MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 225

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	CAT	2	6	46	51	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020261	ATT	2	6	142	147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020261	CGG	2	6	175	180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020261	GGA	2	6	226	231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020261	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020261	CGC	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020261	TTC	2	6	469	474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020261	TTA	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020261	AAC	2	6	529	534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020261	CAA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020261	ATT	2	6	1425	1430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020261	CTG	2	6	1467	1472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020261	TGG	2	6	4981	4986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020261	ATT	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020261	GCA	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020261	ATC	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020261	GAC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020261	CCT	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_020261	CGC	2	6	6580	6585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_020261	GGA	2	6	7679	7684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020261	GCC	3	9	7695	7703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020261	CAG	2	6	7718	7723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020261	ATC	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020261	CAT	2	6	7957	7962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020261	CAG	2	6	8089	8094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020261	AAC	2	6	8327	8332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020261	ACA	2	6	8430	8435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020261	TGC	2	6	8451	8456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020261	AAT	2	6	8705	8710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020261	CAA	2	6	8785	8790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020261	TCA	2	6	8910	8915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020261	GAT	2	6	8933	8938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020261	TCA	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020261	GTT	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020261	TCT	2	6	9115	9120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020261	GCC	2	6	9155	9160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020261	CAG	2	6	9243	9248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020261	CTG	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020261	CCA	2	6	9290	9295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020261	AGG	2	6	9329	9334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020261	CAA	2	6	9386	9391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020261	GAA	2	6	9441	9446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020261	ACA	2	6	9461	9466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020261	AGC	2	6	9484	9489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020261	TGT	2	6	9500	9505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020261	CAA	2	6	9582	9587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020261	TCA	2	6	9622	9627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020261	GCG	2	6	9702	9707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020261	GTT	2	6	10035	10040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020261	CTG	2	6	10159	10164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020261	GTC	2	6	13869	13874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020261	TGA	2	6	15071	15076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020261	CCT	2	6	15111	15116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020261	GCT	2	6	15125	15130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020261	ATT	2	6	15135	15140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020261	GCA	2	6	15141	15146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020261	AAG	2	6	15160	15165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020261	TGT	2	6	17161	17166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020261	AGC	2	6	17219	17224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020261	GCA	2	6	19430	19435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020261	TCA	2	6	19489	19494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020261	GTA	2	6	20079	20084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020261	ATT	2	6	20112	20117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020261	AAT	2	6	20652	20657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020261	AAT	2	6	20693	20698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020261	ATT	2	6	20722	20727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020261	TCC	2	6	20851	20856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020261	TAA	2	6	21025	21030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020261	TGA	2	6	21209	21214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020261	CTT	2	6	21323	21328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020261	TCT	2	6	21425	21430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020261	TTC	2	6	21523	21528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020261	GCT	2	6	21645	21650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020261	CTT	2	6	21712	21717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020261	TCA	2	6	21788	21793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020261	TAA	2	6	21810	21815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020261	TTC	2	6	21825	21830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020261	TAA	2	6	21924	21929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020261	AAC	2	6	21992	21997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020261	TGT	2	6	22007	22012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020261	TTG	2	6	22024	22029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020261	CAG	2	6	22075	22080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020261	TTC	2	6	22115	22120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020261	ATT	2	6	22203	22208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020261	TCC	2	6	22381	22386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020261	AAT	2	6	23610	23615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020261	CAA	2	6	23626	23631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020261	TGC	2	6	23651	23656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020261	TCA	2	6	23716	23721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020261	CAG	2	6	23743	23748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020261	GAG	2	6	23799	23804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020261	AGA	2	6	23906	23911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020261	GTT	2	6	24010	24015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020261	GAA	2	6	24077	24082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020261	ACA	2	6	24124	24129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020261	CGG	2	6	24565	24570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020261	CAA	2	6	24670	24675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020261	AAG	2	6	25107	25112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020261	GCA	2	6	25147	25152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020261	AAC	2	6	27047	27052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020261	TTA	2	6	30149	30154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020261	ATC	2	6	30185	30190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020261	GTT	2	6	30208	30213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020261	TGC	2	6	30226	30231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020261	TCA	2	6	30235	30240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020261	ATA	2	6	30620	30625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020261	AGA	2	6	31310	31315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020261	TCA	2	6	32373	32378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020261	AGC	2	6	33381	33386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020261	CCG	2	6	33490	33495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_020261	TAC	2	6	33614	33619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020261	AGC	2	6	33690	33695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020261	AAC	2	6	34063	34068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020261	CTA	2	6	34936	34941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020261	GAC	3	9	34986	34994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020261	ATT	2	6	35051	35056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020261	GTG	2	6	35139	35144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020261	CAA	2	6	35225	35230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020261	GTG	2	6	35549	35554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020261	TTG	2	6	35562	35567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020261	ATC	2	6	36053	36058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020261	GTT	2	6	37518	37523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020261	CCT	2	6	37913	37918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_020261	GCC	2	6	38000	38005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_020261	CAG	2	6	38045	38050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020261	TTC	2	6	38207	38212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_020261	ACT	2	6	38989	38994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020261	TTC	2	6	39058	39063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020261	AAG	2	6	39151	39156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020261	ATT	2	6	39255	39260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020261	ATT	2	6	39740	39745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020261	ACA	2	6	39828	39833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020261	GGC	2	6	39886	39891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020261	TTC	2	6	39909	39914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020261	GCA	2	6	39945	39950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020261	ACT	2	6	39990	39995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020261	AAT	2	6	40013	40018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020261	ATA	2	6	40036	40041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020261	TGT	2	6	40137	40142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020261	TAC	2	6	40152	40157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020261	GGT	2	6	40268	40273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020261	AAC	2	6	40316	40321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020261	TAC	2	6	40702	40707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_020261	CGG	2	6	42304	42309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_020261	GCC	2	6	42342	42347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_020261	ATT	3	9	42453	42461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020261	ACT	2	6	42467	42472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_020261	CGC	2	6	42860	42865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_020261	AAC	2	6	43105	43110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_020261	ATT	2	6	44185	44190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_020261	GCT	2	6	44290	44295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_020261	CGG	2	6	44437	44442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.