MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-2

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020261	ACC	2	6	775	780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306367
2	NC_020261	TCA	3	9	910	918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306368
3	NC_020261	GCA	3	9	1034	1042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306368
4	NC_020261	TCT	2	6	1079	1084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306368
5	NC_020261	TTC	2	6	1302	1307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306368
6	NC_020261	TGA	2	6	1331	1336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306368
7	NC_020261	GCA	2	6	1358	1363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306368
8	NC_020261	TAT	2	6	1374	1379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306368
9	NC_020261	CAA	2	6	1639	1644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306369
10	NC_020261	TGC	2	6	1745	1750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306369
11	NC_020261	AGA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306369
12	NC_020261	TCC	2	6	1798	1803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306369
13	NC_020261	ACA	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306369
14	NC_020261	CAG	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306369
15	NC_020261	TCC	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306369
16	NC_020261	TCA	2	6	2131	2136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306369
17	NC_020261	TCT	2	6	2238	2243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306369
18	NC_020261	ATG	2	6	2337	2342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306369
19	NC_020261	AAC	2	6	2348	2353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306369
20	NC_020261	AGA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306369
21	NC_020261	ATA	2	6	2505	2510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306369
22	NC_020261	GAA	2	6	2557	2562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306370
23	NC_020261	AAT	2	6	2613	2618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306370
24	NC_020261	TGA	2	6	2679	2684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306370
25	NC_020261	TAC	2	6	2961	2966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306371
26	NC_020261	TCA	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306371
27	NC_020261	CGT	2	6	3194	3199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306371
28	NC_020261	TCC	2	6	3204	3209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306371
29	NC_020261	GCT	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306371
30	NC_020261	CAG	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306371
31	NC_020261	CCA	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306371
32	NC_020261	GCC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306371
33	NC_020261	TTG	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306371
34	NC_020261	CAG	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306371
35	NC_020261	CTG	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306371
36	NC_020261	CGC	2	6	3750	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306371
37	NC_020261	CAT	2	6	3825	3830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306371
38	NC_020261	TCC	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306372
39	NC_020261	CTG	2	6	3913	3918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306372
40	NC_020261	TCA	2	6	4036	4041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306372
41	NC_020261	CAG	2	6	4085	4090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306372
42	NC_020261	TTC	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306372
43	NC_020261	TGC	2	6	4393	4398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306372
44	NC_020261	GGA	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449306372
45	NC_020261	CAT	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306372
46	NC_020261	GCA	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306372
47	NC_020261	CAT	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306372
48	NC_020261	GTA	2	6	5048	5053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306373
49	NC_020261	CAG	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306373
50	NC_020261	ACA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306373
51	NC_020261	GAT	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306373
52	NC_020261	CCT	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306373
53	NC_020261	ATC	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306373
54	NC_020261	GAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306373
55	NC_020261	CTT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306373
56	NC_020261	GAA	2	6	5412	5417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306373
57	NC_020261	TCG	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306373
58	NC_020261	TAA	2	6	5976	5981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306374
59	NC_020261	TAA	2	6	6039	6044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306374
60	NC_020261	ACA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306374
61	NC_020261	TTG	2	6	6092	6097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306374
62	NC_020261	AAC	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306374
63	NC_020261	TCT	3	9	6199	6207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306374
64	NC_020261	AAT	2	6	6259	6264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306374
65	NC_020261	ATT	2	6	6995	7000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306375
66	NC_020261	ACA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306375
67	NC_020261	TTG	2	6	7082	7087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306375
68	NC_020261	TCA	2	6	7238	7243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306375
69	NC_020261	CGG	2	6	7277	7282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306375
70	NC_020261	TGA	2	6	7421	7426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306376
71	NC_020261	AGC	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306376
72	NC_020261	GTG	2	6	9801	9806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306377
73	NC_020261	GTG	4	12	9810	9821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306377
74	NC_020261	TGC	2	6	9926	9931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306377
75	NC_020261	ATT	2	6	10622	10627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306378
76	NC_020261	GGC	2	6	10766	10771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306379
77	NC_020261	AAT	2	6	10775	10780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306379
78	NC_020261	CAG	2	6	10790	10795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306379
79	NC_020261	ATC	2	6	10806	10811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
80	NC_020261	GCA	2	6	10879	10884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306379
81	NC_020261	GAT	2	6	10892	10897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306379
82	NC_020261	GCA	2	6	10930	10935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306379
83	NC_020261	TCA	2	6	10956	10961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
84	NC_020261	CTG	2	6	11053	11058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306379
85	NC_020261	TCA	2	6	11161	11166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
86	NC_020261	CAA	2	6	11171	11176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306379
87	NC_020261	TCA	2	6	11181	11186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
88	NC_020261	CGG	2	6	11190	11195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306379
89	NC_020261	ACA	2	6	11206	11211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449306379
90	NC_020261	ATC	2	6	11223	11228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
91	NC_020261	TTG	2	6	11259	11264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306379
92	NC_020261	ACC	2	6	11358	11363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
93	NC_020261	CTG	2	6	11483	11488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306379
94	NC_020261	GCC	2	6	11609	11614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306379
95	NC_020261	TGA	2	6	11621	11626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306379
96	NC_020261	TTC	2	6	11924	11929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306379
97	NC_020261	AAT	2	6	11930	11935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306379
98	NC_020261	CCA	2	6	11995	12000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
99	NC_020261	CGT	2	6	12092	12097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306379
100	NC_020261	TGC	2	6	12107	12112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306379
101	NC_020261	CAG	2	6	12155	12160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306379
102	NC_020261	CAG	2	6	12245	12250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306379
103	NC_020261	GTT	2	6	12252	12257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306379
104	NC_020261	GGA	2	6	12268	12273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449306379
105	NC_020261	GCA	3	9	12277	12285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306379
106	NC_020261	GAT	2	6	12289	12294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306379
107	NC_020261	ATG	2	6	12384	12389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306379
108	NC_020261	TGA	2	6	12496	12501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306379
109	NC_020261	CAG	2	6	12503	12508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306379
110	NC_020261	TGA	2	6	12597	12602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306379
111	NC_020261	CTC	2	6	12608	12613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306379
112	NC_020261	ATC	2	6	12636	12641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
113	NC_020261	GGC	2	6	12647	12652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306379
114	NC_020261	CCA	2	6	12655	12660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
115	NC_020261	CCA	2	6	12772	12777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
116	NC_020261	CCA	2	6	12820	12825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
117	NC_020261	GGT	2	6	12896	12901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306379
118	NC_020261	CTG	2	6	12958	12963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306379
119	NC_020261	CAC	2	6	13001	13006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
120	NC_020261	GCC	2	6	13007	13012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306379
121	NC_020261	CGC	2	6	13050	13055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306379
122	NC_020261	TTA	2	6	13134	13139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306379
123	NC_020261	ATC	2	6	13142	13147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
124	NC_020261	ACC	2	6	13211	13216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
125	NC_020261	GAT	2	6	13230	13235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306379
126	NC_020261	CAC	2	6	13316	13321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306379
127	NC_020261	TGG	3	9	13651	13659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306379
128	NC_020261	TAA	2	6	13720	13725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306379
129	NC_020261	CAT	2	6	13814	13819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
130	NC_020261	ATC	2	6	13863	13868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306379
131	NC_020261	GCT	2	6	13904	13909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306380
132	NC_020261	TGT	2	6	13935	13940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306380
133	NC_020261	ACC	2	6	14011	14016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306380
134	NC_020261	TCA	3	9	14107	14115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306380
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137	NC_020261	CAG	2	6	14373	14378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306380
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149	NC_020261	GCA	2	6	15536	15541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306381
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152	NC_020261	GCT	2	6	15862	15867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306382
153	NC_020261	ACC	2	6	15957	15962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306382
154	NC_020261	GAG	2	6	16101	16106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449306382
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158	NC_020261	TGG	2	6	16238	16243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306382
159	NC_020261	GTT	2	6	16438	16443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306382
160	NC_020261	GTT	2	6	16501	16506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306382
161	NC_020261	CAG	2	6	16553	16558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306382
162	NC_020261	ACG	2	6	16571	16576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306382
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164	NC_020261	AGT	2	6	16594	16599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306382
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179	NC_020261	TTC	2	6	17745	17750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306383
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232	NC_020261	TAT	2	6	26437	26442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306389
233	NC_020261	TTC	2	6	26520	26525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306389
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236	NC_020261	CAT	2	6	26665	26670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306389
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239	NC_020261	ATA	2	6	26850	26855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449306389
240	NC_020261	TAC	2	6	27248	27253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306390
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242	NC_020261	GAT	2	6	27300	27305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306390
243	NC_020261	ATG	2	6	27319	27324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306390
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246	NC_020261	CAG	2	6	27796	27801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306390
247	NC_020261	CTT	2	6	28038	28043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306390
248	NC_020261	GCT	3	9	28164	28172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306390
249	NC_020261	GAT	2	6	28311	28316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306390
250	NC_020261	GAT	2	6	28328	28333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306390
251	NC_020261	CGC	2	6	28354	28359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306390
252	NC_020261	CTC	2	6	28360	28365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306390
253	NC_020261	CAG	2	6	28399	28404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306390
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255	NC_020261	TCC	2	6	28526	28531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306390
256	NC_020261	CCT	2	6	28534	28539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306390
257	NC_020261	GCG	2	6	28550	28555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306390
258	NC_020261	AGA	2	6	28568	28573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306390
259	NC_020261	ATT	2	6	28612	28617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306390
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369	NC_020261	GGT	2	6	45345	45350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306414
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372	NC_020261	TGC	2	6	45510	45515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306414
373	NC_020261	TGG	3	9	45533	45541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306414
374	NC_020261	GCA	2	6	46682	46687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306415
375	NC_020261	GAT	2	6	46797	46802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306415
376	NC_020261	CTG	2	6	46866	46871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306415
377	NC_020261	CTG	2	6	46911	46916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306415
378	NC_020261	TTG	2	6	46972	46977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449306415
379	NC_020261	GCT	2	6	47040	47045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306415
380	NC_020261	AGA	2	6	47081	47086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306415
381	NC_020261	CAG	2	6	47145	47150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306415
382	NC_020261	CTG	2	6	47169	47174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306415
383	NC_020261	GGT	2	6	47237	47242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306415
384	NC_020261	GAA	2	6	47246	47251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306415
385	NC_020261	GCA	2	6	47384	47389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306415
386	NC_020261	CGC	2	6	47413	47418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306415
387	NC_020261	TCT	2	6	47483	47488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306415
388	NC_020261	AGC	2	6	47884	47889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306416
389	NC_020261	ACC	2	6	47974	47979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306416
390	NC_020261	GCA	2	6	47980	47985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306416
391	NC_020261	TCT	2	6	49028	49033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306417
392	NC_020261	GTG	2	6	49109	49114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306417
393	NC_020261	CAG	2	6	49216	49221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306417
394	NC_020261	TTC	2	6	49316	49321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306417
395	NC_020261	CAC	2	6	49537	49542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306417
396	NC_020261	CTC	2	6	49552	49557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306417
397	NC_020261	AGC	2	6	49574	49579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306417
398	NC_020261	CGG	2	6	49809	49814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306417
399	NC_020261	CGT	2	6	49851	49856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306417
400	NC_020261	ACT	2	6	50272	50277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306418
401	NC_020261	CTG	2	6	50321	50326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306418
402	NC_020261	CAG	2	6	50338	50343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306418
403	NC_020261	TGA	2	6	50379	50384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306418
404	NC_020261	GGC	2	6	50398	50403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306418
405	NC_020261	AGA	3	9	50435	50443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306419
406	NC_020261	GCG	2	6	50517	50522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306419
407	NC_020261	ATC	2	6	50646	50651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306419
408	NC_020261	CTG	3	9	50969	50977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306420
409	NC_020261	ATT	2	6	50999	51004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306420
410	NC_020261	GCT	2	6	51078	51083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306420
411	NC_020261	TCA	2	6	51094	51099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306420
412	NC_020261	GCA	2	6	51132	51137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306420
413	NC_020261	CAT	2	6	51152	51157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306420
414	NC_020261	CAT	2	6	51197	51202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306420
415	NC_020261	GAT	2	6	51240	51245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306420
416	NC_020261	ATT	2	6	51272	51277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306420
417	NC_020261	CAT	2	6	51332	51337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306420

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.