0 %	449306385
45	NC_020261	CTGC	2	8	20260	20267	0 %	25 %	25 %	50 %	449306386
46	NC_020261	ATAA	2	8	20561	20568	75 %	25 %	0 %	0 %	449306386
47	NC_020261	TTCC	2	8	23509	23516	0 %	50 %	0 %	50 %	449306387
48	NC_020261	TAAT	2	8	25536	25543	50 %	50 %	0 %	0 %	449306388
49	NC_020261	GGGA	2	8	26039	26046	25 %	0 %	75 %	0 %	449306389
50	NC_020261	GAAA	2	8	26460	26467	75 %	0 %	25 %	0 %	449306389
51	NC_020261	GACT	2	8	27354	27361	25 %	25 %	25 %	25 %	449306390
52	NC_020261	GACT	2	8	27779	27786	25 %	25 %	25 %	25 %	449306390
53	NC_020261	CACC	2	8	27844	27851	25 %	0 %	0 %	75 %	449306390
54	NC_020261	CCTG	2	8	28173	28180	0 %	25 %	25 %	50 %	449306390
55	NC_020261	TCAG	2	8	28595	28602	25 %	25 %	25 %	25 %	449306390
56	NC_020261	CGGG	2	8	28795	28802	0 %	0 %	75 %	25 %	449306391
57	NC_020261	CCAT	2	8	28898	28905	25 %	25 %	0 %	50 %	449306391
58	NC_020261	GCTG	2	8	29167	29174	0 %	25 %	50 %	25 %	449306391
59	NC_020261	GCCG	2	8	29585	29592	0 %	0 %	50 %	50 %	449306391
60	NC_020261	GCTG	2	8	29710	29717	0 %	25 %	50 %	25 %	449306391
61	NC_020261	TGGC	2	8	30463	30470	0 %	25 %	50 %	25 %	449306393
62	NC_020261	AGCG	2	8	30830	30837	25 %	0 %	50 %	25 %	449306394
63	NC_020261	CTGG	2	8	31153	31160	0 %	25 %	50 %	25 %	449306394
64	NC_020261	GCAG	2	8	31272	31279	25 %	0 %	50 %	25 %	449306394
65	NC_020261	CCGG	2	8	31669	31676	0 %	0 %	50 %	50 %	449306395
66	NC_020261	ACCG	2	8	31819	31826	25 %	0 %	25 %	50 %	449306395
67	NC_020261	CTGG	2	8	32234	32241	0 %	25 %	50 %	25 %	449306396
68	NC_020261	GGCA	2	8	32690	32697	25 %	0 %	50 %	25 %	449306397
69	NC_020261	CTTT	2	8	33310	33317	0 %	75 %	0 %	25 %	449306397
70	NC_020261	TCAT	2	8	33857	33864	25 %	50 %	0 %	25 %	449306398
71	NC_020261	AATT	2	8	34121	34128	50 %	50 %	0 %	0 %	449306399
72	NC_020261	TACC	2	8	37176	37183	25 %	25 %	0 %	50 %	449306402
73	NC_020261	GTAA	2	8	37268	37275	50 %	25 %	25 %	0 %	449306402
74	NC_020261	GGAA	2	8	37306	37313	50 %	0 %	50 %	0 %	449306402
75	NC_020261	GCCA	2	8	37625	37632	25 %	0 %	25 %	50 %	449306403
76	NC_020261	GGCG	2	8	38477	38484	0 %	0 %	75 %	25 %	449306404
77	NC_020261	AATG	2	8	38643	38650	50 %	25 %	25 %	0 %	449306404
78	NC_020261	GAAC	2	8	38765	38772	50 %	0 %	25 %	25 %	449306405
79	NC_020261	TCAC	2	8	38832	38839	25 %	25 %	0 %	50 %	449306405
80	NC_020261	CTGG	2	8	42871	42878	0 %	25 %	50 %	25 %	449306411
81	NC_020261	CTGC	2	8	44037	44044	0 %	25 %	25 %	50 %	449306413
82	NC_020261	CGAG	2	8	44849	44856	25 %	0 %	50 %	25 %	449306414
83	NC_020261	CGGC	2	8	45374	45381	0 %	0 %	50 %	50 %	449306414
84	NC_020261	CTGA	2	8	46938	46945	25 %	25 %	25 %	25 %	449306415
85	NC_020261	ACCG	2	8	47099	47106	25 %	0 %	25 %	50 %	449306415
86	NC_020261	CGTC	2	8	49154	49161	0 %	25 %	25 %	50 %	449306417
87	NC_020261	CGGC	2	8	49424	49431	0 %	0 %	50 %	50 %	449306417
88	NC_020261	CGTG	2	8	49508	49515	0 %	25 %	50 %	25 %	449306417
89	NC_020261	TCAG	2	8	50659	50666	25 %	25 %	25 %	25 %	449306419
90	NC_020261	CATG	2	8	51286	51293	25 %	25 %	25 %	25 %	449306420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.